Інтегрин, ізоформа бета-1

Інтегрин, ізоформа бета-1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4WK4, 3G9W, 3T9K, 3VI3, 3VI4, 4DX9, 4WJK, 4WK0, 4WK2
Ідентифікатори
Символи	ITGB1, CD29, FNRB, GPIIA, MDF2, MSK12, VLA-BETA, VLAB, integrin subunit beta 1
Зовнішні ІД	OMIM: 135630 MGI: 96610 HomoloGene: 22999 GeneCards: ITGB1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• virus receptor activity; • зв'язування з іоном металу; • integrin binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • laminin binding; • cell adhesion molecule binding; • collagen binding involved in cell-matrix adhesion; • coreceptor activity; • protease binding; • fibronectin binding; • actin binding; • C-X3-C chemokine binding; • protein heterodimerization activity; • GO:0032403 protein-containing complex binding; • cadherin binding; • signaling receptor activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • ендосома; • мембрана; • Меланосома; • ruffle; • integrin alpha8-beta1 complex; • синапс; • ruffle membrane; • integrin complex; • perinuclear region of cytoplasm; • cell projection; • dendritic spine; • cell surface; • Борозна розщеплення; • integrin alpha7-beta1 complex; • екзосома; • lamellipodium; • integral component of membrane; • recycling endosome; • integrin alpha1-beta1 complex; • intercalated disc; • Філоподія; • neuromuscular junction; • receptor complex; • клітинна мембрана; • integrin alpha11-beta1 complex; • myelin sheath abaxonal region; • synaptic membrane; • integrin alpha10-beta1 complex; • міжклітинні контакти; • integrin alpha2-beta1 complex; • Сарколема; • external side of plasma membrane; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • integrin alpha3-beta1 complex; • membrane raft; • focal adhesion; • glial cell projection; • Schaffer collateral - CA1 synapse; • glutamatergic synapse; • integral component of synaptic membrane; • GO:0009327 protein-containing complex;
Біологічний процес	• leukocyte cell-cell adhesion; • cell migration involved in sprouting angiogenesis; • stress fiber assembly; • viral entry into host cell; • B cell differentiation; • neuron projection development; • transforming growth factor beta receptor signaling pathway; • regulation of collagen catabolic process; • negative regulation of cell differentiation; • cardiac muscle cell differentiation; • cellular response to low-density lipoprotein particle stimulus; • in utero embryonic development; • cell-substrate adhesion; • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity; • regulation of immune response; • GO:0022415 viral process; • dendrite morphogenesis; • cell fate specification; • G1 phase; • heterotypic cell-cell adhesion; • extracellular matrix organization; • cell-cell adhesion mediated by integrin; • cellular defense response; • адгезія клітин; • formation of radial glial scaffolds; • axon extension; • leukocyte tethering or rolling; • integrin-mediated signaling pathway; • cell-matrix adhesion; • sarcomere organization; • negative regulation of anoikis; • leukocyte migration; • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules; • visual learning; • calcium-independent cell-matrix adhesion; • cardiac muscle tissue development; • negative regulation of Rho protein signal transduction; • receptor internalization; • regulation of cell cycle; • positive regulation of cell population proliferation; • positive regulation of apoptotic process; • mesodermal cell differentiation; • cell migration; • germ cell migration; • cell adhesion mediated by integrin; • basement membrane organization; • positive regulation of protein localization to plasma membrane; • G1/S transition of mitotic cell cycle; • Фагоцитоз; • cytokine-mediated signaling pathway; • cell projection organization; • lamellipodium assembly; • positive regulation of angiogenesis; • modulation of chemical synaptic transmission; • positive regulation of protein kinase B signaling; • positive regulation of signaling receptor activity; • positive regulation of cell migration;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	3688
	16412
	ENSG00000150093
	ENSMUSG00000025809
	P05556
	P09055
NM_002211; NM_033666; NM_033667; NM_033668; NM_033669;
	NM_133376
	NM_010578
	NP_002202; NP_391988; NP_596867
	NP_034708
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

Інтегрин, ізоформа бета-1 (англ. Integrin subunit beta 1) – білок, який кодується геном ITGB1, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 798 амінокислот, а молекулярна маса — 88 415^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNLQPIFWIG	LISSVCCVFA	QTDENRCLKA	NAKSCGECIQ	AGPNCGWCTN
STFLQEGMPT	SARCDDLEAL	KKKGCPPDDI	ENPRGSKDIK	KNKNVTNRSK
GTAEKLKPED	ITQIQPQQLV	LRLRSGEPQT	FTLKFKRAED	YPIDLYYLMD
LSYSMKDDLE	NVKSLGTDLM	NEMRRITSDF	RIGFGSFVEK	TVMPYISTTP
AKLRNPCTSE	QNCTSPFSYK	NVLSLTNKGE	VFNELVGKQR	ISGNLDSPEG
GFDAIMQVAV	CGSLIGWRNV	TRLLVFSTDA	GFHFAGDGKL	GGIVLPNDGQ
CHLENNMYTM	SHYYDYPSIA	HLVQKLSENN	IQTIFAVTEE	FQPVYKELKN
LIPKSAVGTL	SANSSNVIQL	IIDAYNSLSS	EVILENGKLS	EGVTISYKSY
CKNGVNGTGE	NGRKCSNISI	GDEVQFEISI	TSNKCPKKDS	DSFKIRPLGF
TEEVEVILQY	ICECECQSEG	IPESPKCHEG	NGTFECGACR	CNEGRVGRHC
ECSTDEVNSE	DMDAYCRKEN	SSEICSNNGE	CVCGQCVCRK	RDNTNEIYSG
KFCECDNFNC	DRSNGLICGG	NGVCKCRVCE	CNPNYTGSAC	DCSLDTSTCE
ASNGQICNGR	GICECGVCKC	TDPKFQGQTC	EMCQTCLGVC	AEHKECVQCR
AFNKGEKKDT	CTQECSYFNI	TKVESRDKLP	QPVQPDPVSH	CKEKDVDDCW
FYFTYSVNGN	NEVMVHVVEN	PECPTGPDII	PIVAGVVAGI	VLIGLALLLI
WKLLMIIHDR	REFAKFEKEK	MNAKWDTGEN	PIYKSAVTTV	VNPKYEGK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Цей білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів, інтегринів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, взаємодія хазяїн-вірус. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, іоном магнію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, ендосомах.

Література[ред. | ред. код]

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Zhidkova N.I., Belkin A.M., Mayne R. (1995). Novel isoform of beta 1 integrin expressed in skeletal and cardiac muscle. Biochem. Biophys. Res. Commun. 214: 279—285. PMID 7545396 DOI:10.1006/bbrc.1995.2285
van der Flier A., Kuikman I., Baudoin C., van der Neut R., Sonnenberg A. (1995). A novel beta 1 integrin isoform produced by alternative splicing: unique expression in cardiac and skeletal muscle. FEBS Lett. 369: 340—344. PMID 7544298 DOI:10.1016/0014-5793(95)00814-P
Svineng G., Faessler R., Johansson S. (1998). Identification of beta1C-2, a novel variant of the integrin beta1 subunit generated by utilization of an alternative splice acceptor site in exon C. Biochem. J. 330: 1255—1263. PMID 9494094 DOI:10.1042/bj3301255
Lin Q., Keller R.S., Weaver B., Zisman L.S. (2004). Interaction of ACE2 and integrin beta1 in failing human heart. Biochim. Biophys. Acta. 1689: 175—178. PMID 15276642 DOI:10.1016/j.bbadis.2004.05.005
Sasaki T., Brakebusch C., Engel J., Timpl R. (1998). Mac-2 binding protein is a cell-adhesive protein of the extracellular matrix which self-assembles into ring-like structures and binds beta1 integrins, collagens and fibronectin. EMBO J. 17: 1606—1613. PMID 9501082 DOI:10.1093/emboj/17.6.1606