Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
HOXD12
Ідентифікатори
Символи
HOXD12 , HOX4H, homeobox D12
Зовнішні ІД
OMIM : 142988 MGI: 96204 HomoloGene: 7369 GeneCards: HOXD12
Онтологія гена
Молекулярна функція
• sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• клітинне ядро • transcription regulator complex
Біологічний процес
• pattern specification process • multicellular organism development • skeletal system development • embryonic digit morphogenesis • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 2: 176.1 – 176.1 Mb
Хр. 2: 74.51 – 74.51 Mb
PubMed search
[1]
[2] Вікідані
HOXD12 (англ. Homeobox D12 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 270 амінокислот , а молекулярна маса — 29 031[4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MCERSLYRAG YVGSLLNLQS PDSFYFSNLR PNGGQLAALP PISYPRGALP
WAATPASCAP AQPAGATAFG GFSQPYLAGS GPLGLQPPTA KDGPEEQAKF
YAPEAAAGPE ERGRTRPSFA PESSLAPAVA ALKAAKYDYA GVGRATPGST
TLLQGAPCAP GFKDDTKGPL NLNMTVQAAG VASCLRPSLP DGLPWGAAPG
RARKKRKPYT KQQIAELENE FLVNEFINRQ KRKELSNRLN LSDQQVKIWF
QNRRMKKKRV VLREQALALY
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку .
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція , регуляція транскрипції , поліморфізм, альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
(0.6) Інші