HDAC7

HDAC7
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3C0Y, 3C0Z, 3C10, 3ZNR, 3ZNS
Ідентифікатори
Символи	HDAC7, HD7A, HDAC7A, HD7, histone deacetylase 7
Зовнішні ІД	OMIM: 606542 MGI: 1891835 HomoloGene: 9124 GeneCards: HDAC7
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння
Реагує на сполуку
belinostat, givinostat, panobinostat, quisinostat, romidepsin, trichostatin A
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • GO:0001106 transcription corepressor activity • protein kinase binding • 14-3-3 protein binding • hydrolase activity • protein kinase C binding • chromatin binding • histone deacetylase activity • NAD-dependent histone deacetylase activity (H3-K14 specific) • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • SUMO transferase activity Клітинна компонента • нуклеоплазма • цитоплазма • клітинне ядро • histone deacetylase complex • гіалоплазма Біологічний процес • transcription, DNA-templated • negative regulation of NIK/NF-kappaB signaling • positive regulation of cell migration involved in sprouting angiogenesis • cell-cell junction assembly • васкулогенез • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • histone H3 deacetylation • negative regulation of osteoblast differentiation • negative regulation of interleukin-2 production • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • histone deacetylation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • protein sumoylation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51564	56233
Ensembl	ENSG00000061273	ENSMUSG00000022475
UniProt	Q8WUI4	Q8C2B3
RefSeq (мРНК)	NM_001098416 NM_001308090 NM_015401 NM_016596 NM_001368046	NM_001204275 NM_001204276 NM_001204277 NM_001204278 NM_001204279 NM_001204280 NM_001204281 NM_019572 NM_001378971
RefSeq (білок)	NP_001091886 NP_001295019 NP_056216 NP_001354975	NP_001191204 NP_001191205 NP_001191206 NP_001191207 NP_001191208 NP_001191209 NP_001191210 NP_062518 NP_001365900
Локус (UCSC)	Хр. 12: 47.78 – 47.83 Mb	Хр. 15: 97.69 – 97.74 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HDAC7 (англ. Histone deacetylase 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 952 амінокислот, а молекулярна маса — 102 927.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDLRVGQRPP		VEPPPEPTLL		ALQRPQRLHH		HLFLAGLQQQ		RSVEPMRLSM
DTPMPELQVG		PQEQELRQLL		HKDKSKRSAV		ASSVVKQKLA		EVILKKQQAA
LERTVHPNSP		GIPYRTLEPL		ETEGATRSML		SSFLPPVPSL		PSDPPEHFPL
RKTVSEPNLK		LRYKPKKSLE		RRKNPLLRKE		SAPPSLRRRP		AETLGDSSPS
SSSTPASGCS		SPNDSEHGPN		PILGSEALLG		QRLRLQETSV		APFALPTVSL
LPAITLGLPA		PARADSDRRT		HPTLGPRGPI		LGSPHTPLFL		PHGLEPEAGG
TLPSRLQPIL		LLDPSGSHAP		LLTVPGLGPL		PFHFAQSLMT		TERLSGSGLH
WPLSRTRSEP		LPPSATAPPP		PGPMQPRLEQ		LKTHVQVIKR		SAKPSEKPRL
RQIPSAEDLE		TDGGGPGQVV		DDGLEHRELG		HGQPEARGPA		PLQQHPQVLL
WEQQRLAGRL		PRGSTGDTVL		LPLAQGGHRP		LSRAQSSPAA		PASLSAPEPA
SQARVLSSSE		TPARTLPFTT		GLIYDSVMLK		HQCSCGDNSR		HPEHAGRIQS
IWSRLQERGL		RSQCECLRGR		KASLEELQSV		HSERHVLLYG		TNPLSRLKLD
NGKLAGLLAQ		RMFVMLPCGG		VGVDTDTIWN		ELHSSNAARW		AAGSVTDLAF
KVASRELKNG		FAVVRPPGHH		ADHSTAMGFC		FFNSVAIACR		QLQQQSKASK
ILIVDWDVHH		GNGTQQTFYQ		DPSVLYISLH		RHDDGNFFPG		SGAVDEVGAG
SGEGFNVNVA		WAGGLDPPMG		DPEYLAAFRI		VVMPIAREFS		PDLVLVSAGF
DAAEGHPAPL		GGYHVSAKCF		GYMTQQLMNL		AGGAVVLALE		GGHDLTAICD
ASEACVAALL		GNRVDPLSEE		GWKQKPNLNA		IRSLEAVIRV		HSKYWGCMQR
LASCPDSWVP		RVPGADKEEV		EAVTALASLS		VGILAEDRPS		EQLVEEEEPM
NL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, гідролаз, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Lee H.-J., Chun M., Kandror K.V. (2001). Tip60 and HDAC7 interact with the endothelin receptor a and may be involved in downstream signaling. J. Biol. Chem. 276: 16597—16600. PMID 11262386 DOI:10.1074/jbc.C000909200
• Bryant H., Farrell P.J. (2002). Signal transduction and transcription factor modification during reactivation of Epstein-Barr virus from latency. J. Virol. 76: 10290—10298. PMID 12239305 DOI:10.1128/JVI.76.20.10290-10298.2002
• Xiao H., Chung J., Kao H.-Y., Yang Y.-C. (2003). Tip60 is a co-repressor for STAT3. J. Biol. Chem. 278: 11197—11204. PMID 12551922 DOI:10.1074/jbc.M210816200

Див. також

• Хромосома 12