C1orf106

C1orf106
Ідентифікатори
Символи	INAVA, chromosome 1 open reading frame 106, C1orf106, innate immunity activator
Зовнішні ІД	OMIM: 618051 MGI: 1921579 HomoloGene: 10103 GeneCards: INAVA
Пов'язані генетичні захворювання
неспецифічний виразковий коліт
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • клітинне ядро • цитоплазма Біологічний процес • pattern recognition receptor signaling pathway • cytokine production involved in immune response • response to peptidoglycan • response to muramyl dipeptide • positive regulation of interleukin-1 beta production • positive regulation of interleukin-10 production • positive regulation of interleukin-6 production • positive regulation of stress-activated MAPK cascade • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • nucleotide-binding oligomerization domain containing 2 signaling pathway • reactive oxygen species biosynthetic process • процес імунної системи • вроджений імунітет • positive regulation of protein ubiquitination • adherens junction maintenance • intestinal epithelial structure maintenance Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55765	67313
Ensembl	ENSG00000163362	ENSMUSG00000041605
UniProt	Q3KP66	Q7TN12
RefSeq (мРНК)	NM_001142569 NM_018265 NM_001367289 NM_001367290	NM_028872
RefSeq (білок)	NP_001136041 NP_060735 NP_001354218 NP_001354219	NP_083148 NP_001392081 NP_001392082 NP_001392083
Локус (UCSC)	Хр. 1: 200.89 – 200.92 Mb	Хр. 1: 136.14 – 136.16 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

C1orf106 (англ. Chromosome 1 open reading frame 106) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 663 амінокислот, а молекулярна маса — 72 914.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLQMPKLNEI		PPGRAGRREA		RGEGRWPGQT		GPEAARLEWR		AQGQAGGARA
PWDSWGSSRL		PTQPGPGWSR		CPPSLLCALS		FQKSTMESKD		EVSDTDSGII
LQSGPDSPVS		PMKELTHAVH		KQQRALEARL		EACLEELRRL		CLREAELTGT
LPAEYPLKPG		EKAPKVRRRI		GAAYKLDDWA		LHREDPLSSL		ERQLALQLQI
TEAARRLCLE		ENLSRQARRQ		RKHSMLQEEK		KLQELQRCLV		ERRRNSEPPP
AAALPLGREL		SASDDSSLSD		GLLLEEEESQ		VPKPPPESPA		PPSRPLPPQT
LEGLQPTGPE		AGSPERAPVQ		NSPWKETSLD		HPYEKPRKSS		EPWSESSSPA
TTPQDGPSAS		SLWLLEPASY		HVVPIRGVPG		QWQGRTSAPA		TPEIQGRRGQ
SQSLRVDSFR		AGPEGRGRSA		FPRRRPTHYT		VTVPDSCFPA		TKPPLPHAAC
HSCSEDSGSD		VSSISHPTSP		GSSSPDISFL		QPLSPPKTHR		HRGAWVPAGS
RELVAHHPKL		LLPPGYFPAG		RYVVVAESPL		PPGEWELRRA		APGPAYEEEG
TPLRYQRLVP		SRSRIVRTPS		LKDSPAGRGL		SKAAVSEELK		WWHERARLRS
TRPHSLDRQG		AFRVRSLPLG		REGFGRALGP		RAQVPTVCVL		RRSPDGAPVQ
VFVPEKGEII		SQV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 1