CABP1

CABP1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2K7B, 2K7C, 2K7D, 2LAN, 2LAP, 3OX5, 3OX6
Ідентифікатори
Символи	CABP1, CALBRAIN, HCALB_BR, calcium binding protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 605563 HomoloGene: 128292 GeneCards: CABP1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0048551 enzyme inhibitor activity • calcium ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nuclear localization sequence binding • calcium-dependent protein binding • зв'язування з іоном металу Клітинна компонента • цитоплазма • perinuclear region of cytoplasm • міжклітинні контакти • Golgi membrane • клітинна мембрана • postsynaptic membrane • комплекс Ґольджі • cell cortex • синапс • цитоскелет • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • мембрана • міжклітинний простір Біологічний процес • negative regulation of protein import into nucleus • GO:0048553 negative regulation of catalytic activity • зір • відповідь на стимул Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9478	171051
Ensembl	ENSG00000157782	ENSRNOG00000001173
UniProt	Q9NZU7	O88751
RefSeq (мРНК)	NM_031205 NM_001033677 NM_004276	NM_001033675 NM_001033676 NM_133529
RefSeq (білок)	NP_001028849 NP_004267 NP_112482	NP_001028847 NP_001028848 NP_598213
Локус (UCSC)	Хр. 12: 120.64 – 120.67 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CABP1 (англ. Calcium binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 370 амінокислот, а молекулярна маса — 39 838.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGGGDGAAFK		RPGDGARLQR		VLGLGSRREP		RSLPAGGPAP		RRTAPPPPGH
ASAGPAAMSS		HIAKSESKTS		LLKAAAAAAS		GGSRAPRHGP		ARDPGLPSRR
LPGSCPATPQ		SSGDPSSRRP		LCRPAPREEG		ARGSQRVLPQ		AHCRPREALP
AAASRPSPSS		PLPPARGRDG		EERGLSPALG		LRGSLRARGR		GDSVPAAASE
ADPFLHRLRP		MLSSAFGQDR		SLRPEEIEEL		REAFREFDKD		KDGYINCRDL
GNCMRTMGYM		PTEMELIELS		QQINMNLGGH		VDFDDFVELM		GPKLLAETAD
MIGVKELRDA		FREFDTNGDG		EISTSELREA		MRKLLGHQVG		HRDIEEIIRD
VDLNGDGRVD		FEEFVRMMSR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, іоном магнію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних контактах, апараті гольджі, синапсах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Haynes L.P., Tepikin A.V., Burgoyne R.D. (2004). Calcium-binding protein 1 is an inhibitor of agonist-evoked, inositol 1,4,5-trisphosphate-mediated calcium signaling. J. Biol. Chem. 279: 547—555. PMID 14570872 DOI:10.1074/jbc.M309617200
• Zhou H., Yu K., McCoy K.L., Lee A. (2005). Molecular mechanism for divergent regulation of Cav1.2 Ca2+ channels by calmodulin and Ca2+-binding protein-1. J. Biol. Chem. 280: 29612—29619. PMID 15980432 DOI:10.1074/jbc.M504167200

Див. також

• Хромосома 12