HNRNPA1

HNRNPA1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1HA1, 1L3K, 1PGZ, 1PO6, 1U1K, 1U1L, 1U1M, 1U1N, 1U1O, 1U1P, 1U1Q, 1U1R, 1UP1, 2H4M, 2LYV, 2UP1, 4YOE
Ідентифікатори
Символи	HNRNPA1, ALS19, ALS20, HNRPA1, HNRPA1L3, IBMPFD3, hnRNP A1, hnRNP-A1, UP 1, heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1
Зовнішні ІД	OMIM: 164017 HomoloGene: 134664 GeneCards: HNRNPA1
Пов'язані генетичні захворювання
amyotrophic lateral sclerosis type 20
Онтологія гена Молекулярна функція • telomeric repeat-containing RNA binding • single-stranded DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • single-stranded RNA binding • G-rich strand telomeric DNA binding • nucleic acid binding • RNA binding • protein domain specific binding • pre-mRNA binding • miRNA binding • identical protein binding • mRNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • catalytic step 2 spliceosome • мембрана • нуклеоплазма • spliceosomal complex • екзосома • клітинне ядро • Рибонуклеопротеїни Біологічний процес • mRNA splicing, via spliceosome • mRNA transport • negative regulation of telomere maintenance via telomerase • RNA export from nucleus • mRNA processing • positive regulation of telomere maintenance via telomerase • nuclear export • GO:0022415 viral process • import into nucleus • Сплайсинг РНК • fibroblast growth factor receptor signaling pathway • cellular response to sodium arsenite • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • RNA metabolic process • cellular response to glucose starvation • GO:0015915 транспорт Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3178	29578
Ensembl	ENSG00000135486	ENSRNOG00000036839
UniProt	P09651	P04256
RefSeq (мРНК)	NM_002136 NM_031157	NM_017248 NM_001399274
RefSeq (білок)	NP_002127 NP_112420	NP_058944 NP_001386203
Локус (UCSC)	н/д	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HNRNPA1 (англ. Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 372 амінокислот, а молекулярна маса — 38 747.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSKSESPKEP		EQLRKLFIGG		LSFETTDESL		RSHFEQWGTL		TDCVVMRDPN
TKRSRGFGFV		TYATVEEVDA		AMNARPHKVD		GRVVEPKRAV		SREDSQRPGA
HLTVKKIFVG		GIKEDTEEHH		LRDYFEQYGK		IEVIEIMTDR		GSGKKRGFAF
VTFDDHDSVD		KIVIQKYHTV		NGHNCEVRKA		LSKQEMASAS		SSQRGRSGSG
NFGGGRGGGF		GGNDNFGRGG		NFSGRGGFGG		SRGGGGYGGS		GDGYNGFGND
GGYGGGGPGY		SGGSRGYGSG		GQGYGNQGSG		YGGSGSYDSY		NNGGGGGFGG
GSGSNFGGGG		SYNDFGNYNN		QSSNFGPMKG		GNFGGRSSGP		YGGGGQYFAK
PRNQGGYGGS		SSSSSYGSGR		RF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рибонуклеопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, транспорт, транспорт мРНК. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Siomi H., Dreyfuss G. (1995). A nuclear localization domain in the hnRNP A1 protein. J. Cell Biol. 129: 551—560. PMID 7730395 DOI:10.1083/jcb.129.3.551
• Michael W.M., Choi M., Dreyfuss G. (1995). A nuclear export signal in hnRNP A1: a signal-mediated, temperature-dependent nuclear protein export pathway. Cell. 83: 415—422. PMID 8521471 DOI:10.1016/0092-8674(95)90119-1
• Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088
• Ong S.E., Mittler G., Mann M. (2004). Identifying and quantifying in vivo methylation sites by heavy methyl SILAC. Nat. Methods. 1: 119—126. PMID 15782174 DOI:10.1038/nmeth715
• Paronetto M.P., Achsel T., Massiello A., Chalfant C.E., Sette C. (2007). The RNA-binding protein Sam68 modulates the alternative splicing of Bcl-x. J. Cell Biol. 176: 929—939. PMID 17371836 DOI:10.1083/jcb.200701005

Див. також

• Хромосома 12