ATAD2: відмінності між версіями

ATAD2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3DAI, 4QSP, 4QSQ, 4QSR, 4QSS, 4QST, 4QSU, 4QSV, 4QSW, 4QSX, 4QUT, 4QUU, 4TT2, 4TT4, 4TT6, 4TTE, 4TU4, 4TU6, 4TYL, 4TZ2, 4TZ8, 5A5N, 5A5O, 5A5P, 5A5Q, 5A5R, 5A81, 5A82, 5A83
Ідентифікатори
Символи	ATAD2, ANCCA, CT137, PRO2000, ATPase family, AAA domain containing 2, ATPase family AAA domain containing 2
Зовнішні ІД	OMIM: 611941 MGI: 1917722 HomoloGene: 6044 GeneCards: ATAD2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding; • GO:0031493 histone binding; • chromatin binding; • hydrolase activity; • ATP binding; • ATPase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding;
Клітинна компонента	• екзосома; • клітинне ядро; • нуклеоплазма;
Біологічний процес	• GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • transcription, DNA-templated; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	29028
	70472
	ENSG00000156802
	ENSMUSG00000022360
	Q6PL18
	Q8CDM1
	NM_014109
	NM_027435; NM_153199
	NP_054828
	NP_081711; NP_001391691; NP_001391693; NP_001391694; NP_001391695
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

Наступне редагування →

Вилучено вміст Додано вміст

ВізуальнийВікірозмітка

Лінійно

Версія за 10:25, 19 вересня 2017

ATAD2 (англ. ATPase family, AAA domain containing 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 8-ї хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 390 амінокислот, а молекулярна маса — 158 554^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
M V V L R S S L E L	H N H S A A S A T G	S L D L S S D F L S	L E H I G R R R L R	S A G A A Q K K P A
A T T A K A G D G S	S V K E V E T Y H R	T R A L R S L R K D	A Q N S S D S S F E	K N V E I T E Q L A
N G R H F T R Q L A	R Q Q A D K K K E E	H R E D K V I P V T	R S L R A R N I V Q	S T E H L H E D N G
D V E V R R S C R I	R S R Y S G V N Q S	M L F D K L I T N T	A E A V L Q K M D D	M K K M R R Q R M R
E L E D L G V F N E	T E E S N L N M Y T	R G K Q K D I Q R T	D E E T T D N Q E G	S V E S S E E G E D
Q E H E D D G E D E	D D E D D D D D D D	D D D D D D D E D D	E D E E D G E E E N	Q K R Y Y L R Q R K
A T V Y Y Q A P L E	K P R H Q R K P N I	F Y S G P A S P A R	P R Y R L S S A G P	R S P Y C K R M N R
R R H A I H S S D S	T S S S S S E D E Q	H F E R R R K R S R	N R A I N R C L P L	N F R K D E L K G I
Y K D R M K I G A S	L A D V D P M Q L D	S S V R F D S V G G	L S N H I A A L K E	M V V F P L L Y P E
V F E K F K I Q P P	R G C L F Y G P P G	T G K T L V A R A L	A N E C S Q G D K R	V A F F M R K G A D
C L S K W V G E S E	R Q L R L L F D Q A	Y Q M R P S I I F F	D E I D G L A P V R	S S R Q D Q I H S S
I V S T L L A L M D	G L D S R G E I V V	I G A T N R L D S I	D P A L R R P G R F	D R E F L F S L P D
K E A R K E I L K I	H T R D W N P K P L	D T F L E E L A E N	C V G Y C G A D I K	S I C A E A A L C A
L R R R Y P Q I Y T	T S E K L Q L D L S	S I N I S A K D F E	V A M Q K M I P A S	Q R A V T S P G Q A
L S T V V K P L L Q	N T V D K I L E A L	Q R V F P H A E F R	T N K T L D S D I S	C P L L E S D L A Y
S D D D V P S V Y E	N G L S Q K S S H K	A K D N F N F L H L	N R N A C Y Q P M S	F R P R I L I V G E
P G F G Q G S H L A	P A V I H A L E K F	T V Y T L D I P V L	F G V S T T S P E E	T C A Q V I R E A K
R T A P S I V Y V P	H I H V W W E I V G	P T L K A T F T T L	L Q N I P S F A P V	L L L A T S D K P H
S A L P E E V Q E L	F I R D Y G E I F N	V Q L P D K E E R T	K F F E D L I L K Q	A A K P P I S K K K
A V L Q A L E V L P	V A P P P E P R S L	T A E E V K R L E E	Q E E D T F R E L R	I F L R N V T H R L
A I D K R F R V F T	K P V D P D E V P D	Y V T V I K Q P M D	L S S V I S K I D L	H K Y L T V K D Y L
R D I D L I C S N A	L E Y N P D R D P G	D R L I R H R A C A	L R D T A Y A I I K	E E L D E D F E Q L
C E E I Q E S R K K	R G C S S S K Y A P	S Y Y H V M P K Q N	S T L V G D K R S D	P E Q N E K L K T P
S T P V A C S T P A	Q L K R K I R K K S	N W Y L G T I K K R	R K I S Q A K D D S	Q N A I D H K I E S
D T E E T Q D T S V	D H N E T G N T G E	S S V E E N E K Q Q	N A S E S K L E L R	N N S N T C N I E N
E L E D S R K T T A	C T E L R D K I A C	N G D A S S S Q I I	H I S D E N E G K E	M C V L R M T R A R
R S Q V E Q Q Q L I	T V E K A L A I L S	Q P T P S L V V D H	E R L K N L L K T V	V K K S Q N Y N I F
Q L E N L Y A V I S	Q C I Y R H R K D H	D K T S L I Q K M E	Q E V E N F S C S R

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
De Angelis P.M., Svendsrud D.H., Kravik K.L., Stokke T. (2006). Cellular response to 5-fluorouracil (5-FU) in 5-FU-resistant colon cancer cell lines during treatment and recovery. Mol. Cancer. 5: 20—20. PMID 16709241 DOI:10.1186/1476-4598-5-20
Fellenberg J., Bernd L., Delling G., Witte D., Zahlten-Hinguranage A. (2007). Prognostic significance of drug-regulated genes in high-grade osteosarcoma. Mod. Pathol. 20: 1085—1094. PMID 17660802 DOI:10.1038/modpathol.3800937
Zou J.X., Revenko A.S., Li L.B., Gemo A.T., Chen H.-W. (2007). ANCCA, an estrogen-regulated AAA+ ATPase coactivator for ERalpha, is required for coregulator occupancy and chromatin modification. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 104: 18067—18072. PMID 17998543 DOI:10.1073/pnas.0705814104

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30123 (англ.) . Процитовано 19 вересня 2017.
↑ UniProt, Q6PL18 (англ.) . Процитовано 19 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 8

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30123 (англ.) . Процитовано 19 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q6PL18 (англ.) . Процитовано 19 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

ATAD2: відмінності між версіями

Версія за 10:25, 19 вересня 2017

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук