PUM1: відмінності між версіями

PUM1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1IB2, 1M8W, 1M8X, 1M8Y, 1M8Z, 2YJY, 3BSB, 3BSX, 3Q0L, 3Q0M, 3Q0N, 3Q0O, 3Q0P
Ідентифікатори
Символи	PUM1, HSPUM, PUMH, PUMH1, PUML1, pumilio RNA binding family member 1, SCA47
Зовнішні ІД	OMIM: 607204 MGI: 1931749 HomoloGene: 22830 GeneCards: PUM1
Пов'язані генетичні захворювання
	spinocerebellar ataxia 47
Онтологія гена
Молекулярна функція	• mRNA 3'-UTR binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • RNA binding; • miRNA binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • P-body; • cytoplasmic stress granule; • клітинне ядро; • нуклеоплазма; • гіалоплазма; • nuclear speck;
Біологічний процес	• GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA; • диференціація клітин; • regulation of mRNA stability; • adult locomotory behavior; • GO:1905618 positive regulation of gene silencing by miRNA; • stem cell differentiation; • regulation of cell cycle; • posttranscriptional gene silencing; • regulation of chromosome segregation; • positive regulation of RIG-I signaling pathway; • mRNA destabilization; • Сперматогенез; • regulation of translation; • posttranscriptional regulation of gene expression; • production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	9698
	80912
	ENSG00000134644
	ENSMUSG00000028580
	Q14671
	Q80U78
	NM_014676; NM_001020658
	NM_001159603; NM_001159604; NM_001159605; NM_001159606; NM_030722
	NP_001018494; NP_055491
NP_001153075; NP_001153076; NP_001153077; NP_001153078; NP_109647;
	NP_001343493; NP_001343494; NP_001343495
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

Наступне редагування →

Вилучено вміст Додано вміст

ВізуальнийВікірозмітка

Лінійно

Версія за 10:20, 28 серпня 2017

PUM1 (англ. Pumilio RNA binding family member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 186 амінокислот, а молекулярна маса — 126 473^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
M S V A C V L K R K	A V L W Q D S F S P	H L K H H P Q E P A	N P N M P V V L T S	G T G S Q A Q P Q P
A A N Q A L A A G T	H S S P V P G S I G	V A G R S Q D D A M	V D Y F F Q R Q H G	E Q L G G G G S G G
G G Y N N S K H R W	P T G D N I H A E H	Q V R S M D E L N H	D F Q A L A L E G R	A M G E Q L L P G K
K F W E T D E S S K	D G P K G I F L G D	Q W R D S A W G T S	D H S V S Q P I M V	Q R R P G Q S F H V
N S E V N S V L S P	R S E S G G L G V S	M V E Y V L S S S P	G D S C L R K G G F	G P R D A D S D E N
D K G E K K N K G T	F D G D K L G D L K	E E G D V M D K T N	G L P V Q N G I D A	D V K D F S R T P G
N C Q N S A N E V D	L L G P N Q N G S E	G L A Q L T S T N G	A K P V E D F S N M	E S Q S V P L D P M
E H V G M E P L Q F	D Y S G T Q V P V D	S A A A T V G L F D	Y N S Q Q Q L F Q R	P N A L A V Q Q L T
A A Q Q Q Q Y A L A	A A H Q P H I G L A	P A A F V P N P Y I	I S A A P P G T D P	Y T A G L A A A A T
L G P A V V P H Q Y	Y G V T P W G V Y P	A S L F Q Q Q A A A	A A A A T N S A N Q	Q T T P Q A Q Q G Q
Q Q V L R G G A S Q	R P L T P N Q N Q Q	G Q Q T D P L V A A	A A V N S A L A F G	Q G L A A G M P G Y
P V L A P A A Y Y D	Q T G A L V V N A G	A R N G L G A P V R	L V A P A P V I I S	S S A A Q A A V A A
A A A S A N G A A G	G L A G T T N G P F	R P L G T Q Q P Q P	Q P Q Q Q P N N N L	A S S S F Y G N N S
L N S N S Q S S S L	F S Q G S A Q P A N	T S L G F G S S S S	L G A T L G S A L G	G F G T A V A N S N
T G S G S R R D S L	T G S S D L Y K R T	S S S L T P I G H S	F Y N G L S F S S S	P G P V G M P L P S
Q G P G H S Q T P P	P S L S S H G S S S	S L N L G G L T N G	S G R Y I S A A P G	A E A K Y R S A S S
A S S L F S P S S T	L F S S S R L R Y G	M S D V M P S G R S	R L L E D F R N N R	Y P N L Q L R E I A
G H I M E F S Q D Q	H G S R F I Q L K L	E R A T P A E R Q L	V F N E I L Q A A Y	Q L M V D V F G N Y
V I Q K F F E F G S	L E Q K L A L A E R	I R G H V L S L A L	Q M Y G C R V I Q K	A L E F I P S D Q Q
N E M V R E L D G H	V L K C V K D Q N G	N H V V Q K C I E C	V Q P Q S L Q F I I	D A F K G Q V F A L
S T H P Y G C R V I	Q R I L E H C L P D	Q T L P I L E E L H	Q H T E Q L V Q D Q	Y G N Y V I Q H V L
E H G R P E D K S K	I V A E I R G N V L	V L S Q H K F A S N	V V E K C V T H A S	R T E R A V L I D E
V C T M N D G P H S	A L Y T M M K D Q Y	A N Y V V Q K M I D	V A E P G Q R K I V	M H K I R P H I A T
L R K Y T Y G K H I	L A K L E K Y Y M K	N G V D L G P I C G	P P N G I I

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як регуляція трансляції, диференціація, сперматогенез, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

Spassov D.S., Jurecic R. (2002). Cloning and comparative sequence analysis of PUM1 and PUM2 genes, human members of the Pumilio family of RNA-binding proteins. Gene. 299: 195—204. PMID 12459267 DOI:10.1016/S0378-1119(02)01060-0
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Leibovich L., Mandel-Gutfreund Y., Yakhini Z. (2010). A structural-based statistical approach suggests a cooperative activity of PUM1 and miR-410 in human 3'-untranslated regions. Silence. 1: 17—17. PMID 20860814 DOI:10.1186/1758-907X-1-17
Filipovska A., Razif M.F., Nygaard K.K., Rackham O. (2011). A universal code for RNA recognition by PUF proteins. Nat. Chem. Biol. 7: 425—427. PMID 21572425 DOI:10.1038/nchembio.577
Miles W.O., Tschop K., Herr A., Ji J.Y., Dyson N.J. (2012). Pumilio facilitates miRNA regulation of the E2F3 oncogene. Genes Dev. 26: 356—368. PMID 22345517 DOI:10.1101/gad.182568.111
Wang X., Zamore P.D., Hall T.M.T. (2001). Crystal structure of a Pumilio homology domain. Mol. Cell. 7: 855—865. PMID 11336708 DOI:10.1016/S1097-2765(01)00229-5

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з PUM1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14957 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q14671 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з PUM1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14957 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.

[UniProt-5] UniProt, Q14671 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

PUM1: відмінності між версіями

Версія за 10:20, 28 серпня 2017

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук