ATAT1

ATAT1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3VWD, 3VWE, 4B5O, 4B5P, 4GS4, 4IF5, 4PK2, 4PK3, 4U9Y, 4U9Z
Ідентифікатори
Символи	ATAT1, C6orf134, MEC17, Nbla00487, TAT, alpha-TAT, alpha-TAT1, alpha tubulin acetyltransferase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 615556 MGI: 1913869 HomoloGene: 15129 GeneCards: ATAT1
Онтологія гена Молекулярна функція • tubulin N-acetyltransferase activity • acyltransferase activity • transferase activity • lysine N-acetyltransferase activity, acting on acetyl phosphate as donor Клітинна компонента • Цитоскелет • Веретено поділу • cell projection • mitotic spindle • мембрана • мікротрубочка • microtubule bundle • clathrin-coated pit • аксон • Міжклітинні контакти • focal adhesion • комплекс Ґольджі • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • Сперматогенез • regulation of fat cell differentiation • alpha-tubulin acetylation • dentate gyrus development • positive regulation of NLRP3 inflammasome complex assembly • cilium assembly • regulation of microtubule cytoskeleton organization • neuron development Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	79969	73242
Ensembl	ENSG00000235658 ENSG00000234549 ENSG00000229061 ENSG00000223752 ENSG00000206488 ENSG00000231257 ENSG00000137343	ENSMUSG00000024426
UniProt	Q5SQI0	Q8K341
RefSeq (мРНК)	NM_001031722 NM_001190724 NM_001254952 NM_024909 NM_001318762 NM_001318763	NM_001142744 NM_001142745 NM_028476 NM_001347378 NM_001357865
RefSeq (білок)	NP_001026892 NP_001177653 NP_001241881 NP_001305691 NP_001305692 NP_079185	NP_001136216 NP_001136217 NP_001334307 NP_082752 NP_001344794
Локус (UCSC)	Хр. 6: 30.63 – 30.65 Mb	Хр. 17: 35.9 – 35.91 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ATAT1 (англ. Alpha tubulin acetyltransferase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 6-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 421 амінокислот, а молекулярна маса — 46 810.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEFPFDVDAL		FPERITVLDQ		HLRPPARRPG		TTTPARVDLQ		QQIMTIIDEL
GKASAKAQNL		SAPITSASRM		QSNRHVVYIL		KDSSARPAGK		GAIIGFIKVG
YKKLFVLDDR		EAHNEVEPLC		ILDFYIHESV		QRHGHGRELF		QYMLQKERVE
PHQLAIDRPS		QKLLKFLNKH		YNLETTVPQV		NNFVIFEGFF		AHQHRPPAPS
LRATRHSRAA		AVDPTPAAPA		RKLPPKRAEG		DIKPYSSSDR		EFLKVAVEPP
WPLNRAPRRA		TPPAHPPPRS		SSLGNSPERG		PLRPFVPEQE		LLRSLRLCPP
HPTARLLLAA		DPGGSPAQRR		RTRGTPPGLV		AQSCCYSRHG		GVNSSSPNTG
NQDSKQGEQE		TKNRSASEEQ		ALSQDGSGEK		PMHTAPPQAP		APPAQSWTVG
GDILNARFIR		NLQERRSTRP		W

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, ацилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг, метилювання. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клатрин-вкритих заглибинах мембрани, клітинних контактах, клітинних відростках.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Shida T., Cueva J.G., Xu Z., Goodman M.B., Nachury M.V. (2010). The major alpha-tubulin K40 acetyltransferase alphaTAT1 promotes rapid ciliogenesis and efficient mechanosensation. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 107: 21517—21522. PMID 21068373 DOI:10.1073/pnas.1013728107
• Soppina V., Herbstman J.F., Skiniotis G., Verhey K.J. (2012). Luminal localization of alpha-tubulin K40 acetylation by cryo-EM analysis of fab-labeled microtubules. PLoS ONE. 7: E48204—E48204. PMID 23110214 DOI:10.1371/journal.pone.0048204
• Taschner M., Vetter M., Lorentzen E. (2012). Atomic resolution structure of human alpha-tubulin acetyltransferase bound to acetyl-CoA. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 109: 19649—19654. PMID 23071318 DOI:10.1073/pnas.1209343109
• Friedmann D.R., Aguilar A., Fan J., Nachury M.V., Marmorstein R. (2012). Structure of the alpha-tubulin acetyltransferase, alphaTAT1, and implications for tubulin-specific acetylation. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 109: 19655—19660. PMID 23071314 DOI:10.1073/pnas.1209357109

Див. також

• Хромосома 6