МікроРНК: відмінності між версіями

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
Інтерактивний перегляд історії
[перевірена версія][неперевірена версія]
← Попереднє редагуванняНаступне редагування →
Вилучено вміст Додано вміст
ВізуальнийВікірозмітка
м правопис
доповнення, уточнення
Рядок 1: Рядок 1:
[[Файл:MiR-126 secondary structure.png|міні|праворуч|300пкс|Структура пре-мікроРНК мікроРНК-126]]
[[Файл:MiR-126 secondary structure.png|міні|праворуч|300пкс|Структура пре-мікроРНК мікроРНК-126]]
'''МікроРНК''' ({{lang-en|microRNA, miRNA}})&nbsp;— клас [[Некодуючі РНК|некодуючих]] дволанцюгових молекул [[РНК]], довжиною 21-22 пар нуклеотидів, що беруть участь у регуляції [[трансляція (біологія)|трансляції]] та [[деградація РНК|деградації]] [[мРНК]]. Особливістю мікроРНК є неповна [[Комплементарність (молекулярна біологія)|комплементарність]] їх взаємодії з цілевою мРНК.<ref>{{cite journal |author=Wang QL, Li ZH |title=The functions of microRNAs in plants |journal=Front. Biosci. |volume=12 |issue= |pages=3975–82 |year=2007 |pmid=17485351}}</ref><ref>{{cite journal |author=Zhao Y, Srivastava D |title=A developmental view of microRNA function |journal=Trends Biochem. Sci. |volume=32 |issue=4 |pages=189–97 |year=2007 |pmid=17350266 |doi=10.1016/j.tibs.2007.02.006}}</ref>.
'''МікроРНК''' ({{lang-en|microRNA, miRNA}})&nbsp;— клас [[Некодуючі РНК|некодуючих]] молекул [[РНК]], довжиною ~22&nbsp;нуклеотидів, що беруть участь у регуляції [[трансляція (біологія)|трансляції]] та [[деградація РНК|деградації]] [[мРНК]]. Особливістю мікроРНК є неповна [[Комплементарність (молекулярна біологія)|комплементарність]] їх взаємодії з цілевою мРНК.<ref>{{cite journal |author=Wang QL, Li ZH |title=The functions of microRNAs in plants |journal=Front. Biosci. |volume=12 |issue= |pages=3975–82 |year=2007 |pmid=17485351}}</ref><ref>{{cite journal |author=Zhao Y, Srivastava D |title=A developmental view of microRNA function |journal=Trends Biochem. Sci. |volume=32 |issue=4 |pages=189–97 |year=2007 |pmid=17350266 |doi=10.1016/j.tibs.2007.02.006}}</ref>. Станом на 2014 р. всього зареєстровано 28&nbsp;645&nbsp;пре-мікроРНК з різних тварин, рослин і вірусів (1881&nbsp;людини) і 35&nbsp;822&nbsp;зрілих мікроРНК (2588&nbsp;людини).<ref>{{cite journal
|author=Kozomara A, Griffiths-Jones S
|title=miRBase: annotating high confidence microRNAs using deep sequencing data
|journal=Nucl Acids Res
|volume=42
|issue=D1
|pages=D68–D73
|year=2014
|pmid=24275495
|doi=10.1093/nar/gkt1181}}</ref><ref>{{cite web
|url = http://www.mirbase.org/index.shtml
|title = miRBase: the microRNA database
|publisher = [[Манчестерський університет]]
|accessdate = 17 січня 2016
}}</ref> Довжина зареєстрованих зрілих молекул: 15–34&nbsp;нуклеотидів.


