F11R

F11R
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1NBQ, 3EOY, 3TSZ, 4ODB
Ідентифікатори
Символи	F11R, F11r, 9130004G24, AA638916, ESTM33, JAM, JAM-1, JAM-A, Jcam, Jcam1, Ly106, CD321, JAM1, JAMA, KAT, PAM-1, F11 receptor
Зовнішні ІД	OMIM: 605721 MGI: 1321398 HomoloGene: 14255 GeneCards: F11R
Онтологія гена Молекулярна функція • PDZ domain binding • virus receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cadherin binding Клітинна компонента • integral component of membrane • мембрана • cell-cell junction • bicellular tight junction • клітинна мембрана • slit diaphragm • екзосома • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • міжклітинні контакти Біологічний процес • regulation of actin cytoskeleton reorganization • диференціація клітин • establishment of endothelial intestinal barrier • epithelial cell differentiation • actomyosin structure organization • extracellular matrix organization • regulation of membrane permeability • GO:0032657 regulation of cytokine production • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • positive regulation of blood pressure • адгезія клітин • GO:0034259 negative regulation of GTPase activity • bicellular tight junction assembly • viral entry into host cell • intestinal absorption • response to radiation • inflammatory response • GO:0022415 viral process • transforming growth factor beta receptor signaling pathway • leukocyte migration • protein localization to plasma membrane Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	50848	16456
Ensembl	ENSG00000158769	ENSMUSG00000038235
UniProt	Q9Y624	O88792
RefSeq (мРНК)	NM_016946 NM_144501 NM_144502 NM_144503 NM_144504 NM_001348091 NM_001382727 NM_001382730 NM_001382733 NM_001382734	NM_172647
RefSeq (білок)	NP_058642 NP_001335020 NP_001369656 NP_001369659 NP_001369662 NP_001369663	NP_766235
Локус (UCSC)	Хр. 1: 161 – 161.02 Mb	Хр. 1: 171.27 – 171.29 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

F11R (англ. F11 receptor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 299 амінокислот, а молекулярна маса — 32 583.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGTKAQVERK		LLCLFILAIL		LCSLALGSVT		VHSSEPEVRI		PENNPVKLSC
AYSGFSSPRV		EWKFDQGDTT		RLVCYNNKIT		ASYEDRVTFL		PTGITFKSVT
REDTGTYTCM		VSEEGGNSYG		EVKVKLIVLV		PPSKPTVNIP		SSATIGNRAV
LTCSEQDGSP		PSEYTWFKDG		IVMPTNPKST		RAFSNSSYVL		NPTTGELVFD
PLSASDTGEY		SCEARNGYGT		PMTSNAVRME		AVERNVGVIV		AAVLVTLILL
GILVFGIWFA		YSRGHFDRTK		KGTSSKKVIY		SQPSARSEGE		FKQTSSFLV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, щільних контактах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Naik U.P., Ehrlich Y.H., Kornecki E. (1995). Mechanisms of platelet activation by a stimulatory antibody: cross-linking of a novel platelet receptor for monoclonal antibody F11 with the Fc gamma RII receptor. Biochem. J. 310: 155—162. PMID 7646439 DOI:10.1042/bj3100155
• Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504
• Ostermann G., Weber K.S., Zernecke A., Schroeder A., Weber C. (2002). JAM-1 is a ligand of the beta(2) integrin LFA-1 involved in transendothelial migration of leukocytes. Nat. Immunol. 3: 151—158. PMID 11812992 DOI:10.1038/ni755
• Muller W.A. (2003). Leukocyte-endothelial-cell interactions in leukocyte transmigration and the inflammatory response. Trends Immunol. 24: 327—334. PMID 12810109 DOI:10.1016/S1471-4906(03)00117-0
• Fraemohs L., Koenen R.R., Ostermann G., Heinemann B., Weber C. (2004). The functional interaction of the beta 2 integrin lymphocyte function-associated antigen-1 with junctional adhesion molecule-A is mediated by the I domain. J. Immunol. 173: 6259—6264. PMID 15528364 DOI:10.4049/jimmunol.173.10.6259

Див. також

• Хромосома 1