CLEC5A

CLEC5A
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2YHF
Ідентифікатори
Символи	CLEC5A, CLECSF5, MDL-1, MDL1, C-type lectin domain family 5 member A, C-type lectin domain containing 5A
Зовнішні ІД	OMIM: 604987 MGI: 1345151 HomoloGene: 8302 GeneCards: CLEC5A
Онтологія гена Молекулярна функція • carbohydrate binding • virus receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • integral component of membrane • integral component of plasma membrane • мембрана • cell surface • specific granule membrane • tertiary granule membrane • гіалоплазма • клітинна мембрана Біологічний процес • cellular defense response • myeloid cell differentiation • negative regulation of myeloid cell apoptotic process • GO:0022415 viral process • GO:0072468 сигнальна трансдукція • процес імунної системи • viral entry into host cell • negative regulation of apoptotic process • osteoblast development • вроджений імунітет • neutrophil degranulation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23601	23845
Ensembl	ENSG00000258227	ENSMUSG00000029915
UniProt	Q9NY25	Q9R007
RefSeq (мРНК)	NM_001301167 NM_013252	NM_001038604 NM_021364
RefSeq (білок)	NP_001288096 NP_037384	NP_001033693 NP_067339
Локус (UCSC)	Хр. 7: 141.93 – 141.95 Mb	Хр. 6: 40.55 – 40.56 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CLEC5A (англ. C-type lectin domain containing 5A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 188 амінокислот, а молекулярна маса — 21 521.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNWHMIISGL		IVVVLKVVGM		TLFLLYFPQI		FNKSNDGFTT		TRSYGTVSQI
FGSSSPSPNG		FITTRSYGTV		CPKDWEFYQA		RCFFLSTSES		SWNESRDFCK
GKGSTLAIVN		TPEKLKFLQD		ITDAEKYFIG		LIYHREEKRW		RWINNSVFNG
NVTNQNQNFN		CATIGLTKTF		DAASCDISYR		RICEKNAK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з лектинами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Bakker A.B.H., Baker E., Sutherland G.R., Phillips J.H., Lanier L.L. (1999). Myeloid DAP12-associating lectin (MDL)-1 is a cell surface receptor involved in the activation of myeloid cells. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96: 9792—9796. PMID 10449773 DOI:10.1073/pnas.96.17.9792
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 7