PPR-білки
| Білки з пентатрикопептидним повтором | |
|---|---|
| Ідентифікатори | |
| Символ | PPR |
| Інша інформація | |
PPR-білки (англ. Pentatricopeptide repeat), білки з пентатрикопептидним повтором — родина білків, які мають у своїй структурі мотив з 35 амінокислотних залишків. Гени цієї родини наявні у всіх гілках евкаріотів, але найбільш поширені в рослин, де виконують різноманітні функції, включно з редагуванням РНК у мітохондріях та хлоропластах.[1] Також виявляються в окремих прокаріотів, але, скоріш за все, набуті шляхом горизонтального перенесення генів.[2]
Структура
Кількість 35-амінокислотних мотивів коливається від 2 до 26. Схожість з послідовністю 34-амінокислотного мотиву свідчить про їхнє розходження на ранній стадії еволюції евкаріот.
Низка білків цієї родини формує гомодимери для взаємодії з молекулами РНК.[2]
Класифікація
PPR-білки поділяють на два класи:
- P-клас, молекули якого містять класичний 35-амінокислотний домен та зазвичай не мають інших додаткових доменів;
- PLS-клас, молекули якого мають різні домени: класичний P (35 амінокислот), короткий S (31 амінокислота), довгий L (35-36 амінокислот), а також задіяні в редагуванні РНК[2]
PLS
PLS-клас поділяється на підкласи білків з DYW-доменом (який складається з залишків аспартату (D), тирозину (Y) та триптофану (W)) та білків з E-доменом (від англ. extension).[2]
У рослин
У рослин значна частина PPR-білків має DYW-домен та/або E-домен.
У людини
У людини відомо 7-8 білків цієї родини, зокрема:
Примітки
- ↑ Sun, Tao; Bentolila, Stephane; Hanson, Maureen R. (2016). The Unexpected Diversity of Plant Organelle RNA Editosomes. Trends in Plant Science. 21 (11): 962—973. doi:10.1016/j.tplants.2016.07.005. ISSN 1360-1385.
- ↑ а б в г Manna, Sam (2015). An overview of pentatricopeptide repeat proteins and their applications. Biochimie. 113: 93—99. doi:10.1016/j.biochi.2015.04.004. ISSN 0300-9084.
|
Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |