ChEBI
Хімічні Об'єкти Біологічного Інтересу, також знана як ChEBI(англ. Chemical Entities of Biological Interest),[1] являє собою базу даних і онтологія з молекулярних індивідів орієнтованої на "малі" хімічні речовини, яка що є частиною зусиль Відкритої Біологічної Онтології. Термін «молекулярна сутність» означає будь-яку «конституційну або ізотопну відмінність атома, молекули, йона, йонної пари, радикалу, йон-радикалу, комплексу, конформера і т. д. які ідентифікують як окремо відокремлюваний суб'єкт».[2] Молекулярні сутності, які розглядаються, є або природними продуктами, або синтетичними речовинами, які мають потенційні біологічні активності. Молекули, які прямо закодовані в геномі, наприклад нуклеїнові кислоти, білки і пептиди, які отримано з білків шляхом протеолітичного розщеплення, як правило, не включені до ChEBI.
ChEBI використовує номенклатуру, символіку і термінологію, схваленої міжнародним Союзом теоретичної і прикладної хімії (ІЮПАК) та Комітетом Номенклатури Міжнародного Союзу Біохімії і Молекулярної Біології[en] (NC-IUBMB).
Всі дані у базі даних є не приватними або походять із не патентованих джерел. Таким чином всі дані у вільному доступі і доступні кожному. Крім того, кожен елемент даних повністю простежується і явно посилається на оригінальне джерело.
Дані ChEBI доступні через вебінтерфейс, вебсервісів і для завантажень.
- ↑ Degtyarenko, K.; De Matos, P.; Ennis, M.; Hastings, J.; Zbinden, M.; McNaught, A.; Alcantara, R.; Darsow, M. та ін. (2007). ChEBI: A database and ontology for chemical entities of biological interest. Nucleic Acids Research. 36 (Database issue): D344—50. doi:10.1093/nar/gkm791. PMC 2238832. PMID 17932057.
- ↑ IUPAC, Compendium of Chemical Terminology, 2nd ed. (the "Gold Book") (1997). Редагована онлайн версія: (2006–) "molecular entity". DOI:10.1351/goldbook.M03986 (англ.)
- http://www.ebi.ac.uk/chebi/ [Архівовано 27 травня 2010 у Wayback Machine.]
- ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/chebi/