PTCD1

PTCD1
Ідентифікатори
Символи	PTCD1, pentatricopeptide repeat domain 1
Зовнішні ІД	OMIM: 614774 MGI: 1919049 GeneCards: PTCD1
Онтологія гена Молекулярна функція • tRNA binding • RNA binding Клітинна компонента • мітохондрія • мітохондріальний матрикс Біологічний процес • tRNA 3'-end processing • tRNA processing Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	26024	71799
Ensembl	ENSG00000106246	ENSMUSG00000029624
UniProt	O75127	Q8C2E4
RefSeq (мРНК)	NM_015545	NM_133735
RefSeq (білок)	NP_056360 NP_056360.2	NP_598496
Локус (UCSC)	Хр. 7: 99.42 – 99.47 Mb	Хр. 5: 145.08 – 145.1 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PTCD1 (англ. Pentatricopeptide repeat domain 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 7-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 700 амінокислот, а молекулярна маса — 78 856.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDFVRLARLF		ARARPMGLFI		LQHLDPCRAR		WAGGREGLMR		PMWAPFSSSS
SQLPLGQERQ		ENTGSLGSDP		SHSNSTATQE		EDEEEEESFG		TLSDKYSSRR
LFRKSAAQFH		NLRFGERRDE		QMEPEPKLWR		GRRNTPYWYF		LQCKHLIKEG
KLVEALDLFE		RQMLKEERLQ		PMESNYTVLI		GGCGRVGYLK		KAFNLYNQMK
KRDLEPSDAT		YTALFNVCAE		SPWKDSALQS		ALKLRQQLQA		KNFELNLKTY
HALLKMAAKC		ADLRMCLDVF		KEIIHKGHVV		TEETFSFLLM		GCIQDKKTGF
RYALQVWRLM		LSLGLQPSRD		SYNLLLVAAR		DCGLGDPQVA		SELLLKPREE
ATVLQPPVSR		QRPRRTAQAK		AGNLMSAMLH		VEALERQLFL		EPSQALGPPE
PPEARVPGKA		QPEVDTKAEP		SHTAALTAVA		LKPPPVELEV		NLLTPGAVPP
TVVSFGTVTT		PADRLALIGG		LEGFLSKMAE		HRQQPDIRTL		TLLAEVVESG
SPAESLLLAL		LDEHQVEADL		TFFNTLVRKK		SKLGDLEGAK		ALLPVLAKRG
LVPNLQTFCN		LAIGCHRPKD		GLQLLTDMKK		SQVTPNTHIY		SALINAAIRK
LNYTYLISIL		KDMKQNRVPV		NEVVIRQLEF		AAQYPPTFDR		YQGKNTYLEK
IDGFRAYYKQ		WLTVMPAEET		PHPWQKFRTK		PQGDQDTGKE		ADDGCALGGR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як процесинг тРНК. Локалізований у мітохондрії.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 7