NPAS4: відмінності між версіями

NPAS4
Ідентифікатори
Символи	NPAS4, Le-PAS, NXF, PASD10, bHLHe79, neuronal PAS domain protein 4
Зовнішні ІД	OMIM: 608554 MGI: 2664186 HomoloGene: 15333 GeneCards: NPAS4
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • protein dimerization activity; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • protein heterodimerization activity; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• postsynapse; • transcription regulator complex; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • cellular response to corticosterone stimulus; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated; • transcription by RNA polymerase II; • нейробіологія розвитку; • навчення; • короткочасна пам'ять; • довготривала пам'ять; • диференціація клітин; • regulation of synaptic transmission, GABAergic; • соціальна поведінка; • regulation of synaptic plasticity; • excitatory postsynaptic potential; • Гальмівний постсинаптичний потенціал; • inhibitory synapse assembly; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	266743
	225872
	ENSG00000174576
	ENSMUSG00000045903
	Q8IUM7
	Q8BGD7
	NM_178864; NM_001318804
	NM_153553
	NP_001305733; NP_849195
	NP_705781
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

Наступне редагування →

Вилучено вміст Додано вміст

ВізуальнийВікірозмітка

Лінійно

Версія за 14:09, 19 вересня 2017

NPAS4 (англ. Neuronal PAS domain protein 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 11-ї хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 802 амінокислот, а молекулярна маса — 87 117^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
M Y R S T K G A S K	A R R D Q I N A E I	R N L K E L L P L A	E A D K V R L S Y L	H I M S L A C I Y T
R K G V F F A G G T	P L A G P T G L L S	A Q E L E D I V A A	L P G F L L V F T A	E G K L L Y L S E S
V S E H L G H S M V	D L V A Q G D S I Y	D I I D P A D H L T	V R Q Q L T L P S A	L D T D R L F R C R
F N T S K S L R R Q	S A G N K L V L I R	G R F H A H P P G A	Y W A G N P V F T A	F C A P L E P R P R
P G P G P G P G P A	S L F L A M F Q S R	H A K D L A L L D I	S E S V L I Y L G F	E R S E L L C K S W
Y G L L H P E D L A	H A S A Q H Y R L L	A E S G D I Q A E M	V V R L Q A K T G G	W A W I Y C L L Y S
E G P E G P I T A N	N Y P I S D M E A W	S L R Q Q L N S E D	T Q A A Y V L G T P	T M L P S F P E N I
L S Q E E C S S T N	P L F T A A L G A P	R S T S F P S A P E	L S V V S A S E E L	P R P S K E L D F S
Y L T F P S G P E P	S L Q A E L S K D L	V C T P P Y T P H Q	P G G C A F L F S L	H E P F Q T H L P T
P S S T L Q E Q L T	P S T A T F S D Q L	T P S S A T F P D P	L T S P L Q G Q L T	E T S V R S Y E D Q
L T P C T S T F P D	Q L L P S T A T F P	E P L G S P A H E Q	L T P P S T A F Q A	H L D S P S Q T F P
E Q L S P N P T K T	Y F A Q E G C S F L	Y E K L P P S P S S	P G N G D C T L L A	L A Q L R G P L S V
D V P L V P E G L L	T P E A S P V K Q S	F F H Y S E K E Q N	E I D R L I Q Q I S	Q L A Q G M D R P F
S A E A G T G G L E	P L G G L E P L D S	N L S L S G A G P P	V L S L D L K P W K	C Q E L D F L A D P
D N M F L E E T P V	E D I F M D L S T P	D P S E E W G S G D	P E A E G P G G A P	S P C N N L S P E D
H S F L E D L A T Y	E T A F E T G V S A	F P Y D G F T D E L	H Q L Q S Q V Q D S	F H E D G S G G E P
T F

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Ooe N., Saito K., Mikami N., Nakatuka I., Kaneko H. (2004). Identification of a novel basic helix-loop-helix-PAS factor, NXF, reveals a Sim2 competitive, positive regulatory role in dendritic-cytoskeleton modulator drebrin gene expression. Mol. Cell. Biol. 24: 608—616. PMID 14701734 DOI:10.1128/MCB.24.2.608-616.2004
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Bersten D.C., Bruning J.B., Peet D.J., Whitelaw M.L. (2014). Human variants in the neuronal basic helix-loop-helix/Per-Arnt-Sim (bHLH/PAS) transcription factor complex NPAS4/ARNT2 disrupt function. PLoS ONE. 9: E85768—E85768. PMID 24465693 DOI:10.1371/journal.pone.0085768

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18983 (англ.) . Процитовано 19 вересня 2017.
↑ UniProt, Q8IUM7 (англ.) . Процитовано 19 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 11

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18983 (англ.) . Процитовано 19 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q8IUM7 (англ.) . Процитовано 19 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

NPAS4: відмінності між версіями

Версія за 14:09, 19 вересня 2017

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук