Народився 24 лютого1997 року в місті Фос-ду-Ігуасу. Вихованець однойменної футбольної школи. Дорослу футбольну кар'єру розпочав 2015 року в складі «Фос-ду-Ігуасу», в якій провів два сезони, взявши участь у 5 матчах бразильської Серії D.
4 квітня 2016 року Пепе приєднався до команди вищого дивізіону «Греміо». 28 травня 2017 року дебютував у бразильській Серії A, вийшовши на заміну замість Евертона Соареса в матчі проти «Спорт Ресіфі». 3 грудня 2017 року забив свій перший гол за «Греміо» у матчі проти «Атлетіко Мінейро». Його клуб також виграв Кубок Лібертадорес у 2017 році, при цьому Пепе не брав участі в жодному матчі. Проте він зіграв кілька матчів протягом двох наступних сезонів, де «Греміо» обидва рази дійшов до півфіналу. Загалом відіграв за команду з Порту-Алегрі чотири сезони своєї ігрової кар'єри. Більшість часу, проведеного у складі «Греміо», був основним гравцем атакувальної ланки команди.
18 лютого 2021 року Пепе підписав контракт із португальським клубом «Порту», який набув чинності з 1 липня[1]. Він дебютував 8 серпня, замінивши Мегді Таремі на останні вісім хвилин домашньої гри проти «Белененсеша САД» (2:0) і забив свій перший гол 19 вересня у ворота «Морейренсі» (5:0)[2]. Його перший сезон завершився здобуттям «золотого дубля», а наступного року Пепе виграв з командою ще один національний кубок, а також Кубок ліги. Станом на 13 вересня 2023 року відіграв за клуб з Порту 66 матчів в національному чемпіонаті.
Бразилія
«Порту»