== Походження ==
== Походження ==
МікроРНК кодуються генами, перші з яких були виявлені у 1993 році у [[Caenorhabditis elegans]].<ref name=gulb>The microRNAs of Caenorhabditis elegans http://cseweb.ucsd.edu/classes/wi05/cse206b/pub/burge_MiRscan.pdf </ref> Еволюційно гени мікроРНК є похідними мобільних елементів класа MITE ({{lang-en|miniature inverted-repeat transposable elements}}) та виникли з окремих копій [[транспозон]]ів. Транскрипти MITE завдяки наявності інвертованих повторів та формуванню шпильок клітина розпізнавала та використовувала для пригнічення активності решти копій [[транспозон]]ів. На сьогодні мікроРНК виявлені у рослинних й у тваринних організмах.
МікроРНК кодуються [[ген]]ами, перші з яких були виявлені у 1993 році у [[Caenorhabditis elegans]].<ref name=gulb>The microRNAs of Caenorhabditis elegans http://cseweb.ucsd.edu/classes/wi05/cse206b/pub/burge_MiRscan.pdf </ref> Еволюційно гени мікроРНК є похідними мобільних елементів класа MITE ({{lang-en|miniature inverted-repeat transposable elements}}) та виникли з окремих копій [[транспозон]]ів. Транскрипти MITE завдяки наявності інвертованих повторів та формуванню шпильок клітина розпізнавала та використовувала для пригнічення активності решти копій [[транспозон]]ів. На сьогодні мікроРНК виявлені у рослинних й у тваринних організмах.
Мішенями мікроРНК є значна кількість [[ген]]ів&nbsp;— щонайменше третина генів [[геном]]а. Раніше вважалось, що мікроРНК наявні лише у багатоклітинних організмах, але, наявність цієї групи молекул виявлена і у одноклітинних [[еукаріот]]ів, а саме&nbsp;— у зелених водоростей ''Chlamydomonas reinhardtii''. Це свідчить про великий еволюційний вік мікроРНК.
Мішенями мікроРНК є значна кількість генів&nbsp;— щонайменше третина генів [[геном]]а. Раніше вважалось, що мікроРНК наявні лише у багатоклітинних організмах, але, наявність цієї групи молекул виявлена і у одноклітинних [[еукаріот]]ів, а саме&nbsp;— у зелених водоростей ''Chlamydomonas reinhardtii''. Це свідчить про великий еволюційний вік мікроРНК.


