Нікі Бакоянні народилася 9 червня1968 року у Ламії. У 1985 році Нікі посіла чотирнадцяте місце (1, 75 м) на чемпіонаті Європи серед юніорів у Коттбусі. Наступного року Бакоянні стала п'ятою на чемпіонаті світу серед юніорів. На чемпіонаті Європи у приміщенні (1996) спортсменка з національним рекордом (1, 96 м) стала другою. Того ж року на Олімпійських іграх Нікі знову встановила національний рекорд та отримала срібну медаль.