SORCS2

SORCS2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1WGO
Ідентифікатори
Символи	SORCS2, sortilin related VPS10 domain containing receptor 2
Зовнішні ІД	OMIM: 606284 MGI: 1932289 HomoloGene: 56899 GeneCards: SORCS2
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння
Онтологія гена Молекулярна функція • neuropeptide receptor activity Клітинна компонента • мембрана • integral component of membrane • integral component of plasma membrane • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • early endosome membrane • recycling endosome membrane Біологічний процес • neuropeptide signaling pathway • intracellular protein transport • Довготривале пригнічення Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57537	81840
Ensembl	ENSG00000184985	ENSMUSG00000029093
UniProt	Q96PQ0	Q9EPR5
RefSeq (мРНК)	NM_020777	NM_030889
RefSeq (білок)	NP_065828	NP_112151
Локус (UCSC)	Хр. 4: 7.19 – 7.74 Mb	Хр. 5: 36.17 – 36.56 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SORCS2 (англ. Sortilin related VPS10 domain containing receptor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 4-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 159 амінокислот, а молекулярна маса — 128 152.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAHRGPSRAS		KGPGPTARAP		SPGAPPPPRS		PRSRPLLLLL		LLLGACGAAG
RSPEPGRLGP		HAQLTRVPRS		PPAGRAEPGG		GEDRQARGTE		PGAPGPSPGP
APGPGEDGAP		AAGYRRWERA		APLAGVASRA		QVSLISTSFV		LKGDATHNQA
MVHWTGENSS		VILILTKYYH		ADMGKVLESS		LWRSSDFGTS		YTKLTLQPGV
TTVIDNFYIC		PTNKRKVILV		SSSLSDRDQS		LFLSADEGAT		FQKQPIPFFV
ETLIFHPKEE		DKVLAYTKES		KLYVSSDLGK		KWTLLQERVT		KDHVFWSVSG
VDADPDLVHV		EAQDLGGDFR		YVTCAIHNCS		EKMLTAPFAG		PIDHGSLTVQ
DDYIFFKATS		ANQTKYYVSY		RRNEFVLMKL		PKYALPKDLQ		IISTDESQVF
VAVQEWYQMD		TYNLYQSDPR		GVRYALVLQD		VRSSRQAEES		VLIDILEVRG
VKGVFLANQK		IDGKVMTLIT		YNKGRDWDYL		RPPSMDMNGK		PTNCKPPDCH
LHLHLRWADN		PYVSGTVHTK		DTAPGLIMGA		GNLGSQLVEY		KEEMYITSDC
GHTWRQVFEE		EHHILYLDHG		GVIVAIKDTS		IPLKILKFSV		DEGLTWSTHN
FTSTSVFVDG		LLSEPGDETL		VMTVFGHISF		RSDWELVKVD		FRPSFSRQCG
EEDYSSWELS		NLQGDRCIMG		QQRSFRKRKS		TSWCIKGRSF		TSALTSRVCE
CRDSDFLCDY		GFERSSSSES		STNKCSANFW		FNPLSPPDDC		ALGQTYTSSL
GYRKVVSNVC		EGGVDMQQSQ		VQLQCPLTPP		RGLQVSIQGE		AVAVRPGEDV
LFVVRQEQGD		VLTTKYQVDL		GDGFKAMYVN		LTLTGEPIRH		RYESPGIYRV
SVRAENTAGH		DEAVLFVQVN		SPLQALYLEV		VPVIGLNQEV		NLTAVLLPLN
PNLTVFYWWI		GHSLQPLLSL		DNSVTTRFSD		TGDVRVTVQA		ACGNSVLQDS
RVLRVLDQFQ		VMPLQFSKEL		DAYNPNTPEW		REDVGLVVTR		LLSKETSVPQ
ELLVTVVKPG		LPTLADLYVL		LPPPRPTRKR		SLSSDKRLAA		IQQVLNAQKI
SFLLRGGVRV		LVALRDTGTG		AEQLGGGGGY		WAVVVLFVIG		LFAAGAFILY
KFKRKRPGRT		VYAQMHNEKE		QEMTSPVSHS		EDVQGAVQGN		HSGVVLSINS
REMHSYLVS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Локалізований у мембрані.

Література

• Hampe W., Rezgaoui M., Hermans-Borgmeyer I., Schaller H.C. (2001). The genes for the human VPS10 domain-containing receptors are large and contain many small exons. Hum. Genet. 108: 529—536. PMID 11499680 DOI:10.1007/s004390100504
• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65

Див. також

• Хромосома 4