== Будова і процесинг ==
== Будова і процесинг ==
Гени мікроРНК [[Транскрипція (біологія)|транскрибуються]] із утворенням довгих транскриптів первинної мікроРНК ({{lang-en|primordial miRNA}}). Ці РНК процесуються у [[ядро клітини|ядрі]], внаслідок чого вони перетворюються у пре-мікроРНК&nbsp;— структури у вигляді шпильки довжиною приблизно 70 нуклеотидів. Комплекс процесингу первинного транскрипту в пре-мікроРНК містить [[фермент]] із активністю [[РНКаза|РНКази ІІІ]], який називають Drosha, та білок, що зв'язує дволанцюгову РНК&nbsp;— Pasha. Цей комплекс відрізає довгі «хвости» молекули РНК, залишаючи невелику дволанцюгову молекулу зі шпилькою, довжиною 70-90 нуклеотидів&nbsp;— пре-мікроРНК. Після утворення пре-мікроРНК транспортується з ядра в [[цитоплазма|цитоплазму]], де від неї відрізується шпилька за допомогою ферменту [[дайсер]] (у ''[[Drosophila melanogaster]]'' та [[Caenorhabditis elegans|''С.elegans'']] для міРНК та мікроРНК існують різні [[ізоформи ферментів|ізоформи ферменту]] дайсер<ref name="Lee">{{cite journal |author=Lee Y, Nakahara K, Pham J, Kim K, He Z, Sontheimer E, Carthew R |title=Distinct roles for Drosophila Dicer-1 and Dicer-2 in the siRNA/miRNA silencing pathways |journal=Cell |volume=117 |issue=1 |pages=69–81 |year=2004 |pmid=15066283 |doi=10.1016/S0092-8674(04)00261-2}}</ref>). Зріла молекула мікроРНК являє собою дволанцюгову молекулу РНК, яка зв'язується із ферментативними RISC-комплексом<ref name="Denli">{{cite journal |author=Gregory R, Chendrimada T, Shiekhattar R |title=MicroRNA biogenesis: isolation and characterization of the microprocessor complex |journal=Methods Mol Biol |volume=342 |issue= |pages=33–47 |year=2006 |pmid=16957365 |doi=10.1385/1-59745-123-1:33}}</ref>. Відомий також шлях процесингу мікроРНК, незалежний від дайсеру. У цьому випадку пре-мікроРНК ріжеться білком [[Аргонавт (білок)|аргонавт]] 2.<ref name="nature09092">{{статья|автор=Cheloufi S, Dos Santos CO, Chong MM, Hannon GJ|заглавие=A dicer-independent miRNA biogenesis pathway that requires Ago catalysis|издание=Nature |год=2010 |выпуск=doi:10.1038/nature09092 |страницы=Published Online April 27, 2010}}</ref>
Гени мікроРНК [[Транскрипція (біологія)|транскрибуються]] із утворенням довгих транскриптів первинної мікроРНК ({{lang-en|primordial miRNA}}). Ці РНК процесуються у [[ядро клітини|ядрі]], внаслідок чого вони перетворюються у пре-мікроРНК&nbsp;— структури у вигляді шпильки довжиною приблизно 70 нуклеотидів. Комплекс процесингу первинного транскрипту в пре-мікроРНК містить [[фермент]] із активністю [[РНКаза|РНКази ІІІ]], який називають Drosha, та білок, що зв'язує дволанцюгову РНК&nbsp;— Pasha. Цей комплекс відрізає довгі «хвости» молекули РНК, залишаючи невелику дволанцюгову молекулу зі шпилькою, довжиною 70-90 нуклеотидів&nbsp;— пре-мікроРНК. Після утворення пре-мікроРНК транспортується з ядра в [[цитоплазма|цитоплазму]], де від неї відрізується шпилька за допомогою ферменту [[дайсер]] (у ''[[Drosophila melanogaster]]'' та [[Caenorhabditis elegans|''С.elegans'']] для міРНК та мікроРНК існують різні [[ізоформи ферментів|ізоформи ферменту]] дайсер<ref name="Lee">{{cite journal |author=Lee Y, Nakahara K, Pham J, Kim K, He Z, Sontheimer E, Carthew R |title=Distinct roles for Drosophila Dicer-1 and Dicer-2 in the siRNA/miRNA silencing pathways |journal=[[Cell]] |volume=117 |issue=1 |pages=69–81 |year=2004 |pmid=15066283 |doi=10.1016/S0092-8674(04)00261-2}}</ref>). У багатьох, але не у всіх, випадках тільки один з лацюгів зрілої мікроРНК залишається в цитоплазмі і зв'язується із ферментативним RISC-комплексом<ref name="Denli">{{cite journal |author=Gregory R, Chendrimada T, Shiekhattar R |title=MicroRNA biogenesis: isolation and characterization of the microprocessor complex |journal=Methods Mol Biol |volume=342 |issue= |pages=33–47 |year=2006 |pmid=16957365 |doi=10.1385/1-59745-123-1:33}}</ref>. Другий (пасажирський) ланцюг деградується [[РНКаза]]ми. Відомий також шлях процесингу мікроРНК, незалежний від дайсеру. У цьому випадку пре-мікроРНК ріжеться білком [[Аргонавт (білок)|аргонавт]] 2.<ref name="nature09092">{{статья|автор=Cheloufi S, Dos Santos CO, Chong MM, Hannon GJ|заглавие=A dicer-independent miRNA biogenesis pathway that requires Ago catalysis|издание=[[Nature]] |год=2010 |выпуск=doi:10.1038/nature09092 |страницы=Published Online April 27, 2010}}</ref>


== Функція ==
== Функція ==
Рядок 13: Рядок 27:


