CDH1

CDH1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1O6S, 2O72, 2OMT, 2OMU, 2OMV, 2OMX, 2OMY, 2OMZ, 3FF7, 3FF8, 3L6X, 3L6Y, 4ZT1, 4ZTE
Ідентифікатори
Символи	CDH1, Arc-1, CD324, CDHE, ECAD, LCAM, UVO, cadherin 1, BCDS1, E-cadherin, uvomorulin
Зовнішні ІД	OMIM: 192090 MGI: 88354 HomoloGene: 20917 GeneCards: CDH1
Пов'язані генетичні захворювання
колоректальний рак, Blepharo-cheilo-odontic syndrome, hereditary diffuse gastric cancer
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ankyrin binding • gamma-catenin binding • beta-catenin binding • GTPase activating protein binding • зв'язування з іоном металу • cell adhesion molecule binding • cadherin binding • identical protein binding • cytoskeletal protein binding • protein homodimerization activity Клітинна компонента • apical junction complex • trans-Golgi network • extracellular region • perinuclear region of cytoplasm • cortical actin cytoskeleton • комплекс Ґольджі • lamellipodium • cytoplasmic side of plasma membrane • ендосома • lateral plasma membrane • catenin complex • actin cytoskeleton • flotillin complex • мембрана • екзосома • integral component of membrane • міжклітинні контакти • цитоплазма • клітинна мембрана • cell surface • postsynapse • glutamatergic synapse Біологічний процес • negative regulation of cell-cell adhesion • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • cellular response to lithium ion • адгезія клітин • extracellular matrix organization • cellular response to indole-3-methanol • extracellular matrix disassembly • synapse assembly • pituitary gland development • response to toxic substance • response to organic substance • neuron projection development • adherens junction organization • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • entry of bacterium into host cell • protein localization to plasma membrane • cell-cell adhesion • GO:0000767 cell morphogenesis • cell-cell junction assembly • регуляція експресії генів • calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • negative regulation of cell migration • positive regulation of protein import into nucleus • cell-cell adhesion mediated by cadherin • regulation of protein catabolic process at postsynapse, modulating synaptic transmission Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	999	12550
Ensembl	ENSG00000039068	ENSMUSG00000000303
UniProt	P12830	P09803
RefSeq (мРНК)	NM_004360 NM_001317184 NM_001317185 NM_001317186	NM_009864
RefSeq (білок)	NP_001304113 NP_001304114 NP_001304115 NP_004351	NP_033994
Локус (UCSC)	Хр. 16: 68.74 – 68.84 Mb	Хр. 8: 107.33 – 107.4 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CDH1 (англ. Cadherin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 882 амінокислот, а молекулярна маса — 97 456.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGPWSRSLSA		LLLLLQVSSW		LCQEPEPCHP		GFDAESYTFT		VPRRHLERGR
VLGRVNFEDC		TGRQRTAYFS		LDTRFKVGTD		GVITVKRPLR		FHNPQIHFLV
YAWDSTYRKF		STKVTLNTVG		HHHRPPPHQA		SVSGIQAELL		TFPNSSPGLR
RQKRDWVIPP		ISCPENEKGP		FPKNLVQIKS		NKDKEGKVFY		SITGQGADTP
PVGVFIIERE		TGWLKVTEPL		DRERIATYTL		FSHAVSSNGN		AVEDPMEILI
TVTDQNDNKP		EFTQEVFKGS		VMEGALPGTS		VMEVTATDAD		DDVNTYNAAI
AYTILSQDPE		LPDKNMFTIN		RNTGVISVVT		TGLDRESFPT		YTLVVQAADL
QGEGLSTTAT		AVITVTDTND		NPPIFNPTTY		KGQVPENEAN		VVITTLKVTD
ADAPNTPAWE		AVYTILNDDG		GQFVVTTNPV		NNDGILKTAK		GLDFEAKQQY
ILHVAVTNVV		PFEVSLTTST		ATVTVDVLDV		NEAPIFVPPE		KRVEVSEDFG
VGQEITSYTA		QEPDTFMEQK		ITYRIWRDTA		NWLEINPDTG		AISTRAELDR
EDFEHVKNST		YTALIIATDN		GSPVATGTGT		LLLILSDVND		NAPIPEPRTI
FFCERNPKPQ		VINIIDADLP		PNTSPFTAEL		THGASANWTI		QYNDPTQESI
ILKPKMALEV		GDYKINLKLM		DNQNKDQVTT		LEVSVCDCEG		AAGVCRKAQP
VEAGLQIPAI		LGILGGILAL		LILILLLLLF		LRRRAVVKEP		LLPPEDDTRD
NVYYYDEEGG		GEEDQDFDLS		QLHRGLDARP		EVTRNDVAPT		LMSVPRYLPR
PANPDEIGNF		IDENLKAADT		DPTAPPYDSL		LVFDYEGSGS		EAASLSSLNS
SESDKDQDYD		YLNEWGNRFK		KLADMYGGGE		DD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, апараті гольджі, ендосомах.

Література

• Bussemakers M.J.G., Mees S.G.M., van Bokhoven A., Debruyne F.M.J., Schalken J.A. (1993). Molecular cloning and characterization of the human E-cadherin cDNA. Mol. Biol. Rep. 17: 123—128. PMID 8459805 DOI:10.1007/BF00996219
• Rimm D.L., Morrow J.S. (1994). Molecular cloning of human E-cadherin suggests a novel subdivision of the cadherin superfamily. Biochem. Biophys. Res. Commun. 200: 1754—1761. PMID 8185635 DOI:10.1006/bbrc.1994.1656
• Bussemakers M.J.G., Giroldi L.A., van Bokhoven A., Schalken J.A. (1994). Transcriptional regulation of the human E-cadherin gene in human prostate cancer cell lines: characterization of the human E-cadherin gene promoter. Biochem. Biophys. Res. Commun. 203: 1284—1290. PMID 8093045 DOI:10.1006/bbrc.1994.2321
• Mansouri A., Spurr N., Goodfellow P.N., Kemler R. (1988). Characterization and chromosomal localization of the gene encoding the human cell adhesion molecule uvomorulin. Differentiation. 38: 67—71. PMID 3263290 DOI:10.1111/j.1432-0436.1988.tb00593.x
• Ozawa M., Ringwald M., Kemler R. (1990). Uvomorulin-catenin complex formation is regulated by a specific domain in the cytoplasmic region of the cell adhesion molecule. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87: 4246—4250. PMID 2349235 DOI:10.1073/pnas.87.11.4246
• Butz S., Kemler R. (1994). Distinct cadherin-catenin complexes in Ca(2+)-dependent cell-cell adhesion. FEBS Lett. 355: 195—200. PMID 7982500 DOI:10.1016/0014-5793(94)01205-9

Див. також

• Хромосома 16