RBM15: відмінності між версіями

RBM15
Ідентифікатори
Символи	RBM15, OTT, OTT1, SPEN, RNA binding motif protein 15, Putative RNA-binding protein 15
Зовнішні ІД	OMIM: 606077 MGI: 2443205 HomoloGene: 23383 GeneCards: RBM15
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • nucleic acid binding; • RNA binding; • mRNA binding;
Клітинна компонента	• nuclear speck; • Ядерна мембрана; • мембрана; • клітинне ядро; • нуклеоплазма; • nuclear envelope; • RNA N6-methyladenosine methyltransferase complex;
Біологічний процес	• branching involved in blood vessel morphogenesis; • ventricular septum morphogenesis; • mRNA splicing, via spliceosome; • placenta blood vessel development; • GO:0022415 viral process; • negative regulation of myeloid cell differentiation; • spleen development; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of transcription of Notch receptor target; • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome; • RNA methylation; • dosage compensation by inactivation of X chromosome; • thrombopoietin-mediated signaling pathway; • regulation of megakaryocyte differentiation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	64783
	229700
	ENSG00000162775
	ENSMUSG00000048109
	Q96T37
	Q0VBL3
	NM_001201545; NM_022768; NM_014092
	NM_001045807
	NP_001188474; NP_073605
	NP_001039272
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

Наступне редагування →

Вилучено вміст Додано вміст

ВізуальнийВікірозмітка

Лінійно

Версія за 11:31, 28 серпня 2017

RBM15 (англ. RNA binding motif protein 15) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 977 амінокислот, а молекулярна маса — 107 189^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
M R T A G R D P V P	R R S P R W R R A V	P L C E T S A G R R	V T Q L R G D D L R	R P A T M K G K E R
S P V K A K R S R G	G E D S T S R G E R	S K K L G G S G G S	N G S S S G K T D S	G G G S R R S L H L
D K S S S R G G S R	E Y D T G G G S S S	S R L H S Y S S P S	T K N S S G G G E S	R S S S R G G G G E
S R S S G A A S S A	P G G G D G A E Y K	T L K I S E L G S Q	L S D E A V E D G L	F H E F K R F G D V
S V K I S H L S G S	G S G D E R V A F V	N F R R P E D A R A	A K H A R G R L V L	Y D R P L K I E A V
Y V S R R R S R S P	L D K D T Y P P S A	S V V G A S V G G H	R H P P G G G G G Q	R S L S P G G A A L
G Y R D Y R L Q Q L	A L G R L P P P P P	P P L P R D L E R E	R D Y P F Y E R V R	P A Y S L E P R V G
A G A G A A P F R E	V D E I S P E D D Q	R A N R T L F L G N	L D I T V T E S D L	R R A F D R F G V I
T E V D I K R P S R	G Q T S T Y G F L K	F E N L D M S H R A	K L A M S G K I I I	R N P I K I G Y G K
A T P T T R L W V G	G L G P W V P L A A	L A R E F D R F G T	I R T I D Y R K G D	S W A Y I Q Y E S L
D A A H A A W T H M	R G F P L G G P D R	R L R V D F A D T E	H R Y Q Q Q Y L Q P	L P L T H Y E L V T
D A F G H R A P D P	L R G A R D R T P P	L L Y R D R D R D L	Y P D S D W V P P P	P P V R E R S T R T
A A T S V P A Y E P	L D S L D R R R D G	W S L D R D R G D R	D L P S S R D Q P R	K R R L P E E S G G
R H L D R S P E S D	R P R K R H C A P S	P D R S P E L S S S	R D R Y N S D N D R	S S R L L L E R P S
P I R D R R G S L E	K S Q G D K R D R K	N S A S A E R D R K	H R T T A P T E G K	S P L K K E D R S D
G S A P S T S T A S	S K L K S P S Q K Q	D G G T A P V A S A	S P K L C L A W Q G	M L L L K N S N F P
S N M H L L Q G D L	Q V A S S L L V E G	S T G G K V A Q L K	I T Q R L R L D Q P	K L D E V T R R I K
V A G P N G Y A I L	L A V P G S S D S R	S S S S S A A S D T	A T S T Q R P L R N	L V S Y L K Q K Q A
A G V I S L P V G G	N K D K E N T G V L	H A F P P C E F S Q	Q F L D S P A K A L	A K S E E D Y L V M
I I V R G F G F Q I	G V R Y E N K K R E	N L A L T L L

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Lee J.H., Skalnik D.G. (2012). Rbm15-Mkl1 interacts with the Setd1b histone H3-Lys4 methyltransferase via a SPOC domain that is required for cytokine-independent proliferation. PLoS ONE. 7: E42965—E42965. PMID 22927943 DOI:10.1371/journal.pone.0042965

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14959 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q96T37 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14959 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q96T37 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

RBM15: відмінності між версіями

Версія за 11:31, 28 серпня 2017

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук