RB1CC1

RB1CC1
Ідентифікатори
Символи	RB1CC1, ATG17, CC1, FIP200, PPP1R131, RB1 inducible coiled-coil 1
Зовнішні ІД	OMIM: 606837 MGI: 1341850 HomoloGene: 7659 GeneCards: RB1CC1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein kinase binding • GO:0032947 molecular adaptor activity Клітинна компонента • phagophore assembly site membrane • Ядерна мембрана • Atg1/ULK1 kinase complex • phagophore assembly site • клітинне ядро • цитоплазма • endoplasmic reticulum membrane • гіалоплазма • extrinsic component of membrane • лізосома Біологічний процес • positive regulation of protein phosphorylation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway • negative regulation of apoptotic process • autophagosome assembly • transcription, DNA-templated • heart development • positive regulation of cell size • клітинний цикл • liver development • macroautophagy • автофагія • positive regulation of JNK cascade • autophagy of mitochondrion • autophagy of peroxisome • reticulophagy • glycophagy • regulation of macroautophagy • piecemeal microautophagy of the nucleus Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9821	12421
Ensembl	ENSG00000023287	ENSMUSG00000025907
UniProt	Q8TDY2	Q9ESK9
RefSeq (мРНК)	NM_001083617 NM_014781	NM_009826
RefSeq (білок)	NP_001077086 NP_055596	NP_033956
Локус (UCSC)	Хр. 8: 52.62 – 52.75 Mb	Хр. 1: 6.21 – 6.28 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RB1CC1 (англ. RB1 inducible coiled-coil 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 594 амінокислот, а молекулярна маса — 183 091.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKLYVFLVNT		GTTLTFDTEL		TVQTVADLKH		AIQSKYKIAI		QHQVLVVNGG
ECMAADRRVC		TYSAGTDTNP		IFLFNKEMIL		CDRPPAIPKT		TFSTENDMEI
KVEESLMMPA		VFHTVASRTQ		LALEMYEVAK		KLCSFCEGLV		HDEHLQHQGW
AAIMANLEDC		SNSYQKLLFK		FESIYSNYLQ		SIEDIKLKLT		HLGTAVSVMA
KIPLLECLTR		HSYRECLGRL		DSLPEHEDSE		KAEMKRSTEL		VLSPDMPRTT
NESLLTSFPK		SVEHVSPDTA		DAESGKEIRE		SCQSTVHQQD		ETTIDTKDGD
LPFFNVSLLD		WINVQDRPND		VESLVRKCFD		SMSRLDPRII		RPFIAECRQT
IAKLDNQNMK		AIKGLEDRLY		ALDQMIASCG		RLVNEQKELA		QGFLANQKRA
ENLKDASVLP		DLCLSHANQL		MIMLQNHRKL		LDIKQKCTTA		KQELANNLHV
RLKWCCFVML		HADQDGEKLQ		ALLRLVIELL		ERVKIVEALS		TVPQMYCLAV
VEVVRRKMFI		KHYREWAGAL		VKDGKRLYEA		EKSKRESFGK		LFRKSFLRNR
LFRGLDSWPP		SFCTQKPRKF		DCELPDISLK		DLQFLQSFCP		SEVQPFLRVP
LLCDFEPLHQ		HVLALHNLVK		AAQSLDEMSQ		TITDLLSEQK		ASVSQTSPQS
ASSPRMESTA		GITTTTSPRT		PPPLTVQDPL		CPAVCPLEEL		SPDSIDAHTF
DFETIPHPNI		EQTIHQVSLD		LDSLAESPES		DFMSAVNEFV		IEENLSSPNP
ISDPQSPEMM		VESLYSSVIN		AIDSRRMQDT		NVCGKEDFGD		HTSLNVQLER
CRVVAQDSHF		SIQTIKEDLC		HFRTFVQKEQ		CDFSNSLKCT		AVEIRNIIEK
VKCSLEITLK		EKHQKELLSL		KNEYEGKLDG		LIKETEENEN		KIKKLKGELV
CLEEVLQNKD		NEFALVKHEK		EAVICLQNEK		DQKLLEMENI		MHSQNCEIKE
LKQSREIVLE		DLKKLHVEND		EKLQLLRAEL		QSLEQSHLKE		LEDTLQVRHI
QEFEKVMTDH		RVSLEELKKE		NQQIINQIQE		SHAEIIQEKE		KQLQELKLKV
SDLSDTRCKL		EVELALKEAE		TDEIKILLEE		SRAQQKETLK		SLLEQETENL
RTEISKLNQK		IQDNNENYQV		GLAELRTLMT		IEKDQCISEL		ISRHEEESNI
LKAELNKVTS		LHNQAFEIEK		NLKEQIIELQ		SKLDSELSAL		ERQKDEKITQ
QEEKYEAIIQ		NLEKDRQKLV		SSQEQDREQL		IQKLNCEKDE		AIQTALKEFK
LEREVVEKEL		LEKVKHLENQ		IAKSPAIDST		RGDSSSLVAE		LQEKLQEEKA
KFLEQLEEQE		KRKNEEMQNV		RTSLIAEQQT		NFNTVLTREK		MRKENIINDL
SDKLKSTMQQ		QERDKDLIES		LSEDRARLLE		EKKKLEEEVS		KLRSSSFVPS
PYVATAPELY		GACAPELPGE		SDRSAVETAD		EGRVDSAMET		SMMSVQENIH
MLSEEKQRIM		LLERTLQLKE		EENKRLNQRL		MSQSMSSVSS		RHSEKIAIRD
FQVGDLVLII		LDERHDNYVL		FTVSPTLYFL		HSESLPALDL		KPGEGASGAS
RRPWVLGKVM		EKEYCQAKKA		QNRFKVPLGT		KFYRVKAVSW		NKKV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, автофагія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Ueda H., Abbi S., Zheng C., Guan J.-L. (2000). Suppression of Pyk2 kinase and cellular activities by FIP200. J. Cell Biol. 149: 423—430. PMID 10769033 DOI:10.1083/jcb.149.2.423
• Chano T., Saeki Y., Serra M., Matsumoto K., Okabe H. (2002). Preferential expression of RB1-inducible coiled-coil 1 in terminal differentiated musculoskeletal cells. Am. J. Pathol. 161: 359—364. PMID 12163359 DOI:10.1016/S0002-9440(10)64190-9
• Chano T., Kontani K., Teramoto K., Okabe H., Ikegawa S. (2002). Truncating mutations of RB1CC1 in human breast cancer. Nat. Genet. 31: 285—288. PMID 12068296 DOI:10.1038/ng911
• Kobayashi S., Yoneda-Kato N., Itahara N., Yoshida A., Kato J.Y. (2013). The COP1 E3-ligase interacts with FIP200, a key regulator of mammalian autophagy. BMC Biochem. 14: 1—1. PMID 23289756 DOI:10.1186/1471-2091-14-1
• Gammoh N., Florey O., Overholtzer M., Jiang X. (2013). Interaction between FIP200 and ATG16L1 distinguishes ULK1 complex-dependent and -independent autophagy. Nat. Struct. Mol. Biol. 20: 144—149. PMID 23262492 DOI:10.1038/nsmb.2475

Див. також

• Хромосома 8