VPS25: відмінності між версіями

VPS25
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2ZME, 3CUQ, 3HTU
Ідентифікатори
Символи	VPS25, DERP9, EAP20, FAP20, vacuolar protein sorting 25 homolog
Зовнішні ІД	OMIM: 610907 MGI: 106354 HomoloGene: 6303 GeneCards: VPS25
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein homodimerization activity; • protein N-terminus binding; • structural molecule activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • ендосома; • мембрана; • нуклеоплазма; • endosome membrane; • екзосома; • клітинне ядро; • ESCRT II complex;
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • multivesicular body assembly; • transcription, DNA-templated; • endosomal transport; • protein transport; • protein transport to vacuole involved in ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway; • macroautophagy; • negative regulation of epidermal growth factor-activated receptor activity; • GO:0015915 транспорт; • multivesicular body sorting pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	84313
	28084
	ENSG00000131475
	ENSMUSG00000078656
	Q9BRG1
	Q9CQ80
	NM_032353
	NM_001284411; NM_001284412; NM_001284414; NM_026776
	NP_115729; NP_115729.1
	NP_001271340; NP_001271341; NP_001271343; NP_081052
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

Наступне редагування →

Вилучено вміст Додано вміст

ВізуальнийВікірозмітка

Лінійно

Версія за 09:34, 12 вересня 2017

VPS25 (англ. Vacuolar protein sorting 25 homolog) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 176 амінокислот, а молекулярна маса — 20 748^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
M A M S F E W P W Q	Y R F P P F F T L Q	P N V D T R Q K Q L	A A W C S L V L S F	C R L H K Q S S M T
V M E A Q E S P L F	N N V K L Q R K L P	V E S I Q I V L E E	L R K K G N L E W L	D K S K S S F L I M
W R R P E E W G K L	I Y Q W V S R S G Q	N N S V F T L Y E L	T N G E D T E D E E	F H G L D E A T L L
R A L Q A L Q Q E H	K A E I I T V S D G	R G V K F F

Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, транспорт, транспорт білків. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мембрані, ендосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Martin-Serrano J., Yarovoy A., Perez-Caballero D., Bieniasz P.D. (2003). Divergent retroviral late-budding domains recruit vacuolar protein sorting factors by using alternative adaptor proteins. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 12414—12419. PMID 14519844 DOI:10.1073/pnas.2133846100
Slater R., Bishop N.E. (2006). Genetic structure and evolution of the Vps25 family, a yeast ESCRT-II component. BMC Evol. Biol. 6: 59—59. PMID 16889659 DOI:10.1186/1471-2148-6-59
Pincetic A., Medina G., Carter C., Leis J. (2008). Avian sarcoma virus and human immunodeficiency virus, type 1 use different subsets of ESCRT proteins to facilitate the budding process. J. Biol. Chem. 283: 29822—29830. PMID 18723511 DOI:10.1074/jbc.M804157200
Im Y.J., Hurley J.H. (2008). Integrated structural model and membrane targeting mechanism of the human ESCRT-II complex. Dev. Cell. 14: 902—913. PMID 18539118 DOI:10.1016/j.devcel.2008.04.004
Im Y.J., Wollert T., Boura E., Hurley J.H. (2009). Structure and function of the ESCRT-II-III interface in multivesicular body biogenesis. Dev. Cell. 17: 234—243. PMID 19686684 DOI:10.1016/j.devcel.2009.07.008

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:28122 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9BRG1 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 17

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:28122 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q9BRG1 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

VPS25: відмінності між версіями

Версія за 09:34, 12 вересня 2017

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук