LGR6

LGR6
Ідентифікатори
Символи	LGR6, GPCR, VTS20631, leucine-rich repeat containing G protein-coupled receptor 6, leucine rich repeat containing G protein-coupled receptor 6
Зовнішні ІД	OMIM: 606653 MGI: 2441805 HomoloGene: 49680 GeneCards: LGR6
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • G protein-coupled receptor activity • transmembrane signaling receptor activity • signal transducer activity • protein-hormone receptor activity • heparin binding • Roundabout binding Клітинна компонента • integral component of membrane • везикула • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • trans-Golgi network membrane • мембрана • міжклітинний простір Біологічний процес • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • positive regulation of Wnt signaling pathway • G protein-coupled receptor signaling pathway • Wnt signaling pathway • GO:0072468 сигнальна трансдукція • positive regulation of cell migration • tissue regeneration • bone regeneration • axon guidance • negative chemotaxis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	59352	329252
Ensembl	ENSG00000133067	ENSMUSG00000042793
UniProt	Q9HBX8	Q3UVD5
RefSeq (мРНК)	NM_001017403 NM_001017404 NM_021636	NM_001033409
RefSeq (білок)	NP_001017403 NP_001017404 NP_067649	NP_001028581
Локус (UCSC)	Хр. 1: 202.19 – 202.32 Mb	Хр. 1: 134.91 – 135.03 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

LGR6 (англ. Leucine rich repeat containing G protein-coupled receptor 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 967 амінокислот, а молекулярна маса — 104 298.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPSPPGLRAL		WLCAALCASR		RAGGAPQPGP		GPTACPAPCH		CQEDGIMLSA
DCSELGLSAV		PGDLDPLTAY		LDLSMNNLTE		LQPGLFHHLR		FLEELRLSGN
HLSHIPGQAF		SGLYSLKILM		LQNNQLGGIP		AEALWELPSL		QSLRLDANLI
SLVPERSFEG		LSSLRHLWLD		DNALTEIPVR		ALNNLPALQA		MTLALNRISH
IPDYAFQNLT		SLVVLHLHNN		RIQHLGTHSF		EGLHNLETLD		LNYNKLQEFP
VAIRTLGRLQ		ELGFHNNNIK		AIPEKAFMGN		PLLQTIHFYD		NPIQFVGRSA
FQYLPKLHTL		SLNGAMDIQE		FPDLKGTTSL		EILTLTRAGI		RLLPSGMCQQ
LPRLRVLELS		HNQIEELPSL		HRCQKLEEIG		LQHNRIWEIG		ADTFSQLSSL
QALDLSWNAI		RSIHPEAFST		LHSLVKLDLT		DNQLTTLPLA		GLGGLMHLKL
KGNLALSQAF		SKDSFPKLRI		LEVPYAYQCC		PYGMCASFFK		ASGQWEAEDL
HLDDEESSKR		PLGLLARQAE		NHYDQDLDEL		QLEMEDSKPH		PSVQCSPTPG
PFKPCEYLFE		SWGIRLAVWA		IVLLSVLCNG		LVLLTVFAGG		PVPLPPVKFV
VGAIAGANTL		TGISCGLLAS		VDALTFGQFS		EYGARWETGL		GCRATGFLAV
LGSEASVLLL		TLAAVQCSVS		VSCVRAYGKS		PSLGSVRAGV		LGCLALAGLA
AALPLASVGE		YGASPLCLPY		APPEGQPAAL		GFTVALVMMN		SFCFLVVAGA
YIKLYCDLPR		GDFEAVWDCA		MVRHVAWLIF		ADGLLYCPVA		FLSFASMLGL
FPVTPEAVKS		VLLVVLPLPA		CLNPLLYLLF		NPHFRDDLRR		LRPRAGDSGP
LAYAAAGELE		KSSCDSTQAL		VAFSDVDLIL		EASEAGRPPG		LETYGFPSVT
LISCQQPGAP		RLEGSHCVEP		EGNHFGNPQP		SMDGELLLRA		EGSTPAGGGL
SGGGGFQPSG		LAFASHV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, білків внутрішньоклітинного сигналінгу. Задіяний у таких біологічних процесах як сигнальний шлях Wnt, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Takeda S., Kadowaki S., Haga T., Takaesu H., Mitaku S. (2002). Identification of G protein-coupled receptor genes from the human genome sequence. FEBS Lett. 520: 97—101. PMID 12044878 DOI:10.1016/S0014-5793(02)02775-8

Див. також

• Хромосома 1