CD1D

CD1D
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4WO4, 1ZT4, 2PO6, 3HUJ, 3SDX, 3TZV, 3U0P, 3VWJ, 3VWK, 4EN3, 4LHU, 4MNG, 4MQ7, 4WW2
Ідентифікатори
Символи	CD1D, CD1A, R3, R3G1, CD1d molecule
Зовнішні ІД	OMIM: 188410 MGI: 107674 HomoloGene: 1337 GeneCards: CD1D
Онтологія гена Молекулярна функція • beta-2-microglobulin binding • ліпопептидний зв'язок • GO:0031493 histone binding • endogenous lipid antigen binding • lipid antigen binding • exogenous lipid antigen binding • cell adhesion molecule binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • integral component of membrane • ендосома • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • integral component of plasma membrane • cell surface • lysosomal membrane • basolateral plasma membrane • лізосома • endosome membrane • клітинна мембрана • ендоплазматичний ретикулум • міжклітинний простір • external side of plasma membrane Біологічний процес • процес імунної системи • T cell selection • heterotypic cell-cell adhesion • positive regulation of T cell proliferation • detection of bacterium • positive regulation of innate immune response • antigen processing and presentation, exogenous lipid antigen via MHC class Ib • вроджений імунітет • GO:0022415 viral process • antigen processing and presentation, endogenous lipid antigen via MHC class Ib • regulation of immune response • positive regulation of T cell mediated cytotoxicity • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	912	12479
Ensembl	ENSG00000158473	ENSMUSG00000028076
UniProt	P15813	P11609
RefSeq (мРНК)	NM_001766 NM_001319145 NM_001371761 NM_001371762 NM_001371763	NM_007639 NM_001379501 NM_001379502 NM_001379503
RefSeq (білок)	NP_001306074 NP_001757 NP_001358690 NP_001358691 NP_001358692	NP_031665 NP_001366430 NP_001366431 NP_001366432
Локус (UCSC)	Хр. 1: 158.18 – 158.19 Mb	Хр. 3: 86.9 – 86.91 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CD1D (англ. CD1d molecule) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 335 амінокислот, а молекулярна маса — 37 717.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGCLLFLLLW		ALLQAWGSAE		VPQRLFPLRC		LQISSFANSS		WTRTDGLAWL
GELQTHSWSN		DSDTVRSLKP		WSQGTFSDQQ		WETLQHIFRV		YRSSFTRDVK
EFAKMLRLSY		PLELQVSAGC		EVHPGNASNN		FFHVAFQGKD		ILSFQGTSWE
PTQEAPLWVN		LAIQVLNQDK		WTRETVQWLL		NGTCPQFVSG		LLESGKSELK
KQVKPKAWLS		RGPSPGPGRL		LLVCHVSGFY		PKPVWVKWMR		GEQEQQGTQP
GDILPNADET		WYLRATLDVV		AGEAAGLSCR		VKHSSLEGQD		IVLYWGGSYT
SMGLIALAVL		ACLLFLLIVG		FTSRFKRQTS		YQGVL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, лізосомі, ендосомах.

Література

• Calabi F., Jarvis J.M., Martin L., Milstein C. (1989). Two classes of CD1 genes. Eur. J. Immunol. 19: 285—292. PMID 2467814 DOI:10.1002/eji.1830190211
• Balk S.P., Bleicher P.A., Terhorst C. (1989). Isolation and characterization of a cDNA and gene coding for a fourth CD1 molecule. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86: 252—256. PMID 2463622 DOI:10.1073/pnas.86.1.252
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Han M., Hannick L.I., DiBrino M., Robinson M.A. (1999). Polymorphism of human CD1 genes. Tissue Antigens. 54: 122—127. PMID 10488738 DOI:10.1034/j.1399-0039.1999.540202.x
• Martin L.H., Calabi F., Milstein C. (1986). Isolation of CD1 genes: a family of major histocompatibility complex-related differentiation antigens. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 83: 9154—9158. PMID 3097645 DOI:10.1073/pnas.83.23.9154
• Kang S.-J., Cresswell P. (2002). Regulation of intracellular trafficking of human CD1d by association with MHC class II molecules. EMBO J. 21: 1650—1660. PMID 11927549 DOI:10.1093/emboj/21.7.1650

Див. також

• Хромосома 1