Caenorhabditis elegans: відмінності між версіями
| [перевірена версія] | [перевірена версія] |
Xqbot (обговорення | внесок) м Робот: добра стаття en:Caenorhabditis elegans; косметичні зміни |
|||
| Рядок 27: | Рядок 27: | ||
''C. elegans'' був першим багатоклітинним організмом, чий [[геном]] був повністю [[Секвенування ДНК|секвенований]]. Повна послідовність [[ДНК]] була опублікована в 1998<ref>{{cite journal |quotes=no |author=The ''C. elegans'' Sequencing Consortium |year=1998 |url=http://www.sciencemag.org/cgi/content/abstract/282/5396/2012 |title=Genome sequence of the nematode ''C. elegans'': a platform for investigating biology |journal=[[Science (journal)|Science]] |volume=282 |pages=2012-2018 |doi=10.1126/science.282.5396.2012 |pmid=9851916}}</ref>, проте в ній залишались деякі пробіли(останній був закритий в жовтні 2002). Геном ''C. elegans'' має довжину приблизно 100 мільйонів пар основ і включає в себе близько 20 000 [[ген]]ів. Більшість цих генів кодує [[білки]],але ,можливо, серед них є близько 1 000 генів РНК. |
''C. elegans'' був першим багатоклітинним організмом, чий [[геном]] був повністю [[Секвенування ДНК|секвенований]]. Повна послідовність [[ДНК]] була опублікована в 1998<ref>{{cite journal |quotes=no |author=The ''C. elegans'' Sequencing Consortium |year=1998 |url=http://www.sciencemag.org/cgi/content/abstract/282/5396/2012 |title=Genome sequence of the nematode ''C. elegans'': a platform for investigating biology |journal=[[Science (journal)|Science]] |volume=282 |pages=2012-2018 |doi=10.1126/science.282.5396.2012 |pmid=9851916}}</ref>, проте в ній залишались деякі пробіли(останній був закритий в жовтні 2002). Геном ''C. elegans'' має довжину приблизно 100 мільйонів пар основ і включає в себе близько 20 000 [[ген]]ів. Більшість цих генів кодує [[білки]],але ,можливо, серед них є близько 1 000 генів РНК. |
||
В 2003 також була визначена генна послідовність нематоди ''[[Caenorhabditis briggsae|C. briggsae]]''. Це дозволило дослідникам провести порівняльний генетичний аналіз двох близьких організмів<ref>{{cite journal | quotes=no |author=Stein, L. D. ''et al.'' |year=2003 |doi= 10.1371/journal.pbio.0000045 |title=The Genome Sequence of ''Caenorhabditis briggsae'': A Platform for Comparative Genomics |journal=[[PLoS Biology]] |volume=1 |pages=166-192}}</ref>. На разі продовжується робота над визначенням генних послідовностей інших нематод того ж [[рід| |
В 2003 також була визначена генна послідовність нематоди ''[[Caenorhabditis briggsae|C. briggsae]]''. Це дозволило дослідникам провести порівняльний генетичний аналіз двох близьких організмів<ref>{{cite journal | quotes=no |author=Stein, L. D. ''et al.'' |year=2003 |doi= 10.1371/journal.pbio.0000045 |title=The Genome Sequence of ''Caenorhabditis briggsae'': A Platform for Comparative Genomics |journal=[[PLoS Biology]] |volume=1 |pages=166-192}}</ref>. На разі продовжується робота над визначенням генних послідовностей інших нематод того ж [[рід|роду]], таких як ''C. remanei'',<ref>{{cite web|url=http://genome.wustl.edu/genome.cgi?GENOME=Caenorhabditis%20remanei|author=Genome Sequencing Center|title=''Caenorhabditis remanei'': Background|accessdate=2008-07-11|publisher=[[Washington University School of Medicine]]|deadurl=404}}</ref> ''C. japonica''<ref>{{cite web|url=http://genome.wustl.edu/genome.cgi?GENOME=Caenorhabditis%20japonica|author=Genome Sequencing Center|title=''Caenorhabditis japonica'': Background|accessdate=2008-07-11|publisher=[[Washington University School of Medicine]]|deadurl=404}}</ref> и ''C. brenneri''.<ref>{{cite web|url=http://genome.wustl.edu/genome.cgi?GENOME=Caenorhabditis%20brenneri|author=Genome Sequencing Center|title=''Caenorhabditis brenneri'': Background|accessdate=2008-07-11|publisher=[[Washington University School of Medicine]]|deadurl=404}}</ref>Ці нові генні последовності отримані методом «Whole-Genome Shotgun», а це значить ,що результати не будуть такими повними и точними, як у випадку з |
||
''C. elegans'', геном якого був секвенований з використанням ієрархічного метода «Clone-by-Clone»). |
