ITCH: відмінності між версіями

ITCH
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2DMV, 2KYK, 2NQ3, 2P4R, 2YSF, 3TUG, 4ROF, 5CQ2, 5DWS, 5DZD, 5C7M
Ідентифікатори
Символи	ITCH, AIF4, AIP4, NAPP1, dJ468O1.1, ADMFD, itchy E3 ubiquitin protein ligase
Зовнішні ІД	OMIM: 606409 MGI: 1202301 HomoloGene: 88442 GeneCards: ITCH
Пов'язані генетичні захворювання
	syndromic multisystem autoimmune disease due to ICTH deficiency
Онтологія гена
Молекулярна функція	• CXCR chemokine receptor binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • ribonucleoprotein complex binding; • ubiquitin-like protein transferase activity; • transferase activity; • ligase activity; • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity; • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity; • ubiquitin-like protein ligase binding; • arrestin family protein binding;
Клітинна компонента	• гіалоплазма; • екзосома; • клітинна мембрана; • мембрана; • нуклеоплазма; • клітинне ядро; • cell cortex; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • цитоплазма; • early endosome; • ендосома; • endosome membrane; • early endosome membrane; • GO:0009327 protein-containing complex; • внутрішньоклітинна мембранна органела;
Біологічний процес	• Сигнальний шлях Notch; • protein K29-linked ubiquitination; • процес імунної системи; • protein K63-linked ubiquitination; • negative regulation of apoptotic process; • defense response to virus; • regulation of cell growth; • viral entry into host cell; • negative regulation of type I interferon production; • inflammatory response; • GO:0022415 viral process; • nucleotide-binding oligomerization domain containing signaling pathway; • GO:0097285 апоптоз; • вроджений імунітет; • protein polyubiquitination; • positive regulation of T cell anergy; • ubiquitin-dependent protein catabolic process; • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity; • GO:1903364 positive regulation of protein catabolic process; • negative regulation of JNK cascade; • negative regulation of alpha-beta T cell proliferation; • negative regulation of defense response to virus; • protein K48-linked ubiquitination; • regulation of protein deubiquitination; • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process; • regulation of hematopoietic stem cell differentiation; • Убіквітин-залежний протеоліз; • protein autoubiquitination; • positive regulation of receptor catabolic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	83737
	16396
	ENSG00000078747
	ENSMUSG00000027598
	Q96J02
	Q8C863
	NM_001257137; NM_001257138; NM_031483; NM_001324197; NM_001324198
	NM_001243712; NM_008395
	NP_001244066; NP_001244067; NP_001311126; NP_001311127; NP_113671
	NP_001230641; NP_032421
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

Наступне редагування →

Вилучено вміст Додано вміст

ВізуальнийВікірозмітка

Лінійно

Версія за 14:25, 21 вересня 2017

ITCH (англ. Itchy E3 ubiquitin protein ligase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 20-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 903 амінокислот, а молекулярна маса — 102 803^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
M S D S G S Q L G S	M G S L T M K S Q L	Q I T V I S A K L K	E N K K N W F G P S	P Y V E V T V D G Q
S K K T E K C N N T	N S P K W K Q P L T	V I V T P V S K L H	F R V W S H Q T L K	S D V L L G T A A L
D I Y E T L K S N N	M K L E E V V V T L	Q L G G D K E P T E	T I G D L S I C L D	G L Q L E S E V V T
N G E T T C S E N G	V S L C L P R L E C	N S A I S A H C N L	C L P G L S D S P I	S A S R V A G F T G
A S Q N D D G S R S	K D E T R V S T N G	S D D P E D A G A G	E N R R V S G N N S	P S L S N G G F K P
S R P P R P S R P P	P P T P R R P A S V	N G S P S A T S E S	D G S S T G S L P P	T N T N T N T S E G
A T S G L I I P L T	I S G G S G P R P L	N P V T Q A P L P P	G W E Q R V D Q H G	R V Y Y V D H V E K
R T T W D R P E P L	P P G W E R R V D N	M G R I Y Y V D H F	T R T T T W Q R P T	L E S V R N Y E Q W
Q L Q R S Q L Q G A	M Q Q F N Q R F I Y	G N Q D L F A T S Q	S K E F D P L G P L	P P G W E K R T D S
N G R V Y F V N H N	T R I T Q W E D P R	S Q G Q L N E K P L	P E G W E M R F T V	D G I P Y F V D H N
R R T T T Y I D P R	T G K S A L D N G P	Q I A Y V R D F K A	K V Q Y F R F W C Q	Q L A M P Q H I K I
T V T R K T L F E D	S F Q Q I M S F S P	Q D L R R R L W V I	F P G E E G L D Y G	G V A R E W F F L L
S H E V L N P M Y C	L F E Y A G K D N Y	C L Q I N P A S Y I	N P D H L K Y F R F	I G R F I A M A L F
H G K F I D T G F S	L P F Y K R I L N K	P V G L K D L E S I	D P E F Y N S L I W	V K E N N I E E C D
L E M Y F S V D K E	I L G E I K S H D L	K P N G G N I L V T	E E N K E E Y I R M	V A E W R L S R G V
E E Q T Q A F F E G	F N E I L P Q Q Y L	Q Y F D A K E L E V	L L C G M Q E I D L	N D W Q R H A I Y R
H Y A R T S K Q I M	W F W Q F V K E I D	N E K R M R L L Q F	V T G T C R L P V G	G F A D L M G S N G
P Q K F C I E K V G	K E N W L P R S H T	C F N R L D L P P Y	K S Y E Q L K E K L	L F A I E E T E G F
G Q E

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, убіквітинування білків, противірусний захист, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Slagsvold T., Marchese A., Brech A., Stenmark H. (2006). CISK attenuates degradation of the chemokine receptor CXCR4 via the ubiquitin ligase AIP4. EMBO J. 25: 3738—3749. PMID 16888620 DOI:10.1038/sj.emboj.7601267
Chastagner P., Israel A., Brou C. (2006). Itch/AIP4 mediates Deltex degradation through the formation of K29-linked polyubiquitin chains. EMBO Rep. 7: 1147—1153. PMID 17028573 DOI:10.1038/sj.embor.7400822
Lee T.-L., Shyu Y.-C., Hsu T.-Y., Shen C.-K.J. (2008). Itch regulates p45/NF-E2 in vivo by Lys63-linked ubiquitination. Biochem. Biophys. Res. Commun. 375: 326—330. PMID 18718448 DOI:10.1016/j.bbrc.2008.07.164
Chastagner P., Israel A., Brou C. (2008). AIP4/Itch regulates Notch receptor degradation in the absence of ligand. PLoS ONE. 3: E2735—E2735. PMID 18628966 DOI:10.1371/journal.pone.0002735
Shembade N., Parvatiyar K., Harhaj N.S., Harhaj E.W. (2009). The ubiquitin-editing enzyme A20 requires RNF11 to downregulate NF-kappaB signalling. EMBO J. 28: 513—522. PMID 19131965 DOI:10.1038/emboj.2008.285

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з ITCH переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13890 (англ.) . Процитовано 21 вересня 2017.
↑ UniProt, Q96J02 (англ.) . Процитовано 21 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 20

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з ITCH переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13890 (англ.) . Процитовано 21 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, Q96J02 (англ.) . Процитовано 21 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

ITCH: відмінності між версіями

Версія за 14:25, 21 вересня 2017

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук