PTPN23: відмінності між версіями

PTPN23
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3RAU, 5CRV, 5CRU
Ідентифікатори
Символи	PTPN23, HD-PTP, HDPTP, PTP-TD14, protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 23, protein tyrosine phosphatase non-receptor type 23, NEDBASS
Зовнішні ІД	OMIM: 606584 MGI: 2144837 HomoloGene: 135706 GeneCards: PTPN23
Онтологія гена
Молекулярна функція	• phosphoprotein phosphatase activity; • GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • protein tyrosine phosphatase activity; • protein kinase binding; • hydrolase activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • ciliary basal body; • ендосома; • cell projection; • війка; • нуклеоплазма; • early endosome; • екзосома; • цитоскелет; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • клітинне ядро; • ядерні тільця; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• positive regulation of homophilic cell adhesion; • cilium assembly; • regulation of cell migration; • GO:0016576 protein dephosphorylation; • positive regulation of adherens junction organization; • cell projection organization; • protein transport; • positive regulation of early endosome to late endosome transport; • ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway; • negative regulation of epithelial cell migration; • GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання; • peptidyl-tyrosine dephosphorylation; • early endosome to late endosome transport; • positive regulation of Wnt protein secretion; • GO:0015915 транспорт; • endocytic recycling; • cellular response to cytokine stimulus;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	25930
	104831
	ENSG00000076201
	ENSMUSG00000036057
	Q9H3S7
	Q6PB44
	NM_001304482; NM_015466
	NM_001081043
	NP_001291411; NP_056281
	NP_001074512
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

Наступне редагування →

Вилучено вміст Додано вміст

ВізуальнийВікірозмітка

Лінійно

Версія за 14:48, 30 серпня 2017

PTPN23 (англ. Protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 23) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 636 амінокислот, а молекулярна маса — 178 974^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
M E A V P R M P M I	W L D L K E A G D F	H F Q P A V K K F V	L K N Y G E N P E A	Y N E E L K K L E L
L R Q N A V R V P R	D F E G C S V L R K	Y L G Q L H Y L Q S	R V P M G S G Q E A	A V P V T W T E I F
S G K S V A H E D I	K Y E Q A C I L Y N	L G A L H S M L G A	M D K R V S E E G M	K V S C T H F Q C A
A G A F A Y L R E H	F P Q A Y S V D M S	R Q I L T L N V N L	M L G Q A Q E C L L	E K S M L D N R K S
F L V A R I S A Q V	V D Y Y K E A C R A	L E N P D T A S L L	G R I Q K D W K K L	V Q M K I Y Y F A A
V A H L H M G K Q A	E E Q Q K F G E R V	A Y F Q S A L D K L	N E A I K L A K G Q	P D T V Q D A L R F
T M D V I G G K Y N	S A K K D N D F I Y	H E A V P A L D T L	Q P V K G A P L V K	P L P V N P T D P A
V T G P D I F A K L	V P M A A H E A S S	L Y S E E K A K L L	R E M M A K I E D K	N E V L D Q F M D S
M Q L D P E T V D N	L D A Y S H I P P Q	L M E K C A A L S V	R P D T V R N L V Q	S M Q V L S G V F T
D V E A S L K D I R	D L L E E D E L L E	Q K F Q E A V G Q A	G A I S I T S K A E	L A E V R R E W A K
Y M E V H E K A S F	T N S E L H R A M N	L H V G N L R L L S	G P L D Q V R A A L	P T P A L S P E D K
A V L Q N L K R I L	A K V Q E M R D Q R	V S L E Q Q L R E L	I Q K D D I T A S L	V T T D H S E M K K
L F E E Q L K K Y D	Q L K V Y L E Q N L	A A Q D R V L C A L	T E A N V Q Y A A V	R R V L S D L D Q K
W N S T L Q T L V A	S Y E A Y E D L M K	K S Q E G R D F Y A	D L E S K V A A L L	E R T Q S T C Q A R
E A A R Q Q L L D R	E L K K K P P P R P	T A P K P L L P R R	E E S E A V E A G D	P P E E L R S L P P
D M V A G P R L P D	T F L G S A T P L H	F P P S P F P S S T	G P G P H Y L S G P	L P P G T Y S G P T
Q L I Q P R A P G P	H A M P V A P G P A	L Y P A P A Y T P E	L G L V P R S S P Q	H G V V S S P Y V G
V G P A P P V A G L	P S A P P P Q F S G	P E L A M A V R P A	T T T V D S I Q A P	I P S H T A P R P N
P T P A P P P P C F	P V P P P Q P L P T	P Y T Y P A G A K Q	P I P A Q H H F S S	G I P A G F P A P R
I G P Q P Q P H P Q	P H P S Q A F G P Q	P P Q Q P L P L Q H	P H L F P P Q A P G	L L P P Q S P Y P Y
A P Q P G V L G Q P	P P P L H T Q L Y P	G P A Q D P L P A H	S G A L P F P S P G	P P Q P P H P P L A
Y G P A P S T R P M	G P Q A A P L T I R	G P S S A G Q S T P	S P H L V P S P A P	S P G P G P V P P R
P P A A E P P P C L	R R G A A A A D L L	S S S P E S Q H G G	T Q S P G G G Q P L	L Q P T K V D A A E
G R R P Q A L R L I	E R D P Y E H P E R	L R Q L Q Q E L E A	F R G Q L G D V G A	L D T V W R E L Q D
A Q E H D A R G R S	I A I A R C Y S L K	N R H Q D V M P Y D	S N R V V L R S G K	D D Y I N A S C V E
G L S P Y C P P L V	A T Q A P L P G T A	A D F W L M V H E Q	K V S V I V M L V S	E A E M E K Q K V A
R Y F P T E R G Q P	M V H G A L S L A L	S S V R S T E T H V	E R V L S L Q F R D	Q S L K R S L V H L
H F P T W P E L G L	P D S P S N L L R F	I Q E V H A H Y L H	Q R P L H T P I I V	H C S S G V G R T G
A F A L L Y A A V Q	E V E A G N G I P E	L P Q L V R R M R Q	Q R K H M L Q E K L	H L R F C Y E A V V
R H V E Q V L Q R H	G V P P P C K P L A	S A S I S Q K N H L	P Q D S Q D L V L G	G D V P I S S I Q A
T I A K L S I R P P	G G L E S P V A S L	P G P A E P P G L P	P A S L P E S T P I	P S S S P P P L S S
P L P E A P Q P K E	E P P V P E A P S S	G P P S S S L E L L	A S L T P E A F S L	D S S L R G K Q R M
S K H N F L Q A H N	G Q G L R A T R P S	D D P L S L L D P L	W T L N K T

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеїн-фосфатаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, біогенез та деградація війок, поліморфізм. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, клітинних відростках, війках, цитоплазматичних везикулах, ендосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 143—150. PMID 10819331 DOI:10.1093/dnares/7.2.143
Doyotte A., Mironov A., McKenzie E., Woodman P. (2008). The Bro1-related protein HD-PTP/PTPN23 is required for endosomal cargo sorting and multivesicular body morphogenesis. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 105: 6308—6313. PMID 18434552 DOI:10.1073/pnas.0707601105
Tanase C.A. (2010). Histidine domain-protein tyrosine phosphatase interacts with Grb2 and GrpL. PLoS ONE. 5: E14339—E14339. PMID 21179510 DOI:10.1371/journal.pone.0014339

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14406 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9H3S7 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 3

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14406 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q9H3S7 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

PTPN23: відмінності між версіями

Версія за 14:48, 30 серпня 2017

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук