COPA

COPA
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 5A1U, 5A1V, 5A1W, 5A1X, 5A1Y
Ідентифікатори
Символи	COPA, HEP-COP, AILJK, coatomer protein complex subunit alpha, alpha-COP, COPI coat complex subunit alpha
Зовнішні ІД	OMIM: 601924 MGI: 1334462 HomoloGene: 3218 GeneCards: COPA
Онтологія гена Молекулярна функція • hormone activity • structural molecule activity Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • комплекс Ґольджі • мембрана • Golgi membrane • COPI-coated vesicle membrane • transport vesicle • extracellular region • membrane coat • COPI vesicle coat • екзосома • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • endoplasmic reticulum membrane • міжклітинний простір Біологічний процес • retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum • pancreatic juice secretion • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport • protein transport • intracellular protein transport • intra-Golgi vesicle-mediated transport • vesicle-mediated transport • GO:0015915 транспорт • regulation of signaling receptor activity • GO:0072468 сигнальна трансдукція Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1314	12847
Ensembl	н/д	ENSMUSG00000026553
UniProt	P53621	Q8CIE6
RefSeq (мРНК)	NM_004371 NM_001098398	NM_009938
RefSeq (білок)	NP_001091868 NP_004362	NP_034068
Локус (UCSC)	н/д	Хр. 1: 171.91 – 171.95 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

COPA (англ. Coatomer protein complex subunit alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 224 амінокислот, а молекулярна маса — 138 346.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLTKFETKSA		RVKGLSFHPK		RPWILTSLHN		GVIQLWDYRM		CTLIDKFDEH
DGPVRGIDFH		KQQPLFVSGG		DDYKIKVWNY		KLRRCLFTLL		GHLDYIRTTF
FHHEYPWILS		ASDDQTIRVW		NWQSRTCVCV		LTGHNHYVMC		AQFHPTEDLV
VSASLDQTVR		VWDISGLRKK		NLSPGAVESD		VRGITGVDLF		GTTDAVVKHV
LEGHDRGVNW		AAFHPTMPLI		VSGADDRQVK		IWRMNESKAW		EVDTCRGHYN
NVSCAVFHPR		QELILSNSED		KSIRVWDMSK		RTGVQTFRRD		HDRFWVLAAH
PNLNLFAAGH		DGGMIVFKLE		RERPAYAVHG		NMLHYVKDRF		LRQLDFNSSK
DVAVMQLRSG		SKFPVFNMSY		NPAENAVLLC		TRASNLENST		YDLYTIPKDA
DSQNPDAPEG		KRSSGLTAVW		VARNRFAVLD		RMHSLLIKNL		KNEITKKVQV
PNCDEIFYAG		TGNLLLRDAD		SITLFDVQQK		RTLASVKISK		VKYVIWSADM
SHVALLAKHA		IVICNRKLDA		LCNIHENIRV		KSGAWDESGV		FIYTTSNHIK
YAVTTGDHGI		IRTLDLPIYV		TRVKGNNVYC		LDRECRPRVL		TIDPTEFKFK
LALINRKYDE		VLHMVRNAKL		VGQSIIAYLQ		KKGYPEVALH		FVKDEKTRFS
LALECGNIEI		ALEAAKALDD		KNCWEKLGEV		ALLQGNHQIV		EMCYQRTKNF
DKLSFLYLIT		GNLEKLRKMM		KIAEIRKDMS		GHYQNALYLG		DVSERVRILK
NCGQKSLAYL		TAATHGLDEE		AESLKETFDP		EKETIPDIDP		NAKLLQPPAP
IMPLDTNWPL		LTVSKGFFEG		TIASKGKGGA		LAADIDIDTV		GTEGWGEDAE
LQLDEDGFVE		ATEGLGDDAL		GKGQEEGGGW		DVEEDLELPP		ELDISPGAAG
GAEDGFFVPP		TKGTSPTQIW		CNNSQLPVDH		ILAGSFETAM		RLLHDQVGVI
QFGPYKQLFL		QTYARGRTTY		QALPCLPSMY		GYPNRNWKDA		GLKNGVPAVG
LKLNDLIQRL		QLCYQLTTVG		KFEEAVEKFR		SILLSVPLLV		VDNKQEIAEA
QQLITICREY		IVGLSVETER		KKLPKETLEQ		QKRICEMAAY		FTHSNLQPVH
MILVLRTALN		LFFKLKNFKT		AATFARRLLE		LGPKPEVAQQ		TRKILSACEK
NPTDAYQLNY		DMHNPFDICA		ASYRPIYRGK		PVEKCPLSGA		CYSPEFKGQI
CRVTTVTEIG		KDVIGLRISP		LQFR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до гормонів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, транспорт між ендоплазматичним ретикулумом і апаратом Гольджі. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, цитоплазматичних везикулах, апараті Гольджі. Також секретований назовні.

Література

• Chow V.T.K., Quek H.H. (1996). HEP-COP, a novel human gene whose product is highly homologous to the alpha-subunit of the yeast coatomer protein complex. Gene. 169: 223—227. PMID 8647451 DOI:10.1016/0378-1119(95)00738-5
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Chow V.T.K., Quek H.H. (1997). Alpha coat protein COPA (HEP-COP): presence of an Alu repeat in cDNA and identity of the amino terminus to xenin. Ann. Hum. Genet. 61: 369—373. PMID 9365789 DOI:10.1017/S0003480097006295
• Feurle G.E. (1998). Xenin -- a review. Peptides. 19: 609—615. PMID 9533652 DOI:10.1016/S0196-9781(97)00378-1
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Feurle G.E., Hamscher G., Kusiek R., Meyer H.E., Metzger J.W. (1992). Identification of xenin, a xenopsin-related peptide, in the human gastric mucosa and its effect on exocrine pancreatic secretion. J. Biol. Chem. 267: 22305—22309. PMID 1429581

Див. також

• Хромосома 1