SAMHD1
Перейти до навігації
Перейти до пошуку
SAMHD1 (англ. SAM and HD domain containing deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 626 амінокислот, а молекулярна маса — 72 201[5].
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MQRADSEQPS | KRPRCDDSPR | TPSNTPSAEA | DWSPGLELHP | DYKTWGPEQV | ||||
CSFLRRGGFE | EPVLLKNIRE | NEITGALLPC | LDESRFENLG | VSSLGERKKL | ||||
LSYIQRLVQI | HVDTMKVIND | PIHGHIELHP | LLVRIIDTPQ | FQRLRYIKQL | ||||
GGGYYVFPGA | SHNRFEHSLG | VGYLAGCLVH | ALGEKQPELQ | ISERDVLCVQ | ||||
IAGLCHDLGH | GPFSHMFDGR | FIPLARPEVK | WTHEQGSVMM | FEHLINSNGI | ||||
KPVMEQYGLI | PEEDICFIKE | QIVGPLESPV | EDSLWPYKGR | PENKSFLYEI | ||||
VSNKRNGIDV | DKWDYFARDC | HHLGIQNNFD | YKRFIKFARV | CEVDNELRIC | ||||
ARDKEVGNLY | DMFHTRNSLH | RRAYQHKVGN | IIDTMITDAF | LKADDYIEIT | ||||
GAGGKKYRIS | TAIDDMEAYT | KLTDNIFLEI | LYSTDPKLKD | AREILKQIEY | ||||
RNLFKYVGET | QPTGQIKIKR | EDYESLPKEV | ASAKPKVLLD | VKLKAEDFIV | ||||
DVINMDYGMQ | EKNPIDHVSF | YCKTAPNRAI | RITKNQVSQL | LPEKFAEQLI | ||||
RVYCKKVDRK | SLYAARQYFV | QWCADRNFTK | PQDGDVIAPL | ITPQKKEWND | ||||
STSVQNPTRL | REASKSRVQL | FKDDPM |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, противірусний захист, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.
Література[ред. | ред. код]
- Li N., Zhang W., Cao X. (2000). Identification of human homologue of mouse IFN-gamma induced protein from human dendritic cells. Immunol. Lett. 74: 221—224. PMID 11064105 DOI:10.1016/S0165-2478(00)00276-5
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Liao W., Bao Z., Cheng C., Mok Y.-K., Wong W.S. (2008). Dendritic cell-derived interferon-gamma-induced protein mediates tumor necrosis factor-alpha stimulation of human lung fibroblasts. Proteomics. 8: 2640—2650. PMID 18546154 DOI:10.1002/pmic.200700954
- Welbourn S., Miyagi E., White T.E., Diaz-Griffero F., Strebel K. (2012). Identification and characterization of naturally occurring splice variants of SAMHD1. Retrovirology. 9: 86—86. PMID 23092512 DOI:10.1186/1742-4690-9-86
- Ravenscroft J.C., Suri M., Rice G.I., Szynkiewicz M., Crow Y.J. (2011). Autosomal dominant inheritance of a heterozygous mutation in SAMHD1 causing familial chilblain lupus. Am. J. Med. Genet. A. 155: 235—237. PMID 21204240 DOI:10.1002/ajmg.a.33778
Примітки[ред. | ред. код]
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з SAMHD1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15925 (англ.) . Архів оригіналу за 4 квітня 2015. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9Y3Z3 (англ.) . Архів оригіналу за 23 квітня 2018. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також[ред. | ред. код]
Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |