Прапор Нігерії створено на основі проєкту, який переміг у конкурсі, проведеному 1959 року. Оригінальний варіант містив також зображення червоного променистого сонця, розташованого на верхній частині білої смуги. Однак за рішенням журі його було вилучено з остаточного проєкту. Розробив прапор студент Майкл Тайво Акінкунмі.
Нігерія також має спеціальні прапори для суден торговельного і військово-морського флотів.