CNOT4

CNOT4
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1E4U, 1UR6
Ідентифікатори
Символи	CNOT4, CLONE243, NOT4, NOT4H, CCR4-NOT transcription complex subunit 4
Зовнішні ІД	OMIM: 604911 MGI: 1859026 HomoloGene: 40870 GeneCards: CNOT4
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • зв'язування з іоном металу • transferase activity • RNA binding Клітинна компонента • гіалоплазма • цитоплазма • CCR4-NOT complex • клітинне ядро Біологічний процес • Убіквітин-залежний протеоліз • nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening • protein autoubiquitination • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay • ubiquitin-dependent protein catabolic process • regulation of megakaryocyte differentiation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4850	53621
Ensembl	ENSG00000080802	ENSMUSG00000038784
UniProt	O95628	Q8BT14
RefSeq (мРНК)	NM_001008225 NM_001190847 NM_001190848 NM_001190849 NM_001190850 NM_013316 NM_001393370 NM_001393371 NM_001393372 NM_001393373 NM_001393374 NM_001393375	NM_001164411 NM_001164412 NM_001164413 NM_001164414 NM_016877
RefSeq (білок)	NP_001008226 NP_001177776 NP_001177777 NP_001177778 NP_001177779 NP_037448	NP_001157883 NP_001157884 NP_001157885 NP_001157886 NP_058573
Локус (UCSC)	Хр. 7: 135.36 – 135.51 Mb	Хр. 6: 35 – 35.11 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CNOT4 (англ. CCR4-NOT transcription complex subunit 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 575 амінокислот, а молекулярна маса — 63 510.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSRSPDAKED		PVECPLCMEP		LEIDDINFFP		CTCGYQICRF		CWHRIRTDEN
GLCPACRKPY		PEDPAVYKPL		SQEELQRIKN		EKKQKQNERK		QKISENRKHL
ASVRVVQKNL		VFVVGLSQRL		ADPEVLKRPE		YFGKFGKIHK		VVINNSTSYA
GSQGPSASAY		VTYIRSEDAL		RAIQCVNNVV		VDGRTLKASL		GTTKYCSYFL
KNMQCPKPDC		MYLHELGDEA		ASFTKEEMQA		GKHQEYEQKL		LQELYKLNPN
FLQLSTGSVD		KNKNKVTPLQ		RYDTPIDKPS		DSLSIGNGDN		SQQISNSDTP
SPPPGLSKSN		PVIPISSSNH		SARSPFEGAV		TESQSLFSDN		FRHPNPIPSG
LPPFPSSPQT		SSDWPTAPEP		QSLFTSETIP		VSSSTDWQAA		FGFGSSKQPE
DDLGFDPFDV		TRKALADLIE		KELSVQDQPS		LSPTSLQNSS		SHTTTAKGPG
SGFLHPAAAT		NANSLNSTFS		VLPQRFPQFQ		QHRAVYNSFS		FPGQAARYPW
MAFPRNSIMH		LNHTANPTSN		SNFLDLNLPP		QHNTGLGGIP		VAGEEEVKVS
TMPLSTSSHS		LQQGQQPTSL		HTTVA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 7