ZEB2

ZEB2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2DA7
Ідентифікатори
Символи	ZEB2, HSPC082, SIP-1, SIP1, SMADIP1, ZFHX1B, zinc finger E-box binding homeobox 2
Зовнішні ІД	OMIM: 605802 MGI: 1344407 HomoloGene: 8868 GeneCards: ZEB2
Пов'язані генетичні захворювання
шизофренія, Рак нирки, Mowat-Wilson syndrome
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • phosphatase regulator activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • R-SMAD binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро • ядерце • гіалоплазма Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • нейробіологія розвитку • transcription, DNA-templated • positive regulation of melanin biosynthetic process • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • neural crest cell migration • somitogenesis • neural tube closure • transcription by RNA polymerase II • central nervous system development • corpus callosum morphogenesis • hippocampus development • cell proliferation in forebrain • corticospinal tract morphogenesis • positive regulation of Wnt signaling pathway • positive regulation of JUN kinase activity • positive regulation of melanocyte differentiation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • developmental pigmentation • embryonic morphogenesis • collateral sprouting • positive regulation of axonogenesis • mammillary axonal complex development • melanocyte migration • positive regulation of lens fiber cell differentiation • regulation of melanosome organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9839	24136
Ensembl	ENSG00000169554	ENSMUSG00000026872
UniProt	O60315	Q9R0G7
RefSeq (мРНК)	NM_001171653 NM_014795	NM_015753 NM_001289521 NM_001355288 NM_001355289 NM_001355290 NM_001355291
RefSeq (білок)	NP_001165124 NP_055610	NP_001276450 NP_056568 NP_001342217 NP_001342218 NP_001342219 NP_001342220
Локус (UCSC)	Хр. 2: 144.36 – 144.52 Mb	Хр. 2: 44.87 – 45.01 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ZEB2 (англ. Zinc finger E-box binding homeobox 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 214 амінокислот, а молекулярна маса — 136 447.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKQPIMADGP		RCKRRKQANP		RRKNVVNYDN		VVDTGSETDE		EDKLHIAEDD
GIANPLDQET		SPASVPNHES		SPHVSQALLP		REEEEDEIRE		GGVEHPWHNN
EILQASVDGP		EEMKEDYDTM		GPEATIQTAI		NNGTVKNANC		TSDFEEYFAK
RKLEERDGHA		VSIEEYLQRS		DTAIIYPEAP		EELSRLGTPE		ANGQEENDLP
PGTPDAFAQL		LTCPYCDRGY		KRLTSLKEHI		KYRHEKNEEN		FSCPLCSYTF
AYRTQLERHM		VTHKPGTDQH		QMLTQGAGNR		KFKCTECGKA		FKYKHHLKEH
LRIHSGEKPY		ECPNCKKRFS		HSGSYSSHIS		SKKCIGLISV		NGRMRNNIKT
GSSPNSVSSS		PTNSAITQLR		NKLENGKPLS		MSEQTGLLKI		KTEPLDFNDY
KVLMATHGFS		GTSPFMNGGL		GATSPLGVHP		SAQSPMQHLG		VGMEAPLLGF
PTMNSNLSEV		QKVLQIVDNT		VSRQKMDCKA		EEISKLKGYH		MKDPCSQPEE
QGVTSPNIPP		VGLPVVSHNG		ATKSIIDYTL		EKVNEAKACL		QSLTTDSRRQ
ISNIKKEKLR		TLIDLVTDDK		MIENHNISTP		FSCQFCKESF		PGPIPLHQHE
RYLCKMNEEI		KAVLQPHENI		VPNKAGVFVD		NKALLLSSVL		SEKGMTSPIN
PYKDHMSVLK		AYYAMNMEPN		SDELLKISIA		VGLPQEFVKE		WFEQRKVYQY
SNSRSPSLER		SSKPLAPNSN		PPTKDSLLPR		SPVKPMDSIT		SPSIAELHNS
VTNCDPPLRL		TKPSHFTNIK		PVEKLDHSRS		NTPSPLNLSS		TSSKNSHSSS
YTPNSFSSEE		LQAEPLDLSL		PKQMKEPKSI		IATKNKTKAS		SISLDHNSVS
SSSENSDEPL		NLTFIKKEFS		NSNNLDNKST		NPVFSMNPFS		AKPLYTALPP
QSAFPPATFM		PPVQTSIPGL		RPYPGLDQMS		FLPHMAYTYP		TGAATFADMQ
QRRKYQRKQG		FQGELLDGAQ		DYMSGLDDMT		DSDSCLSRKK		IKKTESGMYA
CDLCDKTFQK		SSSLLRHKYE		HTGKRPHQCQ		ICKKAFKHKH		HLIEHSRLHS
GEKPYQCDKC		GKRFSHSGSY		SQHMNHRYSY		CKREAEEREA		AEREAREKGH
LEPTELLMNR		AYLQSITPQG		YSDSEERESM		PRDGESEKEH		EKEGEDGYGK
LGRQDGDEEF		EEEEEESENK		SMDTDPETIR		DEEETGDHSM		DDSSEDGKME
TKSDHEEDNM		EDGM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Long J., Zuo D., Park M. (2005). Pc2-mediated sumoylation of Smad-interacting protein 1 attenuates transcriptional repression of E-cadherin. J. Biol. Chem. 280: 35477—35489. PMID 16061479 DOI:10.1074/jbc.M504477200
• Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Див. також

• Хромосома 2