CEBPB

CEBPB
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1GTW, 1GU4, 1GU5, 1H88, 1H89, 1H8A, 1HJB, 1IO4, 2E42, 2E43
Ідентифікатори
Символи	CEBPB, C/EBP-beta, IL6DBP, NF-IL6, TCF5, CCAAT/enhancer binding protein beta, CCAAT enhancer binding protein beta
Зовнішні ІД	OMIM: 189965 MGI: 88373 HomoloGene: 3807 GeneCards: CEBPB
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • protein homodimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor binding • histone deacetylase binding • chromatin binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • kinase binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • histone acetyltransferase binding • ubiquitin-like protein ligase binding • protein heterodimerization activity • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • glucocorticoid receptor binding Клітинна компонента • цитоплазма • nuclear matrix • CHOP-C/EBP complex • нуклеоплазма • клітинне ядро • condensed chromosome, centromeric region • RNA polymerase II transcription regulator complex Біологічний процес • GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process • mammary gland epithelial cell proliferation • диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to endoplasmic reticulum stress • GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound • embryonic placenta development • пам'ять • positive regulation of interleukin-4 production • response to endoplasmic reticulum stress • mammary gland epithelial cell differentiation • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of T cell proliferation • liver regeneration • positive regulation of osteoblast differentiation • hepatocyte proliferation • response to lipopolysaccharide • regulation of osteoclast differentiation • defense response to bacterium • acute-phase response • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • neuron differentiation • cellular response to interleukin-1 • brown fat cell differentiation • cellular response to amino acid stimulus • ovarian follicle development • liver development • inflammatory response • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of fat cell differentiation • cellular response to lipopolysaccharide • fat cell differentiation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to endoplasmic reticulum stress • transcription by RNA polymerase II • granuloma formation • T-helper 1 cell activation • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of odontoblast differentiation • positive regulation of biomineral tissue development • positive regulation of sodium-dependent phosphate transport • positive regulation of inflammatory response • positive regulation of cold-induced thermogenesis • regulation of dendritic cell differentiation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1051	12608
Ensembl	ENSG00000172216	ENSMUSG00000056501
UniProt	P17676	P28033
RefSeq (мРНК)	NM_005194 NM_001285878 NM_001285879	NM_001287738 NM_001287739 NM_009883
RefSeq (білок)	NP_001272807 NP_001272808 NP_005185	NP_001274667 NP_001274668 NP_034013
Локус (UCSC)	Хр. 20: 50.19 – 50.19 Mb	Хр. 2: 167.53 – 167.53 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CEBPB (англ. CCAAT/enhancer binding protein beta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 345 амінокислот, а молекулярна маса — 36 106.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MQRLVAWDPA		CLPLPPPPPA		FKSMEVANFY		YEADCLAAAY		GGKAAPAAPP
AARPGPRPPA		GELGSIGDHE		RAIDFSPYLE		PLGAPQAPAP		ATATDTFEAA
PPAPAPAPAS		SGQHHDFLSD		LFSDDYGGKN		CKKPAEYGYV		SLGRLGAAKG
ALHPGCFAPL		HPPPPPPPPP		AELKAEPGFE		PADCKRKEEA		GAPGGGAGMA
AGFPYALRAY		LGYQAVPSGS		SGSLSTSSSS		SPPGTPSPAD		AKAPPTACYA
GAAPAPSQVK		SKAKKTVDKH		SDEYKIRRER		NNIAVRKSRD		KAKMRNLETQ
HKVLELTAEN		ERLQKKVEQL		SRELSTLRNL		FKQLPEPLLA		SSGHC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kinoshita S., Akira S., Kishimoto T. (1992). A member of the C/EBP family, NF-IL6 beta, forms a heterodimer and transcriptionally synergizes with NF-IL6. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89: 1473—1476. PMID 1741402 DOI:10.1073/pnas.89.4.1473
• Chinery R., Brockman J.A., Dransfield D.T., Coffey R.J. (1997). Antioxidant-induced nuclear translocation of CCAAT/enhancer-binding protein beta. A critical role for protein kinase A-mediated phosphorylation of Ser299. J. Biol. Chem. 272: 30356—30361. PMID 9374525 DOI:10.1074/jbc.272.48.30356
• Podust L.M., Krezel A.M., Kim Y. (2001). Crystal structure of the CCAAT box/enhancer-binding protein beta activating transcription factor-4 basic leucine zipper heterodimer in the absence of DNA. J. Biol. Chem. 276: 505—513. PMID 11018027 DOI:10.1074/jbc.M005594200
• Buck M., Poli V., Hunter T., Chojkier M. (2001). C/EBPbeta phosphorylation by RSK creates a functional XEXD caspase inhibitory box critical for cell survival. Mol. Cell. 8: 807—816. PMID 11684016 DOI:10.1016/S1097-2765(01)00374-4
• Zhu Y., Saunders M.A., Yeh H., Deng W.G., Wu K.K. (2002). Dynamic regulation of cyclooxygenase-2 promoter activity by isoforms of CCAAT/enhancer-binding proteins. J. Biol. Chem. 277: 6923—6928. PMID 11741938 DOI:10.1074/jbc.M108075200

Див. також

• Хромосома 20