KIRREL3

KIRREL3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2CRY
Ідентифікатори
Символи	KIRREL3, KIRRE, MRD4, NEPH2, PRO4502, kin of IRRE like 3 (Drosophila), Kin of IRRE-like protein 3, kirre like nephrin family adhesion molecule 3
Зовнішні ІД	OMIM: 607761 MGI: 1914953 HomoloGene: 57050 GeneCards: KIRREL3
Пов'язані генетичні захворювання
розлад дефіциту уваги та гіперактивності, conduct disorder
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • dendritic shaft • integral component of membrane • extracellular region • аксон • клітинна мембрана • мембрана • дендрит (нейробіологія) Біологічний процес • neuron projection morphogenesis • neuron migration • inter-male aggressive behavior • principal sensory nucleus of trigeminal nerve development • glomerulus morphogenesis • hippocampus development • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • synapse assembly • кровотворення Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	84623	67703
Ensembl	ENSG00000149571	ENSMUSG00000032036
UniProt	Q8IZU9	Q8BR86
RefSeq (мРНК)	NM_001161707 NM_001301097 NM_032531	NM_001190911 NM_001190912 NM_001190913 NM_001190914 NM_026324
RefSeq (білок)	NP_001155179 NP_001288026 NP_115920	NP_001177840 NP_001177841 NP_001177842 NP_001177843 NP_080600
Локус (UCSC)	Хр. 11: 126.42 – 127 Mb	Хр. 9: 34.49 – 35.04 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

KIRREL3 (англ. Kirre like nephrin family adhesion molecule 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 778 амінокислот, а молекулярна маса — 85 255.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKPFQLDLLF		VCFFLFSQEL		GLQKRGCCLV		LGYMAKDKFR		RMNEGQVYSF
SQQPQDQVVV		SGQPVTLLCA		IPEYDGFVLW		IKDGLALGVG		RDLSSYPQYL
VVGNHLSGEH		HLKILRAELQ		DDAVYECQAI		QAAIRSRPAR		LTVLVPPDDP
VILGGPVISL		RAGDPLNLTC		HADNAKPAAS		IIWLRKGEVI		NGATYSKTLL
RDGKRESIVS		TLFISPGDVE		NGQSIVCRAT		NKAIPGGKET		SVTIDIQHPP
LVNLSVEPQP		VLEDNVVTFH		CSAKANPAVT		QYRWAKRGQI		IKEASGEVYR
TTVDYTYFSE		PVSCEVTNAL		GSTNLSRTVD		VYFGPRMTTE		PQSLLVDLGS
DAIFSCAWTG		NPSLTIVWMK		RGSGVVLSNE		KTLTLKSVRQ		EDAGKYVCRA
VVPRVGAGER		EVTLTVNGPP		IISSTQTQHA		LHGEKGQIKC		FIRSTPPPDR
IAWSWKENVL		ESGTSGRYTV		ETISTEEGVI		STLTISNIVR		ADFQTIYNCT
AWNSFGSDTE		IIRLKEQGSE		MKSGAGLEAE		SVPMAVIIGV		AVGAGVAFLV
LMATIVAFCC		ARSQRNLKGV		VSAKNDIRVE		IVHKEPASGR		EGEEHSTIKQ
LMMDRGEFQQ		DSVLKQLEVL		KEEEKEFQNL		KDPTNGYYSV		NTFKEHHSTP
TISLSSCQPD		LRPAGKQRVP		TGMSFTNIYS		TLSGQGRLYD		YGQRFVLGMG
SSSIELCERE		FQRGSLSDSS		SFLDTQCDSS		VSSSGKQDGY		VQFDKASKAS
ASSSHHSQSS		SQNSDPSRPL		QRRMQTHV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

• Nagase T., Nakayama M., Nakajima D., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 8: 85—95. PMID 11347906 DOI:10.1093/dnares/8.2.85
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Durcan P.J., Conradie J.D., Van deVyver M., Myburgh K.H. (2014). Identification of novel Kirrel3 gene splice variants in adult human skeletal muscle. BMC Physiol. 14: 11—11. PMID 25488023 DOI:10.1186/s12899-014-0011-3

Див. також

• Хромосома 11