CLEC4M

CLEC4M
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1K9J, 1SL6, 1XAR, 1XPH, 3JQH
Ідентифікатори
Символи	CLEC4M, CD209L, CD299, DC-SIGN2, DC-SIGNR, DCSIGNR, HP10347, L-SIGN, LSIGN, C-type lectin domain family 4 member M
Зовнішні ІД	OMIM: 605872 MGI: 2157942 HomoloGene: 129771 GeneCards: CLEC4M
Онтологія гена Молекулярна функція • peptide antigen binding • virus receptor activity • зв'язування з іоном металу • calcium-dependent protein binding • mannose binding • virion binding • ICAM-3 receptor activity • carbohydrate binding • signaling receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • extracellular region • host cell Біологічний процес • leukocyte cell-cell adhesion • cell-cell recognition • GO:0046795 intracellular transport of virus • GO:0007243 intracellular signal transduction • antigen processing and presentation • ендоцитоз • адаптивна імунна відповідь • процес імунної системи • viral genome replication • peptide antigen transport • modulation by virus of host process • вроджений імунітет • GO:0022415 viral process • virion attachment to host cell • viral entry into host cell Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10332	170786
Ensembl	ENSG00000104938	ENSMUSG00000031494
UniProt	Q9H2X3	Q91ZX1
RefSeq (мРНК)	NM_001144904 NM_001144905 NM_001144906 NM_001144907 NM_001144908 NM_001144909 NM_001144910 NM_001144911 NM_014257 NM_214675 NM_214676	NM_133238
RefSeq (білок)	NP_001138376 NP_001138377 NP_001138378 NP_001138379 NP_001138380 NP_001138381 NP_001138382 NP_001138383 NP_055072	NP_573501
Локус (UCSC)	Хр. 19: 7.76 – 7.77 Mb	Хр. 8: 3.79 – 3.8 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CLEC4M (англ. C-type lectin domain family 4 member M) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 399 амінокислот, а молекулярна маса — 45 350.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSDSKEPRVQ		QLGLLEEDPT		TSGIRLFPRD		FQFQQIHGHK		SSTGCLGHGA
LVLQLLSFML		LAGVLVAILV		QVSKVPSSLS		QEQSEQDAIY		QNLTQLKAAV
GELSEKSKLQ		EIYQELTQLK		AAVGELPEKS		KLQEIYQELT		RLKAAVGELP
EKSKLQEIYQ		ELTRLKAAVG		ELPEKSKLQE		IYQELTRLKA		AVGELPEKSK
LQEIYQELTE		LKAAVGELPE		KSKLQEIYQE		LTQLKAAVGE		LPDQSKQQQI
YQELTDLKTA		FERLCRHCPK		DWTFFQGNCY		FMSNSQRNWH		DSVTACQEVR
AQLVVIKTAE		EQNFLQLQTS		RSNRFSWMGL		SDLNQEGTWQ		WVDGSPLSPS
FQRYWNSGEP		NNSGNEDCAE		FSGSGWNDNR		CDVDNYWICK		KPAACFRDE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як адаптивний імунітет, імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, ендоцитоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, лектинами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

• Yokoyama-Kobayashi M., Yamaguchi T., Sekine S., Kato S. (1999). Selection of cDNAs encoding putative type II membrane proteins on the cell surface from a human full-length cDNA bank. Gene. 228: 161—167. PMID 10072769 DOI:10.1016/S0378-1119(99)00004-9
• Soilleux E.J., Barten R., Trowsdale J. (2000). DC-SIGN, a related gene, DC-SIGNR, and CD23 form a cluster on 19p13. J. Immunol. 165: 2937—2942. PMID 10975799 DOI:10.4049/jimmunol.165.6.2937
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Mitchell D.A., Fadden A.J., Drickamer K. (2001). A novel mechanism of carbohydrate recognition by the C-type lectins DC-SIGN and DC-SIGNR. Subunit organization and binding to multivalent ligands. J. Biol. Chem. 276: 28939—28945. PMID 11384997 DOI:10.1074/jbc.M104565200
• Jeffers S.A., Hemmila E.M., Holmes K.V. (2006). Human coronavirus 229E can use CD209L (L-SIGN) to enter cells. Adv. Exp. Med. Biol. 581: 265—269. PMID 17037540 DOI:10.1007/978-0-387-33012-9_44
• da Silva R.C., Segat L., Crovella S. (2011). Role of DC-SIGN and L-SIGN receptors in HIV-1 vertical transmission. Hum. Immunol. 72: 305—311. PMID 21277928 DOI:10.1016/j.humimm.2011.01.012

Див. також

• Хромосома 19