Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
HOXD10
Ідентифікатори
Символи
HOXD10 , HOX4, HOX4D, HOX4E, Hox-4.4, homeobox D10
Зовнішні ІД
OMIM : 142984 MGI: 96202 HomoloGene: 1619 GeneCards: HOXD10
Пов'язані генетичні захворювання
бічний аміотрофічний склероз , rocker bottom foot [1]
Онтологія гена
Молекулярна функція
• sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • chromatin binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • cytoplasmic ribonucleoprotein granule
Біологічний процес
• embryonic skeletal system morphogenesis • forelimb morphogenesis • peripheral nervous system neuron development • skeletal system development • proximal/distal pattern formation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • spinal cord motor neuron cell fate specification • adult locomotory behavior • hindlimb morphogenesis • transcription, DNA-templated • single fertilization • multicellular organism development • neuromuscular process • embryonic limb morphogenesis • регуляція експресії генів • skeletal muscle tissue development • anterior/posterior pattern specification • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 2: 176.11 – 176.12 Mb
Хр. 2: 74.52 – 74.53 Mb
PubMed search
[2]
[3] Вікідані
HOXD10 (англ. Homeobox D10 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 340 амінокислот , а молекулярна маса — 38 411[5] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MSFPNSSPAA NTFLVDSLIS ACRSDSFYSS SASMYMPPPS ADMGTYGMQT
CGLLPSLAKR EVNHQNMGMN VHPYIPQVDS WTDPNRSCRI EQPVTQQVPT
CSFTTNIKEE SNCCMYSDKR NKLISAEVPS YQRLVPESCP VENPEVPVPG
YFRLSQTYAT GKTQEYNNSP EGSSTVMLQL NPRGAAKPQL SAAQLQMEKK
MNEPVSGQEP TKVSQVESPE AKGGLPEERS CLAEVSVSSP EVQEKESKEE
IKSDTPTSNW LTAKSGRKKR CPYTKHQTLE LEKEFLFNMY LTRERRLEIS
KSVNLTDRQV KIWFQNRRMK LKKMSRENRI RELTANLTFS
Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція , регуляція транскрипції .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
Redline R.W., Williams A.J., Patterson P., Collins T. (1992). Human HOX4E: a gene strongly expressed in the adult male and female urogenital tracts. Genomics . 13 : 425—430. PMID 1351871 DOI :10.1016/0888-7543(92)90263-R
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
(0.6) Інші