CLEC3B

CLEC3B
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1HTN, 1RJH, 1TN3, 3L9J
Ідентифікатори
Символи	CLEC3B, TN, TNA, C-type lectin domain family 3 member B
Зовнішні ІД	OMIM: 187520 MGI: 104540 HomoloGene: 31145 GeneCards: CLEC3B
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • heparin binding • kringle domain binding • carbohydrate binding Клітинна компонента • цитоплазма • GO:0005578 Позаклітинна матриця • екзосома • granular component • platelet dense granule lumen • міжклітинний простір • extracellular region • collagen-containing extracellular matrix Біологічний процес • cellular response to organic substance • bone mineralization • cellular response to transforming growth factor beta stimulus • positive regulation of plasminogen activation • осифікація • platelet degranulation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7123	21922
Ensembl	ENSG00000163815	ENSMUSG00000025784
UniProt	P05452	P43025 Q8CFZ6
RefSeq (мРНК)	NM_001308394 NM_003278	NM_011606
RefSeq (білок)	NP_001295323 NP_003269	NP_035736
Локус (UCSC)	Хр. 3: 45 – 45.04 Mb	Хр. 9: 122.98 – 122.99 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CLEC3B (англ. C-type lectin domain family 3 member B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 202 амінокислот, а молекулярна маса — 22 537.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MELWGAYLLL		CLFSLLTQVT		TEPPTQKPKK		IVNAKKDVVN		TKMFEELKSR
LDTLAQEVAL		LKEQQALQTV		CLKGTKVHMK		CFLAFTQTKT		FHEASEDCIS
RGGTLGTPQT		GSENDALYEY		LRQSVGNEAE		IWLGLNDMAA		EGTWVDMTGA
RIAYKNWETE		ITAQPDGGKT		ENCAVLSGAA		NGKWFDKRCR		DQLPYICQFG
IV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Білок має сайт для зв'язування з лектинами. Секретований назовні.

Література

• Berglund L., Petersen T.E. (1992). The gene structure of tetranectin, a plasminogen binding protein. FEBS Lett. 309: 15—19. PMID 1511740 DOI:10.1016/0014-5793(92)80729-Z
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Fuhlendorff J., Clemmensen I., Magnusson S. (1987). Primary structure of tetranectin, a plasminogen kringle 4 binding plasma protein: homology with asialoglycoprotein receptors and cartilage proteoglycan core protein. Biochemistry. 26: 6757—6764. PMID 3427041 DOI:10.1021/bi00395a027
• Wewer U.M., Albrechtsen R. (1992). Tetranectin, a plasminogen kringle 4-binding protein. Cloning and gene expression pattern in human colon cancer. Lab. Invest. 67: 253—262. PMID 1354271

Див. також

• Хромосома 3