''C. elegans'', геном якого був секвенований з використанням ієрархічного метода «Clone-by-Clone»). |
||
| Рядок 41: | Рядок 41: | ||
Xol −1 пригнічує активність sdc. Вони входять у великий білковий комплекс,який зв'язується з X-хромосомою і на половину зменшує її транскрипцію. Sdc-2 також зв'язується з промотером her-1 і зменшує його транскрипцію в 20 разів порівняно з ХО — особинами. |
Xol −1 пригнічує активність sdc. Вони входять у великий білковий комплекс,який зв'язується з X-хромосомою і на половину зменшує її транскрипцію. Sdc-2 також зв'язується з промотером her-1 і зменшує його транскрипцію в 20 разів порівняно з ХО — особинами. |
||
HER-1 — невеликий білок, що відповідає за чоловічий розвиток клітин неавтономним методом. Він інгібує tra-2, який при цьому не може зв'язатись з fem, він утримує tra-1 в цитоплазмі, і розвиток проходить по чоловічій лінії. Переміщення в ядро транкрипційного фактора tra-1 означає реалізацію гермафродитного фенотипа. При цьому білок fem дисоціює з tra-1 і зв'язується з білком tra-2. |
HER-1 — невеликий білок, що відповідає за чоловічий розвиток клітин неавтономним методом. Він інгібує tra-2, який при цьому не може зв'язатись з fem, він утримує tra-1 в цитоплазмі, і розвиток проходить по чоловічій лінії. Переміщення в ядро транкрипційного фактора tra-1 означає реалізацію гермафродитного фенотипа. При цьому білок fem дисоціює з tra-1 і зв'язується з білком tra-2. |
||
[[ |
[[Файл:Caenorhabditis elegans hermaphrodite adult-en.svg|1000px|center|Внутрішня будова]] |
||
== Нервова система == |
== Нервова система == |
||
| Рядок 67: | Рядок 67: | ||
[[Категорія:Тварини, описані 1900]] |
[[Категорія:Тварини, описані 1900]] |
||
[[Категорія:Модельні організми]] |
[[Категорія:Модельні організми]] |
||
{{Link GA|en}} |
|||
Версія за 17:13, 8 серпня 2014
| Caenorhabditis elegans | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | ||||||||||||||||||
| Біологічна класифікація | ||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||
| Caenorhabditis elegans Maupas, 1900 | ||||||||||||||||||
Посилання
| ||||||||||||||||||
|
Caenorhabditis elegans — вільноживуча нематода (круглий черв'як) близько 1 мм в довжину. Широко використовується як модельний організм. Його дослідження в молекулярній біології і біології розвитку почалися в 1974 роботами Сіднея Бреннера[1]. Геном повністю просеквенований і опублікований в 1998 році (доповнений в 2002).Мартін Чалфі використовував C. elegans при дослідженні зеленого флуорисцентного білка.
Геном
C. elegans був першим багатоклітинним організмом, чий геном був повністю секвенований. Повна послідовність ДНК була опублікована в 1998[2], проте в ній залишались деякі пробіли(останній був закритий в жовтні 2002). Геном C. elegans має довжину приблизно 100 мільйонів пар основ і включає в себе близько 20 000 генів. Більшість цих генів кодує білки,але ,можливо, серед них є близько 1 000 генів РНК.
В 2003 також була визначена генна послідовність нематоди C. briggsae. Це дозволило дослідникам провести порівняльний генетичний аналіз двох близьких організмів[3]. На разі продовжується робота над визначенням генних послідовностей інших нематод того ж роду, таких як C. remanei,[4] C. japonica[5] и C. brenneri.[6]Ці нові генні последовності отримані методом «Whole-Genome Shotgun», а це значить ,що результати не будуть такими повними и точними, як у випадку з C. elegans, геном якого був секвенований з використанням ієрархічного метода «Clone-by-Clone»).
Визначення статі
У С. elegans є дві статі: самці (ХО) и гермафродити (ХХ), які є самками, що отримали здатність до сперматогенезу. У С. elegans стать визначається механізмом XX — ХО, значення має відношення кількості X-хромосом до числа аутосом. Статевий розвиток всіх соматичних клітин контролюється шляхом регулювання, активність якого відмінна у різних статей. Цей шлях називають глобальним , на відміну від шляху, який контролює розвиток окремих тканин. Також цей шлях відповідає за контроль дозової компенсації, процес, що призводить до однакової експресії X-зв'язаних генів у обох статей.
Кількість X-хромосом контролює серію інгібіторних реакцій, яка визначає активність кінцевого регулятора tra-1(transformer-1). А він визначає статеву диференціацію організма.
Каскад статевої диференціації запускається в ембріоні відношенням числа X-хромосом до числа аутосом. Воно впливає на експресію xol-1 (XO lethal 1). При великому відношенні (хх) вона пригнічується, а при низькому — ні. В X-хромосомі закодовані «нумератори». Всього їх 4, але вивчені лише 2 елементи: fox-1, РНК — зв'язуючий білок, який може постртранскрипційно інгібувати хо1-1, і sex-1.
Xol −1 пригнічує активність sdc. Вони входять у великий білковий комплекс,який зв'язується з X-хромосомою і на половину зменшує її транскрипцію. Sdc-2 також зв'язується з промотером her-1 і зменшує його транскрипцію в 20 разів порівняно з ХО — особинами. HER-1 — невеликий білок, що відповідає за чоловічий розвиток клітин неавтономним методом. Він інгібує tra-2, який при цьому не може зв'язатись з fem, він утримує tra-1 в цитоплазмі, і розвиток проходить по чоловічій лінії. Переміщення в ядро транкрипційного фактора tra-1 означає реалізацію гермафродитного фенотипа. При цьому білок fem дисоціює з tra-1 і зв'язується з білком tra-2.
Нервова система
C. elegans має одну із «найпростіших» нервових систем (простими часто називають нервові системи ,що складаються з невеликої кількості нейронів). Доросла гермафродитна особина складається з 959 клітин[7] і має всього 302 нейрона, зв'язки між якими були повністю описані.
-->[8]В зв'язку з цим C. elegans зручний об'єкт для вивчення механізмів керування рухом, передачі сигналів по нейронній мережі, хемотаксисі тд.
Особливості життєвого циклу
При нестачі їжі чи дії ряду інших факторів, в тому числі виділення дорослими особинами, які зазнали негативного впливу середовища,з личинок ,що пройшли одну линьку(стадія L2) може розвинутись незвична для циклу нематод личинка Дауерівська личинка (Dauer larva).
Див. також
Посилання
- ↑ Brenner, S. (1974). The Genetics of Caenorhabditis elegans (PDF). Genetics. 77: 71—94.
{{cite journal}}: Проігноровано невідомий параметр|quotes=(довідка) - ↑ The C. elegans Sequencing Consortium (1998). Genome sequence of the nematode C. elegans: a platform for investigating biology. Science. 282: 2012—2018. doi:10.1126/science.282.5396.2012. PMID 9851916.
{{cite journal}}: Проігноровано невідомий параметр|quotes=(довідка) - ↑ Stein, L. D. та ін. (2003). The Genome Sequence of Caenorhabditis briggsae: A Platform for Comparative Genomics. PLoS Biology. 1: 166—192. doi:10.1371/journal.pbio.0000045.
{{cite journal}}: Проігноровано невідомий параметр|quotes=(довідка); Явне використання «та ін.» у:|author=(довідка)Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання) - ↑ Genome Sequencing Center. Caenorhabditis remanei: Background. Washington University School of Medicine. Процитовано 11 липня 2008.
{{cite web}}: Недійсний|deadurl=404(довідка) - ↑ Genome Sequencing Center. Caenorhabditis japonica: Background. Washington University School of Medicine. Процитовано 11 липня 2008.
{{cite web}}: Недійсний|deadurl=404(довідка) - ↑ Genome Sequencing Center. Caenorhabditis brenneri: Background. Washington University School of Medicine. Процитовано 11 липня 2008.
{{cite web}}: Недійсний|deadurl=404(довідка) - ↑ Непомнящий Н. Н. {{{Заголовок}}}. — ISBN 5-9433-1124-9.
- ↑ White JG, Southgate E, Thomson JN, Brenner S (1986) The structure of the nervous system of the nematode Caenorhabditis elegans. Phil. Trans. Royal Soc. London. B 314, 1-340.
|
Це незавершена стаття про безхребетних. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
| Основні модельні організми в генетиці |
|---|
| Фаг лямбда | Кишкова паличка | Хламідомонада | Tetrahymena | Дріжджі (Пивні дріжджі • Schizosaccharomyces pombe) | Neurospora | Кукурудза | Arabidopsis | C. elegans | Дрозофіла | Даніо-реріо | Пацюк сірий | Миша хатня |