EFCAB1

EFCAB1
Ідентифікатори
Символи	CLXN, EF-hand calcium binding domain 1, ODAD5, EFCAB1, calaxin
Зовнішні ІД	MGI: 1914043 HomoloGene: 11608 GeneCards: CLXN
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	79645	66793
Ensembl	ENSG00000034239	ENSMUSG00000068617
UniProt	Q9HAE3	Q9D3N2
RefSeq (мРНК)	NM_001142857 NM_024593 NM_001363973 NM_001363974	NM_025769
RefSeq (білок)	NP_001136329 NP_078869 NP_001350902 NP_001350903	NP_080045
Локус (UCSC)	Хр. 8: 48.71 – 48.74 Mb	Хр. 16: 14.72 – 14.8 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

EFCAB1 (англ. EF-hand calcium binding domain 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 8-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 211 амінокислот, а молекулярна маса — 24 488.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNRKKLQKLT		DTLTKNCKHF		NKFEVNCLIK		LFYDLVGGVE		RQGLVVGLDR
NAFRNILHVT		FGMTDDMIMD		RVFRGFDKDN		DGCVNVLEWI		HGLSLFLRGS
LEEKMKYCFE		VFDLNGDGFI		SKEEMFHMLK		NSLLKQPSEE		DPDEGIKDLV
EITLKKMDHD		HDGKLSFADY		ELAVREETLL		LEAFGPCLPD		PKSQMEFEAQ
VFKDPNEFND		M

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Sasaki, K., Shiba, K., Nakamura, A. et al. Calaxin is required for cilia-driven determination of vertebrate laterality. Commun. Biol. 2, 226 (2019). https://doi.org/10.1038/s42003-019-0462-y

Див. також

• Хромосома 8