PTCD2

PTCD2
Ідентифікатори
Символи	PTCD2, pentatricopeptide repeat domain 2
Зовнішні ІД	OMIM: 615484 MGI: 1916177 HomoloGene: 11695 GeneCards: PTCD2
Онтологія гена Молекулярна функція • RNA binding Клітинна компонента • мітохондрія Біологічний процес • регуляція експресії генів • ventricular cardiac muscle tissue morphogenesis • liver development • mRNA processing • heart development • mitochondrion organization • розвиток нирки • regulation of mRNA processing Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	79810	68927
Ensembl	ENSG00000049883	ENSMUSG00000021650
UniProt	Q8WV60	Q8R3K3
RefSeq (мРНК)	NM_001284403 NM_001284404 NM_001284405 NM_024754	NM_026873
RefSeq (білок)	NP_001271332 NP_001271333 NP_001271334 NP_079030 NP_079030.3	NP_081149
Локус (UCSC)	Хр. 5: 72.32 – 72.37 Mb	Хр. 13: 99.46 – 99.48 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PTCD2 (англ. Pentatricopeptide repeat domain 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 5-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 388 амінокислот, а молекулярна маса — 43 968.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVRDSMAAAF		RPSNRVLLQA		LQILVYPGVG		GSGSVSCRCP		LGAKRYLLTD
NVVKLKEFQQ		KKVAVACNLS		GTKETYFRNL		KKKLTQNKLI		LKGELITLLH
LCESRDHVEL		AKNVIYRYHA		ENKNFTLGEY		KFGPLFVRLC		YELDLEESAV
ELMKDQHLRG		FFSDSTSFNI		LMDMLFIKGK		YKSALQVLIE		MKNQDVKFTK
DTYVLAFAIC		YKLNSPESFK		ICTTLREEAL		LKGEILSRRA		SCFAVALALN
QNEMAKAVSI		FSQIMNPESI		ACINLNIIIH		IQSNMLENLI		KTLKNAAEGN
LSKFVKRHVF		SEEVLAKVRE		KVKDVPALVA		KFDEIYGTLH		ITGQVTTDSL
DAVLCHTPRD		RKSHTLLLNK		RMVSRRTFQP		LSQSLLAE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мітохондрії.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 5