МікроРНК відіграють важливу роль у пригніченні експресії інших генів та у регуляції розвитку, особливо у визначенні часу морфогенезу та підтриманні недиференційованих або не повністю диференційованих типів клітин, таких як стовбурові клітини.
МікроРНК відіграють важливу роль у пригніченні експресії інших генів та у регуляції розвитку, особливо у визначенні часу морфогенезу та підтриманні недиференційованих або не повністю диференційованих типів клітин, таких як стовбурові клітини.
== Позаклітинні мікроРНК ==
Зрілі мікроРНК існують не тільки в цитоплазмі, а також і в [[біологічна рідина|біологічних ріднинах]]: [[плазма крові|плазмі крові]], [[слина|слині]], [[сльози|сльозах]], [[спинномозкова рідина|спинномозковій ріднині]], [[сеча|сечі]], [[грудне молоко|грудному молоці]], [[молозиво|молозиві]], [[амніотична рідина|амніотичній ріднині]], [[сперма|семенній]] ріднині, ріднині [[черевна порожнина|порожнини живота]], [[плевра]]льній ріднині, а також в [[кал]]і.<ref>{{cite journal
|author=Weber JA, Baxter DH, Zhang S, Huang DY, Huang KH, Lee MJ, Galas DJ, Wang K
|title=The microRNA spectrum in 12 body fluids
|journal=Clin Chem
|volume=56
|issue=11
|pages=1733–1741
|year=2010
|pmid=20847327
|doi=10.1373/clinchem.2010.147405}}</ref><ref>{{cite journal
|author=Ahmed FE, Jeffries CD, Vos PW, Flake G, Nuovo GJ, Sinar DR, Naziri W, Marcuard SP
|title=Diagnostic microRNA markers for screening sporadic human colon cancer and active ulcerative colitis in stool and tissue
|journal=Cancer Genomics Proteomics
|url=http://cgp.iiarjournals.org/content/6/5/281.abstract
|volume=6
|issue=5
|pages=281–295
|year=2009
|pmid=19996134
|doi=}}</ref> Позаклітинні мікроРНК дуже стабільні тому що знаходяться в [[екзосома]]х, або зв'язані з білком [[аргонавт (білок)|аргонавт]] або [[ліпопротеїни високої щільності|ліпопротеїнами високої щільності]]. Починаючи з 2008 р. багато зусиль було покладено на пошук кореляції між спектром ціркулюючих мікроРНК і [[карцинома|раковими]] чи іншими захворюваннями, але встановити надійних біомаркерів поки не вдалося.<ref>{{cite journal
|author=Lawrie CH, Gal S, Dunlop HM, Pushkaran B, Liggins AP, Pulford K, Banham AH, Pezzella F, Boultwood J, Wainscoat JS, Hatton CS, Harris AL
|title=Detection of elevated levels of tumour-associated microRNAs in serum of patients with diffuse large B-cell lymphoma
|journal=Br J Haematol
|volume=141
|issue=5
|pages=672–675
|year=2008
|pmid=18318758
|doi=10.1111/j.1365-2141.2008.07077.x}}</ref><ref>{{cite journal
|author=Leidner RS, Li L, Thompson CL
|title=Dampening Enthusiasm for Circulating MicroRNA in Breast Cancer
|journal=[[PLOS One|PLoS One]]
|volume=8
|issue=3
|pages=e57841
|year=2013
|pmid=23472110
|doi=10.1371/journal.pone.0057841}}</ref><ref>{{cite journal
|author=Angelini TG, Emanueli C
|title=MicroRNAs as clinical biomarkers?
|journal=Front Genet
|volume=6
|issue=
|pages=240
|year=2015
|pmid=26236333
|doi=10.3389/fgene.2015.00240}}</ref> Не знайшла достатьної підтримки екзосомна модель міжклітинних комунікацій за рахунок мікроРНК.<ref>{{cite journal
|author=Chevillet JR, Kang Q, Ruf IK, Briggs HA, Vojtech LN, Hughes SM, Cheng HH, Arroyo JD, Meredith EK, Gallichotte EN, Pogosova-Agadjanyan EL, Morrissey C, Stirewalt DL, Hladik F, Yu EY, Higano CS, Tewari M
|title=Quantitative and stoichiometric analysis of the microRNA content of exosomes
|journal=Proc Natl Acad Sci USA
|volume=111
|issue=41
|pages=14888–14893
|year=2014
|pmid=25267620
|doi=10.1073/pnas.1408301111}}</ref><ref>{{cite journal
|author=Turchinovich A1, Tonevitsky AG, Cho WC, Burwinkel B
|title=Check and mate to exosomal extracellular miRNA: new lesson from a new approach
|journal=Front Mol Biosci
|volume=2
|issue=
|pages=11
|year=2015
|pmid=25988178
|doi=10.3389/fmolb.2015.00011}}</ref> Порівняння спектрів мікроРНК в грудному молоці людей та інших [[ссавці]]в виявило спільні типи зустрічаємих мікроРНК, але можливий вплив молочної мікроРНК на розвиток новонароджених ще не знайдено.<ref>{{cite journal
|author=Simpson MR, Brede G, Johansen J, Johnsen R, Storrø O, Sætrom P, Øien T
|title=Human Breast Milk miRNA, Maternal Probiotic Supplementation and Atopic Dermatitis in Offspring
|journal=[[PLOS One|PLoS One]]
|volume=10
|issue=12
|pages=e0143496
|year=2015
|pmid=26657066
|doi=10.1371/journal.pone.0143496}}</ref>

