Заснований 20 серпня1944 і відразу був прийнятий до ліги Майор. Дебют вийшов вдалим, у перші два сезони команда посідає четверті місця, а у третьому — чемпіон країни («Атланте» Мехіко) набрав на одне очко більше. Загалом, 40-ві та 50-ті роки 20 століття — «золота епоха» цієї команди. В сезоні 1947/48, у додаткових матчах, перемога над «Депортіво Оро» (Гвадалахара) і перший титул чемпіона Мексики. В наступному році до чемпіонських медалей «Леон» додав кубок Мексики. Лідером тієї команди був нападник Адальберто Лопес. 1950 року до клубу приходить найвідоміший футболіст в його історії — воротар Антоніо Карбахал. У 50-ті «Леон» двічі виграє чемпіонат і чотири рази виходить до фіналу національного кубка. З початку 60-х років команда починає втрачати лідируючі позиції. За наступні сорок років виграно лише один чемпіонат та три кубки (два — під керівництвом Карбахала). За підсумками літнього чемпіонату 2002 клуб понижується у класі. Десять років «Леон» грає у лізі де Ассенсо. В сезоні 2011/12 займає перше місце і повертається до Прімери.
Перед початком сезону 2012/13 займає девяту сходинку у зведеній таблиці чемпіонатів Мексики за набраними очками.[1] У рейтингу найкращих клубів Центральної та Північної Америки 20-го століття займає 29 місце.[2]
Антоніо Батталья (1944—1952) — захисник, відомий виступами за «Велес Сарсфілд».
Альфонсо Монтемайор (40-50 роки) — захисник, грав на чемпіонаті світу 1950.
Кабіньо (1982—1985) — нападник,34-є місце в рейтингу IFFHS «Найкращі бомбардири національних чемпіонатів світу»: 331 гол.[3]
Адальберто Лопес
Роберто Соломоне
Тіта
