BCOR

BCOR
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3BIM, 4HPL, 2N1L
Ідентифікатори
Символи	BCOR, ANOP2, MAA2, MCOPS2, BCL6 corepressor
Зовнішні ІД	OMIM: 300485 MGI: 1918708 HomoloGene: 9809 GeneCards: BCOR
Онтологія гена Молекулярна функція • heat shock protein binding • transcription factor binding • histone deacetylase binding • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding Клітинна компонента • PcG protein complex • клітинне ядро • BCOR complex Біологічний процес • roof of mouth development • negative regulation of bone mineralization • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of histone H3-K36 methylation • histone H2A monoubiquitination • negative regulation of tooth mineralization • transcription, DNA-templated • odontogenesis • specification of axis polarity • heart development • negative regulation of histone H3-K4 methylation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • blastocyst hatching Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	54880	71458
Ensembl	ENSG00000183337	ENSMUSG00000040363
UniProt	Q6W2J9	Q8CGN4
RefSeq (мРНК)	NM_001123383 NM_001123384 NM_001123385 NM_001130139 NM_017745 NM_020926	NM_001168321 NM_029510 NM_175044 NM_175045 NM_175046
RefSeq (білок)	NP_001116855 NP_001116856 NP_001116857 NP_060215	NP_001161793 NP_083786 NP_778209 NP_778210 NP_778211
Локус (UCSC)	Хр. X: 40.05 – 40.18 Mb	Хр. X: 11.9 – 12.03 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

BCOR (англ. BCL6 corepressor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 755 амінокислот, а молекулярна маса — 192 189.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLSATPLYGN		VHSWMNSERV		RMCGASEDRK		ILVNDGDASK		ARLELREENP
LNHNVVDAST		AHRIDGLAAL		SMDRTGLIRE		GLRVPGNIVY		SSLCGLGSEK
GREAATSTLG		GLGFSSERNP		EMQFKPNTPE		TVEASAVSGK		PPNGFSAIYK
TPPGIQKSAV		ATAEALGLDR		PASDKQSPLN		INGASYLRLP		WVNPYMEGAT
PAIYPFLDSP		NKYSLNMYKA		LLPQQSYSLA		QPLYSPVCTN		GERFLYLPPP
HYVGPHIPSS		LASPMRLSTP		SASPAIPPLV		HCADKSLPWK		MGVSPGNPVD
SHAYPHIQNS		KQPRVPSAKA		VTSGLPGDTA		LLLPPSPRPS		PRVHLPTQPA
ADTYSEFHKH		YARISTSPSV		ALSKPYMTVS		SEFPAARLSN		GKYPKAPEGG
EGAQPVPGHA		RKTAVQDRKD		GSSPPLLEKQ		TVTKDVTDKP		LDLSSKVVDV
DASKADHMKK		MAPTVLVHSR		AGSGLVLSGS		EIPKETLSPP		GNGCAIYRSE
IISTAPSSWV		VPGPSPNEEN		NGKSMSLKNK		ALDWAIPQQR		SSSCPRMGGT
DAVITNVSGS		VSSAGRPASA		SPAPNANADG		TKTSRSSVET		TPSVIQHVGQ
PPATPAKHSS		STSSKGAKAS		NPEPSFKANE		NGLPPSSIFL		SPNEAFRSPP
IPYPRSYLPY		PAPEGIAVSP		LSLHGKGPVY		PHPVLLPNGS		LFPGHLAPKP
GLPYGLPTGR		PEFVTYQDAL		GLGMVHPMLI		PHTPIEITKE		EKPERRSRSH
ERARYEDPTL		RNRFSEILET		SSTKLHPDVP		TDKNLKPNPN		WNQGKTVVKS
DKLVYVDLLR		EEPDAKTDTN		VSKPSFAAES		VGQSAEPPKP		SVEPALQQHR
DFIALREELG		RISDFHETYT		FKQPVFTVSK		DSVLAGTNKE		NLGLPVSTPF
LEPPLGSDGP		AVTFGKTQED		PKPFCVGSAP		PSVDVTPTYT		KDGADEAESN
DGKVLKPKPS		KLAKRIANSA		GYVGDRFKCV		TTELYADSSQ		LSREQRALQM
EGLQEDSILC		LPAAYCERAM		MRFSELEMKE		REGGHPATKD		SEMCKFSPAD
WERLKGNQDK		KPKSVTLEEA		IAEQNESERC		EYSVGNKHRD		PFEAPEDKDL
PVEKYFVERQ		PVSEPPADQV		ASDMPHSPTL		RVDRKRKVSG		DSSHTETTAE
EVPEDPLLKA		KRRRVSKDDW		PEREMTNSSS		NHLEDPHYSE		LTNLKVCIEL
TGLHPKKQRH		LLHLRERWEQ		QVSAADGKPG		RQSRKEVTQA		TQPEAIPQGT
NITEEKPGRK		RAEAKGNRSW		SEESLKPSDN		EQGLPVFSGS		PPMKSLSSTS
AGGKKQAQPS		CAPASRPPAK		QQKIKENQKT		DVLCADEEED		CQAASLLQKY
TDNSEKPSGK		RLCKTKHLIP		QESRRGLPLT		GEYYVENADG		KVTVRRFRKR
PEPSSDYDLS		PAKQEPKPFD		RLQQLLPASQ		STQLPCSSSP		QETTQSRPMP
PEARRLIVNK		NAGETLLQRA		ARLGYEEVVL		YCLENKICDV		NHRDNAGYCA
LHEACARGWL		NIVRHLLEYG		ADVNCSAQDG		TRPLHDAVEN		DHLEIVRLLL
SYGADPTLAT		YSGRTIMKMT		HSELMEKFLT		DYLNDLQGRN		DDDASGTWDF
YGSSVCEPDD		ESGYDVLANP		PGPEDQDDDD		DAYSDVFEFE		FSETPLLPCY
NIQVSVAQGP		RNWLLLSDVL		KKLKMSSRIF		RCNFPNVEIV		TIAEAEFYRQ
VSASLLFSCS		KDLEAFNPES		KELLDLVEFT		NEIQTLLGSS		VEWLHPSDLA
SDNYW

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 DOI:10.1093/dnares/7.4.271
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Gearhart M.D., Corcoran C.M., Wamstad J.A., Bardwell V.J. (2006). Polycomb group and SCF ubiquitin ligases are found in a novel BCOR complex that is recruited to BCL6 targets. Mol. Cell. Biol. 26: 6880—6889. PMID 16943429 DOI:10.1128/MCB.00630-06
• Huynh K.D., Fischle W., Verdin E., Bardwell V.J. (2000). BCoR, a novel corepressor involved in BCL-6 repression. Genes Dev. 14: 1810—1823. PMID 10898795

Див. також

• Хромосома X