== МікроРНК і мікробіота ==
В 2016 р. [[Гарвардський університет|гарвардські]] вченні відкрили механізм формування [[флора кишечника|флори кишечника]] через потрапляння фекальних мікроРНК, які виділяються [[епітелій|епітелієм]], всередину [[бактерії|бактерій]] і регуляцію їх генів.<ref>{{cite journal
|author=Liu S, da Cunha AP, Rezende RM, Cialic R, Wei Z, Bry L, Comstock LE, Gandhi R, Weiner HL
|title=The Host Shapes the Gut Microbiota via Fecal MicroRNA
|journal=Cell Host Microbe
|volume=19
|issue=1
|pages=32–43
|year=2016
|pmid=26764595
|doi=10.1016/j.chom.2015.12.005}}</ref> Виявилось, що специфічний набір мікроРНК виробляється та експортується в порожнину кишечника клітинами з поверхні епітелія, а також [[стовбурові клітини|стовбуровими клітинами]], які знаходяться в +4 шарі, разом з їх більш [[диференціація клітин|диференцованими]] нащадками з характерною [[експресія генів|експресією]] гена [[Hopx]]. Концентрація мікроРНК в [[клубова кишка|клубовій кишкі]] більше ніж у [[товста кишка|товстій]]. Спектр типів мікроРНК в різних секціях [[травна система|травного тракту]] змінюється. Тести з найпоширенішими типами мікроРНК показали, що hsa-miR-515-5p прискорює рост кишечної бактерії ''[[Fusobacterium|Fusobacterium nucleatum]]'' специфічно діючи на її [[16S рРНК|16S рибосомну РНК]]. Інша мікроРНК&nbsp;— hsa-miR-1226-5p прискорює рост ''[[E. coli]]'' через взаємодію з мРНК [[транспортні білки|транспортного]] білка YegH. [[Нокаутна миша|Лабораторні миші]] з порушеням у виробництві фекальних мікроРНК дуже вразливі до [[коліт]]у, але якщо їх годувати цими мікроРНК, то вдається зменьшити наслідки патології кишечника. Наступним кроком буде розробка лікувальних засобів на основі мікроРНК.<ref>{{cite journal
|author=Maron DF
|title=Does our Microbiome Control Us or Do We Control It?
|journal=[[Scientific American]]
|url=http://www.scientificamerican.com/article/does-our-microbiome-control-us-or-do-we-control-it/
|volume=
|issue=
|pages=
|year=2016
|pmid=
|doi=}}</ref><ref>{{cite press release
|title=Mammals shape their microbiome to prevent disease
|publisher=Cell Press
|date=2016-01-13
|url=http://www.eurekalert.org/pub_releases/2016-01/cp-mst010616.php
|accessdate=2016-01-17}}</ref>


== Примітки ==
== Примітки ==

Версія за 09:56, 17 січня 2016

Структура пре-мікроРНК мікроРНК-126

МікроРНК (англ. microRNA, miRNA) — клас некодуючих молекул РНК, довжиною ~22 нуклеотидів, що беруть участь у регуляції трансляції та деградації мРНК. Особливістю мікроРНК є неповна комплементарність їх взаємодії з цілевою мРНК.[1][2]. Станом на 2014 р. всього зареєстровано 28 645 пре-мікроРНК з різних тварин, рослин і вірусів (1881 людини) і 35 822 зрілих мікроРНК (2588 людини).[3][4] Довжина зареєстрованих зрілих молекул: 15–34 нуклеотидів.

Походження

МікроРНК кодуються генами, перші з яких були виявлені у 1993 році у Caenorhabditis elegans.[5] Еволюційно гени мікроРНК є похідними мобільних елементів класа MITE (англ. miniature inverted-repeat transposable elements) та виникли з окремих копій транспозонів. Транскрипти MITE завдяки наявності інвертованих повторів та формуванню шпильок клітина розпізнавала та використовувала для пригнічення активності решти копій транспозонів. На сьогодні мікроРНК виявлені у рослинних й у тваринних організмах. Мішенями мікроРНК є значна кількість генів — щонайменше третина генів генома. Раніше вважалось, що мікроРНК наявні лише у багатоклітинних організмах, але, наявність цієї групи молекул виявлена і у одноклітинних еукаріотів, а саме — у зелених водоростей Chlamydomonas reinhardtii. Це свідчить про великий еволюційний вік мікроРНК.

Будова і процесинг

Гени мікроРНК транскрибуються із утворенням довгих транскриптів первинної мікроРНК (англ. primordial miRNA). Ці РНК процесуються у ядрі, внаслідок чого вони перетворюються у пре-мікроРНК — структури у вигляді шпильки довжиною приблизно 70 нуклеотидів. Комплекс процесингу первинного транскрипту в пре-мікроРНК містить фермент із активністю РНКази ІІІ, який називають Drosha, та білок, що зв'язує дволанцюгову РНК — Pasha. Цей комплекс відрізає довгі «хвости» молекули РНК, залишаючи невелику дволанцюгову молекулу зі шпилькою, довжиною 70-90 нуклеотидів — пре-мікроРНК. Після утворення пре-мікроРНК транспортується з ядра в цитоплазму, де від неї відрізується шпилька за допомогою ферменту дайсер (у Drosophila melanogaster та С.elegans для міРНК та мікроРНК існують різні ізоформи ферменту дайсер[6]). У багатьох, але не у всіх, випадках тільки один з лацюгів зрілої мікроРНК залишається в цитоплазмі і зв'язується із ферментативним RISC-комплексом[7]. Другий (пасажирський) ланцюг деградується РНКазами. Відомий також шлях процесингу мікроРНК, незалежний від дайсеру. У цьому випадку пре-мікроРНК ріжеться білком аргонавт 2.[8]

Функція

Принципова різниця між міРНК та мікроРНК полягає у тому, що у тварин послідовність мікроРНК не повністю комплементарна до послідовності мРНК-мішені, таким чином мікроРНК можуть інгібувати трансляцію із кількох різних мРНК, що містять схожі послідовності (у рослин як мікроРНК так і міРНК зазвичай повністю комплементарні до РНК-мішені). МікроРНК приєднуються до 3'-UTR (3'-кінцевої ділянки, що не транслюється) мРНК і викликають дестабілізацію комплексу ініціації трансляції на 5'-UTR[9].

МікроРНК відіграють важливу роль у пригніченні експресії інших генів та у регуляції розвитку, особливо у визначенні часу морфогенезу та підтриманні недиференційованих або не повністю диференційованих типів клітин, таких як стовбурові клітини.

Позаклітинні мікроРНК

Зрілі мікроРНК існують не тільки в цитоплазмі, а також і в біологічних ріднинах: плазмі крові, слині, сльозах, спинномозковій ріднині, сечі, грудному молоці, молозиві, амніотичній ріднині, семенній ріднині, ріднині порожнини живота, плевральній ріднині, а також в калі.[10][11] Позаклітинні мікроРНК дуже стабільні тому що знаходяться в екзосомах, або зв'язані з білком аргонавт або ліпопротеїнами високої щільності. Починаючи з 2008 р. багато зусиль було покладено на пошук кореляції між спектром ціркулюючих мікроРНК і раковими чи іншими захворюваннями, але встановити надійних біомаркерів поки не вдалося.[12][13][14] Не знайшла достатьної підтримки екзосомна модель міжклітинних комунікацій за рахунок мікроРНК.[15][16] Порівняння спектрів мікроРНК в грудному молоці людей та інших ссавців виявило спільні типи зустрічаємих мікроРНК, але можливий вплив молочної мікроРНК на розвиток новонароджених ще не знайдено.[17]

МікроРНК і мікробіота

В 2016 р. гарвардські вченні відкрили механізм формування флори кишечника через потрапляння фекальних мікроРНК, які виділяються епітелієм, всередину бактерій і регуляцію їх генів.[18] Виявилось, що специфічний набір мікроРНК виробляється та експортується в порожнину кишечника клітинами з поверхні епітелія, а також стовбуровими клітинами, які знаходяться в +4 шарі, разом з їх більш диференцованими нащадками з характерною експресією гена Hopx. Концентрація мікроРНК в клубовій кишкі більше ніж у товстій. Спектр типів мікроРНК в різних секціях травного тракту змінюється. Тести з найпоширенішими типами мікроРНК показали, що hsa-miR-515-5p прискорює рост кишечної бактерії Fusobacterium nucleatum специфічно діючи на її 16S рибосомну РНК. Інша мікроРНК — hsa-miR-1226-5p прискорює рост E. coli через взаємодію з мРНК транспортного білка YegH. Лабораторні миші з порушеням у виробництві фекальних мікроРНК дуже вразливі до коліту, але якщо їх годувати цими мікроРНК, то вдається зменьшити наслідки патології кишечника. Наступним кроком буде розробка лікувальних засобів на основі мікроРНК.[19][20]

Примітки

  1. ↑ Wang QL, Li ZH (2007). The functions of microRNAs in plants. Front. Biosci. 12: 3975—82. PMID 17485351.
  2. ↑ Zhao Y, Srivastava D (2007). A developmental view of microRNA function. Trends Biochem. Sci. 32 (4): 189—97. doi:10.1016/j.tibs.2007.02.006. PMID 17350266.
  3. ↑ Kozomara A, Griffiths-Jones S (2014). miRBase: annotating high confidence microRNAs using deep sequencing data. Nucl Acids Res. 42 (D1): D68—D73. doi:10.1093/nar/gkt1181. PMID 24275495.
  4. ↑ miRBase: the microRNA database. Манчестерський університет. Процитовано 17 січня 2016.
  5. ↑ The microRNAs of Caenorhabditis elegans http://cseweb.ucsd.edu/classes/wi05/cse206b/pub/burge_MiRscan.pdf
  6. ↑ Lee Y, Nakahara K, Pham J, Kim K, He Z, Sontheimer E, Carthew R (2004). Distinct roles for Drosophila Dicer-1 and Dicer-2 in the siRNA/miRNA silencing pathways. Cell. 117 (1): 69—81. doi:10.1016/S0092-8674(04)00261-2. PMID 15066283.
  7. ↑ Gregory R, Chendrimada T, Shiekhattar R (2006). MicroRNA biogenesis: isolation and characterization of the microprocessor complex. Methods Mol Biol. 342: 33—47. doi:10.1385/1-59745-123-1:33. PMID 16957365.
  8. ↑ Cheloufi S, Dos Santos CO, Chong MM, Hannon GJ. A dicer-independent miRNA biogenesis pathway that requires Ago catalysis // Nature. — 2010. — Вип. doi:10.1038/nature09092. — С. Published Online April 27, 2010.
  9. ↑ Pillai RS, Bhattacharyya SN, Filipowicz W (2007). Repression of protein synthesis by miRNAs: how many mechanisms?. Trends Cell Biol. 17 (3): 118—26. doi:10.1016/j.tcb.2006.12.007. PMID 17197185.
  10. ↑ Weber JA, Baxter DH, Zhang S, Huang DY, Huang KH, Lee MJ, Galas DJ, Wang K (2010). The microRNA spectrum in 12 body fluids. Clin Chem. 56 (11): 1733—1741. doi:10.1373/clinchem.2010.147405. PMID 20847327.
  11. ↑ Ahmed FE, Jeffries CD, Vos PW, Flake G, Nuovo GJ, Sinar DR, Naziri W, Marcuard SP (2009). Diagnostic microRNA markers for screening sporadic human colon cancer and active ulcerative colitis in stool and tissue. Cancer Genomics Proteomics. 6 (5): 281—295. PMID 19996134.
  12. ↑ Lawrie CH, Gal S, Dunlop HM, Pushkaran B, Liggins AP, Pulford K, Banham AH, Pezzella F, Boultwood J, Wainscoat JS, Hatton CS, Harris AL (2008). Detection of elevated levels of tumour-associated microRNAs in serum of patients with diffuse large B-cell lymphoma. Br J Haematol. 141 (5): 672—675. doi:10.1111/j.1365-2141.2008.07077.x. PMID 18318758.
  13. ↑ Leidner RS, Li L, Thompson CL (2013). Dampening Enthusiasm for Circulating MicroRNA in Breast Cancer. PLoS One. 8 (3): e57841. doi:10.1371/journal.pone.0057841. PMID 23472110.{{cite journal}}: Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
  14. ↑ Angelini TG, Emanueli C (2015). MicroRNAs as clinical biomarkers?. Front Genet. 6: 240. doi:10.3389/fgene.2015.00240. PMID 26236333.{{cite journal}}: Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
  15. ↑ Chevillet JR, Kang Q, Ruf IK, Briggs HA, Vojtech LN, Hughes SM, Cheng HH, Arroyo JD, Meredith EK, Gallichotte EN, Pogosova-Agadjanyan EL, Morrissey C, Stirewalt DL, Hladik F, Yu EY, Higano CS, Tewari M (2014). Quantitative and stoichiometric analysis of the microRNA content of exosomes. Proc Natl Acad Sci USA. 111 (41): 14888—14893. doi:10.1073/pnas.1408301111. PMID 25267620.
  16. ↑ Turchinovich A1, Tonevitsky AG, Cho WC, Burwinkel B (2015). Check and mate to exosomal extracellular miRNA: new lesson from a new approach. Front Mol Biosci. 2: 11. doi:10.3389/fmolb.2015.00011. PMID 25988178.{{cite journal}}: Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
  17. ↑ Simpson MR, Brede G, Johansen J, Johnsen R, Storrø O, Sætrom P, Øien T (2015). Human Breast Milk miRNA, Maternal Probiotic Supplementation and Atopic Dermatitis in Offspring. PLoS One. 10 (12): e0143496. doi:10.1371/journal.pone.0143496. PMID 26657066.{{cite journal}}: Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
  18. ↑ Liu S, da Cunha AP, Rezende RM, Cialic R, Wei Z, Bry L, Comstock LE, Gandhi R, Weiner HL (2016). The Host Shapes the Gut Microbiota via Fecal MicroRNA. Cell Host Microbe. 19 (1): 32—43. doi:10.1016/j.chom.2015.12.005. PMID 26764595.
  19. ↑ Maron DF (2016). Does our Microbiome Control Us or Do We Control It?. Scientific American.
  20. ↑ Mammals shape their microbiome to prevent disease (Пресреліз). Cell Press. 13 січня 2016. Процитовано 17 січня 2016.

Джерела

Сахарин Це незавершена стаття з молекулярної біології.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.
Складові частини
Рибонуклеїнові кислоти
(кодуючі та некодуючі)
Регуляторні:
Інші:
Дезоксирибонуклеїнові кислоти
Вектори клонування
Отримано з https://uk.wikipedia.org/w/index.php?title=МікроРНК&oldid=17433057