Користувач:Andrey0369/Чернетка

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку


PANDAR - короткий опис

PANDAR або PANDA (англ. promoter of CDKN1A antisense DNA damage activated RNA) - це довга некодуюча РНК, що кодується одноіменним геном на довгому плечі шостої хромосоми людини[1]. На сьогодні основною функцією цієї РНК є регуляція відповіді клітини на пошкодження ДНК. Експресія цього гена посилюється під вливом активованого p53 і в свою чергу РНК активує транскрипційні фактори про-апоптичних генів. Зараз дослідники пов'язують місрегуляцію цього гену з розвитком пухлин[2].

Історія дослідження

Вперше була відкрита і описана в 2011 році[3]. З 2014 року почалось ретельне дослідження функцій цієї РНК. На сьогоднішній день досліджена лише частина регуляторних функцій та можливих мішеней взаємодії[4].

Динаміка в клітині

В довжину данна РНК складає 1506 нуклеотидів. Ген, що її кодує локалізований на 6p21.2 ділянці геному а саме в гені CDKN1A. Зчитується вона в негативному напрямку. В процесі синтезу PANDAR не піддається сплайсингу, має полі А хвіст та кеп на 5' кінці. Досліджено, що експресія цієї РНК активується в процесі відповіді клітини на пошкодження ДНК за рахунок роботи р53. PANDAR є прямим антагоністом CDKN1A таким чином регулюючи його активність. Основний функціонал PANDAR полягає в тому, щоб інгібувати перехід клітини до сенесцентного стану. Це відбувається за рахунок зв'язування PANDAR з промоторними ділянками генів, що відповідають за цей перехід. У деяких роботах доведено, що збільшена експресія PANDAR індукує епітеліально-мезенхімальний перехід[5] що відповідає за злоякісне переродження клітини. Через значну довжину цієї РНК та комплексність регулювання її синтезу досі недостатньо досліджені можливі точки взаємодії з клітинним апаратом. На сьогодні описані виключно взаємодії з ДНК та білками, проте взаємодії з іншими РНК ще не достатньо досліджені[6].

Динаміка поза клітиною

Доведено, що данна РНК може передаватись від клітини до клітини, таким чином провокуючи еффект в клітинах, експресія в яких не піддавалась змінам. На сьогодні відомі 3 шляхи: везикулярний транспорт, транспорт через міжклітинні канали, дифузний транспорт. Деякі дослідники вважають що передача цієї РНК є одним з механізмів міжклітинного сигналювання[7].

Мішені взаємодії

На сьогодні визначений певний спектр різних внутрішньоклітинних елементів з якими може взаємодіяти PANDAR. Основною мішенью є транскрипційний фактор NF-YA, який відповідає за інгібування експресії про-апоптичних генів[8]. Окрім цього дослідження вказують на те, що данна РНК може взаємодіяти на пряму З ДНК іноді утворюючи подвійну спіраль з одноланцюговою та потрійну з дволанцюговою. Основними генами - мішенями є MRNIP, CAMLG, YWHAZ, UBE2V2, ELOC, ZNF7, PAK4, ANP32E, ENSA.[9] Усі відповідні мішені при взаємодії з данною РНК провокують патологічне онко-переродження клітини та сприяють метастазуванню[10]. PANDAR - це інтерферуюча РНК, що свідчить про те, що вона може взаємодіяти з великою кілкістью різних РНК. Доведено, що PANDAR може взаємодіяти з близько 500 різними дослідженими мікроРНК. Окрім цього існують і інші РНК, які можуть бути лише посередниками у механізмах впливу PANDAR на клітинну машинерію[11].

Роль у розвитку патологій

Наукова спільнота сходиться в думці про те, що PANDAR відіграє критичну роль у розвитку раку і може слугувати потенційним біомаркером для виявлення патології. Окрім цього враховуючи функції цієї довгої некодючої РНК та її не досить досліджений проте уже широкий спектр взаємодій її розглядають як потенційну мішень для лікування онкології.[12] У багатьох пухлин різного походження експресія PANDAR значно збільшена і саме це при типуванні пухлин вказує на поганий прогноз у лікуванні. Збільшена експресія PANDAR часто пов'язана з здатністю пухлини до метастазування.[13]

Сьогодні точні механізми впливу PANDAR на клітинну машинерію під час розвитку онкологічних захворювань невідомі. Дослідникі впевнені, що ця РНК має як відмінні механізми впливу під час розвитку різних типів пухлин так і спільні[14]. Вже доведено, що PANDAR приймає участь у розвитку майже усіх видів раку, його кількість зростає при онкологічному перероджені клітини у всіх типах раку окрім недрібноклітинного раку легенів. В останньому випадку концентрація PANDAR знижується[15].


Використання

Це шаблон-картка для статей про гени. Викликає Модуль:Картка гена, який бере усі потрібні дані з Вікіданих.

Не потребує жодних параметрів.

Див. також


  1. Zou, Yifan; Zhong, Yuantang; Wu, Junjie; Xiao, Huizhong; Zhang, Xintao; Liao, Xinhui; Li, Jianfa; Mao, Xuhua; Liu, Yuchen (2018-02). Long non-coding PANDAR as a novel biomarker in human cancer: A systematic review. Cell Proliferation. Т. 51, № 1. doi:10.1111/cpr.12422. ISSN 1365-2184. PMC 6528858. PMID 29226461. Процитовано 20 січня 2021.
  2. Li, Yi; Su, Xiaomei; Pan, Haixia (2019). Inhibition of lncRNA PANDAR reduces cell proliferation, cell invasion and suppresses EMT pathway in breast cancer. Cancer Biomarkers: Section A of Disease Markers. Т. 25, № 2. с. 185—192. doi:10.3233/CBM-182251. ISSN 1875-8592. PMID 31104011. Процитовано 20 січня 2021.
  3. Chen, Di; Lu, Tong; Tan, Junying; Li, Hao; Wang, Qiuyue; Wei, Liangzhou (6 серпня 2019). Long Non-coding RNAs as Communicators and Mediators Between the Tumor Microenvironment and Cancer Cells. Frontiers in Oncology. Т. 9. с. 739. doi:10.3389/fonc.2019.00739. ISSN 2234-943X. PMC 6691164. PMID 31448238. Процитовано 21 січня 2021.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
  4. Li, Jinglin; Li, Zhenglong; Zheng, Wangyang; Li, Xinheng; Wang, Zhidong; Cui, Yunfu; Jiang, Xingming (24 жовтня 2017). PANDAR: a pivotal cancer-related long non-coding RNA in human cancers. Molecular BioSystems (англ.). Т. 13, № 11. с. 2195—2201. doi:10.1039/C7MB00414A. ISSN 1742-2051. Процитовано 21 січня 2021.
  5. Jiang, Yuehong; Feng, Enhang; Sun, Lifang; Jin, Wei; You, Yuhong; Yao, Yue; Xu, Yi (2017-11). An increased expression of long non-coding RNA PANDAR promotes cell proliferation and inhibits cell apoptosis in pancreatic ductal adenocarcinoma. Biomedicine & Pharmacotherapy (англ.). Т. 95. с. 685—691. doi:10.1016/j.biopha.2017.08.124. Процитовано 21 січня 2021.
  6. Han, Lizhi; Wang, Bo; Wang, Ruoyu; Wang, Zijian; Gong, Song; Chen, Guo; Telemacque, Dionne; Feng, Yong; Xu, Weihua (3 грудня 2019). Prognostic and Clinicopathological Significance of Long Non-coding RNA PANDAR Expression in Cancer Patients: A Meta-Analysis. Frontiers in Oncology. Т. 9. с. 1337. doi:10.3389/fonc.2019.01337. ISSN 2234-943X. PMC 6901660. PMID 31850222. Процитовано 21 січня 2021.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
  7. Schwarzenbach, Heidi; Gahan, Peter (21 березня 2019). MicroRNA Shuttle from Cell-To-Cell by Exosomes and Its Impact in Cancer. Non-Coding RNA (англ.). Т. 5, № 1. с. 28. doi:10.3390/ncrna5010028. ISSN 2311-553X. PMC 6468647. PMID 30901915. Процитовано 21 січня 2021.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
  8. Han, Lizhi; Wang, Bo; Wang, Ruoyu; Wang, Zijian; Gong, Song; Chen, Guo; Telemacque, Dionne; Feng, Yong; Xu, Weihua (2019). Prognostic and Clinicopathological Significance of Long Non-coding RNA PANDAR Expression in Cancer Patients: A Meta-Analysis. Frontiers in Oncology (English) . Т. 9. doi:10.3389/fonc.2019.01337. ISSN 2234-943X. PMC 6901660. PMID 31850222. Процитовано 21 січня 2021.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
  9. OncomiR. www.oncomir.org. Процитовано 21 січня 2021.
  10. Shklar, M. (17 грудня 2004). GeneTide--Terra Incognita Discovery Endeavor: a new transcriptome focused member of the GeneCards/GeneNote suite of databases. Nucleic Acids Research. Т. 33, № Database issue. с. D556—D561. doi:10.1093/nar/gki122. ISSN 1362-4962. Процитовано 21 січня 2021.
  11. miRCancer - microRNA Cancer Association Database. mircancer.ecu.edu. Процитовано 21 січня 2021.
  12. Mehrad-Majd, Hassan; Akhtari, Javad; Haerian, Monir-Sadat; Ravanshad, Yalda (2019-04). Clinicopathological and prognostic value of lncRNA PANDAR expression in solid tumors: Evidence from a systematic review and meta-analysis: MEHRAD-MAJD et al. Journal of Cellular Physiology (англ.). Т. 234, № 4. с. 4206—4216. doi:10.1002/jcp.27179. Процитовано 21 січня 2021.
  13. Zou, Yifan; Zhong, Yuantang; Wu, Junjie; Xiao, Huizhong; Zhang, Xintao; Liao, Xinhui; Li, Jianfa; Mao, Xuhua; Liu, Yuchen (10 грудня 2017). Long non‐coding PANDAR as a novel biomarker in human cancer: A systematic review. Cell Proliferation. Т. 51, № 1. doi:10.1111/cpr.12422. ISSN 0960-7722. PMC 6528858. PMID 29226461. Процитовано 21 січня 2021.
  14. Zou, Yifan; Zhong, Yuantang; Wu, Junjie; Xiao, Huizhong; Zhang, Xintao; Liao, Xinhui; Li, Jianfa; Mao, Xuhua; Liu, Yuchen (10 грудня 2017). Long non‐coding PANDAR as a novel biomarker in human cancer: A systematic review. Cell Proliferation. Т. 51, № 1. doi:10.1111/cpr.12422. ISSN 0960-7722. PMC 6528858. PMID 29226461. Процитовано 21 січня 2021.
  15. Zhang, C.-G.; Yin, D.-D.; Sun, S.-Y.; Han, L. (01 2017). The use of lncRNA analysis for stratification management of prognostic risk in patients with NSCLC. European Review for Medical and Pharmacological Sciences. Т. 21, № 1. с. 115—119. ISSN 2284-0729. PMID 28121347. Процитовано 21 січня 2021.