ATAD2

ATAD2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3DAI, 4QSP, 4QSQ, 4QSR, 4QSS, 4QST, 4QSU, 4QSV, 4QSW, 4QSX, 4QUT, 4QUU, 4TT2, 4TT4, 4TT6, 4TTE, 4TU4, 4TU6, 4TYL, 4TZ2, 4TZ8, 5A5N, 5A5O, 5A5P, 5A5Q, 5A5R, 5A81, 5A82, 5A83
Ідентифікатори
Символи	ATAD2, ANCCA, CT137, PRO2000, ATPase family, AAA domain containing 2, ATPase family AAA domain containing 2
Зовнішні ІД	OMIM: 611941 MGI: 1917722 HomoloGene: 6044 GeneCards: ATAD2
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • GO:0031493 histone binding • chromatin binding • hydrolase activity • ATP binding • ATPase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • екзосома • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	29028	70472
Ensembl	ENSG00000156802	ENSMUSG00000022360
UniProt	Q6PL18	Q8CDM1
RefSeq (мРНК)	NM_014109	NM_027435 NM_153199
RefSeq (білок)	NP_054828	NP_081711 NP_001391691 NP_001391693 NP_001391694 NP_001391695
Локус (UCSC)	Хр. 8: 123.32 – 123.42 Mb	Хр. 15: 57.96 – 58 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ATAD2 (англ. ATPase family, AAA domain containing 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 8-ій хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 390 амінокислот, а молекулярна маса — 158 554.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVVLRSSLEL		HNHSAASATG		SLDLSSDFLS		LEHIGRRRLR		SAGAAQKKPA
ATTAKAGDGS		SVKEVETYHR		TRALRSLRKD		AQNSSDSSFE		KNVEITEQLA
NGRHFTRQLA		RQQADKKKEE		HREDKVIPVT		RSLRARNIVQ		STEHLHEDNG
DVEVRRSCRI		RSRYSGVNQS		MLFDKLITNT		AEAVLQKMDD		MKKMRRQRMR
ELEDLGVFNE		TEESNLNMYT		RGKQKDIQRT		DEETTDNQEG		SVESSEEGED
QEHEDDGEDE		DDEDDDDDDD		DDDDDDDEDD		EDEEDGEEEN		QKRYYLRQRK
ATVYYQAPLE		KPRHQRKPNI		FYSGPASPAR		PRYRLSSAGP		RSPYCKRMNR
RRHAIHSSDS		TSSSSSEDEQ		HFERRRKRSR		NRAINRCLPL		NFRKDELKGI
YKDRMKIGAS		LADVDPMQLD		SSVRFDSVGG		LSNHIAALKE		MVVFPLLYPE
VFEKFKIQPP		RGCLFYGPPG		TGKTLVARAL		ANECSQGDKR		VAFFMRKGAD
CLSKWVGESE		RQLRLLFDQA		YQMRPSIIFF		DEIDGLAPVR		SSRQDQIHSS
IVSTLLALMD		GLDSRGEIVV		IGATNRLDSI		DPALRRPGRF		DREFLFSLPD
KEARKEILKI		HTRDWNPKPL		DTFLEELAEN		CVGYCGADIK		SICAEAALCA
LRRRYPQIYT		TSEKLQLDLS		SINISAKDFE		VAMQKMIPAS		QRAVTSPGQA
LSTVVKPLLQ		NTVDKILEAL		QRVFPHAEFR		TNKTLDSDIS		CPLLESDLAY
SDDDVPSVYE		NGLSQKSSHK		AKDNFNFLHL		NRNACYQPMS		FRPRILIVGE
PGFGQGSHLA		PAVIHALEKF		TVYTLDIPVL		FGVSTTSPEE		TCAQVIREAK
RTAPSIVYVP		HIHVWWEIVG		PTLKATFTTL		LQNIPSFAPV		LLLATSDKPH
SALPEEVQEL		FIRDYGEIFN		VQLPDKEERT		KFFEDLILKQ		AAKPPISKKK
AVLQALEVLP		VAPPPEPRSL		TAEEVKRLEE		QEEDTFRELR		IFLRNVTHRL
AIDKRFRVFT		KPVDPDEVPD		YVTVIKQPMD		LSSVISKIDL		HKYLTVKDYL
RDIDLICSNA		LEYNPDRDPG		DRLIRHRACA		LRDTAYAIIK		EELDEDFEQL
CEEIQESRKK		RGCSSSKYAP		SYYHVMPKQN		STLVGDKRSD		PEQNEKLKTP
STPVACSTPA		QLKRKIRKKS		NWYLGTIKKR		RKISQAKDDS		QNAIDHKIES
DTEETQDTSV		DHNETGNTGE		SSVEENEKQQ		NASESKLELR		NNSNTCNIEN
ELEDSRKTTA		CTELRDKIAC		NGDASSSQII		HISDENEGKE		MCVLRMTRAR
RSQVEQQQLI		TVEKALAILS		QPTPSLVVDH		ERLKNLLKTV		VKKSQNYNIF
QLENLYAVIS		QCIYRHRKDH		DKTSLIQKME		QEVENFSCSR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• De Angelis P.M., Svendsrud D.H., Kravik K.L., Stokke T. (2006). Cellular response to 5-fluorouracil (5-FU) in 5-FU-resistant colon cancer cell lines during treatment and recovery. Mol. Cancer. 5: 20—20. PMID 16709241 DOI:10.1186/1476-4598-5-20
• Fellenberg J., Bernd L., Delling G., Witte D., Zahlten-Hinguranage A. (2007). Prognostic significance of drug-regulated genes in high-grade osteosarcoma. Mod. Pathol. 20: 1085—1094. PMID 17660802 DOI:10.1038/modpathol.3800937
• Zou J.X., Revenko A.S., Li L.B., Gemo A.T., Chen H.-W. (2007). ANCCA, an estrogen-regulated AAA+ ATPase coactivator for ERalpha, is required for coregulator occupancy and chromatin modification. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 104: 18067—18072. PMID 17998543 DOI:10.1073/pnas.0705814104

Див. також

• Хромосома 8