ALKBH8

ALKBH8
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2CQ2, 3THP, 3THT
Ідентифікатори
Символи	ALKBH8, ABH8, TRM9, TRMT9, alkB homolog 8, tRNA methyltransferase, TRMT9A, MRT71
Зовнішні ІД	OMIM: 613306 MGI: 1914917 HomoloGene: 44488 GeneCards: ALKBH8
шифр КФ	2.1.1.229
Онтологія гена Молекулярна функція • 2-oxoglutarate-dependent dioxygenase activity • GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity • transferase activity • tRNA binding • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • каталітична активність • RNA binding • oxidoreductase activity • ferrous iron binding • nucleic acid binding • tRNA (uracil) methyltransferase activity • iron ion binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • нуклеоплазма • клітинне ядро • ядерні тільця Біологічний процес • cellular response to DNA damage stimulus • Метилювання • обмін речовин • tRNA wobble uridine modification • tRNA methylation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	91801	67667
Ensembl	ENSG00000137760	ENSMUSG00000025899
UniProt	Q96BT7	Q80Y20
RefSeq (мРНК)	NM_001301010 NM_138775 NM_001378133	NM_026303
RefSeq (білок)	NP_001287939 NP_620130 NP_001365062	NP_080579 NP_001391965 NP_001391966 NP_001391967
Локус (UCSC)	Хр. 11: 107.5 – 107.57 Mb	Хр. 9: 3.34 – 3.39 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ALKBH8 (англ. AlkB homolog 8, tRNA methyltransferase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 11-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 664 амінокислот, а молекулярна маса — 75 208.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDSNHQSNYK		LSKTEKKFLR		KQIKAKHTLL		RHEGIETVSY		ATQSLVVANG
GLGNGVSRNQ		LLPVLEKCGL		VDALLMPPNK		PYSFARYRTT		EESKRAYVTL
NGKEVVDDLG		QKITLYLNFV		EKVQWKELRP		QALPPGLMVV		EEIISSEEEK
MLLESVDWTE		DTDNQNSQKS		LKHRRVKHFG		YEFHYENNNV		DKDKPLSGGL
PDICESFLEK		WLRKGYIKHK		PDQMTINQYE		PGQGIPAHID		THSAFEDEIV
SLSLGSEIVM		DFKHPDGIAV		PVMLPRRSLL		VMTGESRYLW		THGITCRKFD
TVQASESLKS		GIITSDVGDL		TLSKRGLRTS		FTFRKVRQTP		CNCSYPLVCD
SQRKETPPSF		PESDKEASRL		EQEYVHQVYE		EIAGHFSSTR		HTPWPHIVEF
LKALPSGSIV		ADIGCGNGKY		LGINKELYMI		GCDRSQNLVD		ICRERQFQAF
VCDALAVPVR		SGSCDACISI		AVIHHFATAE		RRVAALQEIV		RLLRPGGKAL
IYVWAMEQEY		NKQKSKYLRG		NRNSQGKKEE		MNSDTSVQRS		LVEQMRDMGS
RDSASSVPRI		NDSQEGGCNS		RQVSNSKLPV		HVNRTSFYSQ		DVLVPWHLKG
NPDKGKPVEP		FGPIGSQDPS		PVFHRYYHVF		REGELEGACR		TVSDVRILQS
YYDQGNWCVI		LQKA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, трансфераз, метилтрансфераз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном заліза, РНК, S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 11