У 1977 році став головним тренером ФК «Сараєво». У 1980 році команда під його керівництвом Музуровича зайняла друге місце у чемпіонаті Югославії. Згодом після здобуття незалежності Боснії і Герцеговини він ще тричі займав посаду головного тренера ФК «Сараєво». У 1983—1984 роках Музурович тренував ФК «Приштина». З ним клуб домігся 8 місця, найкращого результату в чемпіонаті Югославії за всю історію клубу. Згодом, в 1987 році, став тренером турецького «Адана Демірспора».
З грудня 2006 року він вдруге очолив збірну Боснії та Герцеговини. Під час матчу з Мальтою 6 червня 2007 року в Музуровича стався серцевий напад. Через проблеми із здоров'ям та незадовільні результати у кваліфікації до Євро-2008 його звільнили з посади тренера.