CASKIN2

CASKIN2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2KE9, 4IS7
Ідентифікатори
Символи	CASKIN2, ANKS5B, CASK interacting protein 2
Зовнішні ІД	OMIM: 612185 MGI: 2157062 HomoloGene: 32485 GeneCards: CASKIN2
Онтологія гена Молекулярна функція • молекулярна функція Клітинна компонента • цитоплазма • мембрана Біологічний процес • GO:0022610 життєдіяльність Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57513	140721
Ensembl	ENSG00000177303	ENSMUSG00000034471
UniProt	Q8WXE0	Q8VHK1
RefSeq (мРНК)	NM_020753 NM_001142643	NM_080643
RefSeq (білок)	NP_001136115 NP_065804	NP_542374
Локус (UCSC)	Хр. 17: 75.5 – 75.52 Mb	Хр. 11: 115.69 – 115.7 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CASKIN2 (англ. CASK interacting protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 17-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 202 амінокислот, а молекулярна маса — 126 783.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGREQDLILA		VKNGDVTGVQ		KLVAKVKATK		TKLLGSTKRL		NVNYQDADGF
SALHHAALGG		SLELIALLLE		AQATVDIKDS		NGMRPLHYAA		WQGRLEPVRL
LLRASAAVNA		ASLDGQIPLH		LAAQYGHYEV		SEMLLQHQSN		PCLVNKAKKT
PLDLACEFGR		LKVAQLLLNS		HLCVALLEGE		AKDPCDPNYT		TPLHLAAKNG
HREVIRQLLR		AGIEINRQTK		TGTALHEAAL		YGKTEVVRLL		LEGGVDVNIR
NTYNQTALDI		VNQFTTSQAS		REIKQLLREA		SGILKVRALK		DFWNLHDPTA
LNVRAGDVIT		VLEQHPDGRW		KGHIHESQRG		TDRIGYFPPG		IVEVVSKRVG
IPAARLPSAP		TPLRPGFSRT		PQPPAEEPPH		PLTYSQLPRV		GLSPDSPAGD
RNSVGSEGSV		GSIRSAGSGQ		SSEGTNGHGP		GLLIENAQPL		PSAGEDQVLP
GLHPPSLADN		LSHRPLANCR		SGEQIFTQDV		RPEQLLEGKD		AQAIHNWLSE
FQLEGYTAHF		LQAGYDVPTI		SRMTPEDLTA		IGVTKPGHRK		KIASEIAQLS
IAEWLPSYIP		TDLLEWLCAL		GLPQYHKQLV		SSGYDSMGLV		ADLTWEELQE
IGVNKLGHQK		KLMLGVKRLA		ELRRGLLQGE		ALSEGGRRLA		KGPELMAIEG
LENGEGPATA		GPRLLTFQGS		ELSPELQAAM		AGGGPEPLPL		PPARSPSQES
IGARSRGSGH		SQEQPAPQPS		GGDPSPPQER		NLPEGTERPP		KLCSSLPGQG
PPPYVFMYPQ		GSPSSPAPGP		PPGAPWAFSY		LAGPPATPPD		PPRPKRRSHS
LSRPGPTEGD		AEGEAEGPVG		STLGSYATLT		RRPGRSALVR		TSPSVTPTPA
RGTPRSQSFA		LRARRKGPPP		PPPKRLSSVS		GPSPEPPPLD		ESPGPKEGAT
GPRRRTLSEP		AGPSEPPGPP		APAGPASDTE		EEEPGPEGTP		PSRGSSGEGL
PFAEEGNLTI		KQRPKPAGPP		PRETPVPPGL		DFNLTESDTV		KRRPKCRERE
PLQTALLAFG		VASATPGPAA		PLPSPTPGES		PPASSLPQPE		PSSLPAQGVP
TPLAPSPAMQ		PPVPPCPGPG		LESSAASRWN		GETEPPAAPA		ALLKVPGAGT
APKPVSVACT		QLAFSGPKLA		PRLGPRPVPP		PRPESTGTVG		PGQAQQRLEQ
TSSSLAAALR		AAEKSIGTKE		QEGTPSASTK		HILDDISTMF		DALADQLDAM
LD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Tabuchi K., Biederer T., Butz S., Suedhof T.C. (2002). CASK participates in alternative tripartite complexes in which Mint 1 competes for binding with Caskin 1, a novel CASK-binding protein. J. Neurosci. 22: 4264—4273. PMID 12040031

Див. також

• Хромосома 17