NECTIN1

NECTIN1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3ALP, 3SKU, 3U83, 4FMF, 4MYW
Ідентифікатори
Символи	NECTIN1, CD111, CLPED1, ED4, HIgR, HV1S, HVEC, OFC7, PRR, PRR1, PVRR, PVRR1, SK-12, nectin-1, PVRL1, nectin cell adhesion molecule 1
Зовнішні ІД	OMIM: 600644 MGI: 1926483 HomoloGene: 2138 GeneCards: NECTIN1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein homodimerization activity; • coreceptor activity; • virus receptor activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • protein heterodimerization activity; • virion binding; • signaling receptor binding; • carbohydrate binding; • cell adhesion molecule binding; • identical protein binding; • signaling receptor activity;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • мембрана; • внутрішньоклітинна мембранна органела; • клітинна мембрана; • growth cone membrane; • синапс; • integral component of plasma membrane; • extracellular region; • аксон; • міжклітинні контакти; • neuron projection; • catenin complex; • presynaptic membrane; • apical junction complex; • cell-cell contact zone; • cell-cell junction; • Адгезивні контакти; • дендрит (нейробіологія); • hippocampal mossy fiber to CA3 synapse; • integral component of presynaptic active zone membrane;
Біологічний процес	• heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules; • cell recognition; • desmosome organization; • regulation of synapse assembly; • axon guidance; • адгезія клітин; • iron ion transport; • lens morphogenesis in camera-type eye; • retina development in camera-type eye; • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь; • viral entry into host cell; • enamel mineralization; • GO:0022415 viral process; • adherens junction organization; • camera-type eye morphogenesis; • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • protein localization to cell junction; • cell-cell adhesion; • virion attachment to host cell;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	5818
	58235
	ENSG00000110400
	ENSMUSG00000032012
	Q15223
	Q9JKF6
	NM_203286; NM_002855; NM_032767; NM_203285
	NM_021424
	NP_002846; NP_976030; NP_976031
	NP_067399
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

NECTIN1 (англ. Nectin cell adhesion molecule 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 517 амінокислот, а молекулярна маса — 57 158^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MARMGLAGAA	GRWWGLALGL	TAFFLPGVHS	QVVQVNDSMY	GFIGTDVVLH
CSFANPLPSV	KITQVTWQKS	TNGSKQNVAI	YNPSMGVSVL	APYRERVEFL
RPSFTDGTIR	LSRLELEDEG	VYICEFATFP	TGNRESQLNL	TVMAKPTNWI
EGTQAVLRAK	KGQDDKVLVA	TCTSANGKPP	SVVSWETRLK	GEAEYQEIRN
PNGTVTVISR	YRLVPSREAH	QQSLACIVNY	HMDRFKESLT	LNVQYEPEVT
IEGFDGNWYL	QRMDVKLTCK	ADANPPATEY	HWTTLNGSLP	KGVEAQNRTL
FFKGPINYSL	AGTYICEATN	PIGTRSGQVE	VNITEFPYTP	SPPEHGRRAG
PVPTAIIGGV	AGSILLVLIV	VGGIVVALRR	RRHTFKGDYS	TKKHVYGNGY
SKAGIPQHHP	PMAQNLQYPD	DSDDEKKAGP	LGGSSYEEEE	EEEEGGGGGE
RKVGGPHPKY	DEDAKRPYFT	VDEAEARQDG	YGDRTLGYQY	DPEQLDLAEN
MVSQNDGSFI	SKKEWYV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, взаємодія хазяїн-вірус, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах. Також секретований назовні.

Література[ред. | ред. код]

Geraghty R.J., Krummenacher C., Cohen G.H., Eisenberg R.J., Spear P.G. (1998). Entry of alphaherpesviruses mediated by poliovirus receptor-related protein 1 and poliovirus receptor. Science. 280: 1618—1620. PMID 9616127 DOI:10.1126/science.280.5369.1618
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки[ред. | ред. код]

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9706 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q15223 (англ.) . Архів оригіналу за 16 травня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також[ред. | ред. код]

Хромосома 11

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9706 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 8 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q15223 (англ.) . Архів оригіналу за 16 травня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

NECTIN1

Література[ред. | ред. код]

Примітки[ред. | ред. код]

Див. також[ред. | ред. код]

Навігаційне меню

Пошук