LRRC7

LRRC7
Ідентифікатори
Символи	LRRC7, DENSIN, leucine rich repeat containing 7
Зовнішні ІД	OMIM: 614453 MGI: 2676665 HomoloGene: 10817 GeneCards: LRRC7
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння, Розщеплення піднебіння, артеріальна гіпертензія, розлад дефіциту уваги та гіперактивності
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ionotropic glutamate receptor binding Клітинна компонента • міжклітинні контакти • postsynaptic membrane • синапс • мембрана • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • extracellular region • specific granule lumen • цитоплазма • клітинна мембрана • neuron projection • cell-cell junction • ionotropic glutamate receptor complex • basolateral plasma membrane • axon initial segment • гіалоплазма Біологічний процес • neutrophil degranulation • GO:0072468 сигнальна трансдукція • positive regulation of neuron projection development • receptor clustering • establishment or maintenance of epithelial cell apical/basal polarity • receptor localization to synapse • cell-cell adhesion • neurotransmitter receptor transport, endosome to postsynaptic membrane • neurotransmitter receptor transport postsynaptic membrane to endosome • MAPK cascade • regulation of NMDA receptor activity Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57554	242274
Ensembl	ENSG00000033122	ENSMUSG00000028176
UniProt	Q96NW7	Q80TE7
RefSeq (мРНК)	NM_020794 NM_001330635 NM_001350216 NM_001366836 NM_001366837 NM_001366838 NM_001366839 NM_001366840 NM_001366841 NM_001366842 NM_001370785	NM_001081358 NM_001291452 NM_001291453 NM_001370781 NM_001370782
RefSeq (білок)	NP_001317564 NP_001337145 NP_001353765 NP_001353766 NP_001353767 NP_001353768 NP_001353769 NP_001353770 NP_001353771 NP_001357714	NP_001074827 NP_001278381 NP_001278382 NP_001357710 NP_001357711
Локус (UCSC)	Хр. 1: 69.57 – 70.15 Mb	Хр. 3: 157.79 – 158.27 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

LRRC7 (англ. Leucine rich repeat containing 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 537 амінокислот, а молекулярна маса — 172 581.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTTKRKIIGR		LVPCRCFRGE		EEIISVLDYS		HCSLQQVPKE		VFNFERTLEE
LYLDANQIEE		LPKQLFNCQA		LRKLSIPDND		LSNLPTTIAS		LVNLKELDIS
KNGVQEFPEN		IKCCKCLTII		EASVNPISKL		PDGFTQLLNL		TQLYLNDAFL
EFLPANFGRL		VKLRILELRE		NHLKTLPKSM		HKLAQLERLD		LGNNEFGELP
EVLDQIQNLR		ELWMDNNALQ		VLPGSIGKLK		MLVYLDMSKN		RIETVDMDIS
GCEALEDLLL		SSNMLQQLPD		SIGLLKKLTT		LKVDDNQLTM		LPNTIGNLSL
LEEFDCSCNE		LESLPSTIGY		LHSLRTLAVD		ENFLPELPRE		IGSCKNVTVM
SLRSNKLEFL		PEEIGQMQKL		RVLNLSDNRL		KNLPFSFTKL		KELAALWLSD
NQSKALIPLQ		TEAHPETKQR		VLTNYMFPQQ		PRGDEDFQSD		SDSFNPTLWE
EQRQQRMTVA		FEFEDKKEDD		ENAGKVKDLS		CQAPWERGQR		GITLQPARLS
GDCCTPWARC		DQQIQDMPVP		QNDPQLAWGC		ISGLQQERSM		CTPLPVAAQS
TTLPSLSGRQ		VEINLKRYPT		PYPEDLKNMV		KSVQNLVGKP		SHGVRVENSN
PTANTEQTVK		EKYEHKWPVA		PKEITVEDSF		VHPANEMRIG		ELHPSLAETP
LYPPKLVLLG		KDKKESTDES		EVDKTHCLNN		SVSSGTYSDY		SPSQASSGSS
NTRVKVGSLQ		TTAKDAVHNS		LWGNRIAPSF		PQPLDSKPLL		SQREAVPPGN
IPQRPDRLPM		SDTFTDNWTD		GSHYDNTGFV		AEETTAENAN		SNPLLSSKSR
STSSHGRRPL		IRQDRIVGVP		LELEQSTHRH		TPETEVPPSN		PWQNWTRTPS
PFEDRTAFPS		KLETTPTTSP		LPERKEHIKE		STEIPSPFSP		GVPWEYHDSN
PNRSLSNVFS		QIHCRPESSK		GVISISKSTE		RLSPLMKDIK		SNKFKKSQSI
DEIDIGTYKV		YNIPLENYAS		GSDHLGSHER		PDKMLGPEHG		MSSMSRSQSV
PMLDDEMLTY		GSSKGPQQQK		ASMTKKVYQF		DQSFNPQGSV		EVKAEKRIPP
PFQHNPEYVQ		QASKNIAKDL		ISPRAYRGYP		PMEQMFSFSQ		PSVNEDAVVN
AQFASQGARA		GFLRRADSLV		SATEMAMFRR		VNEPHELPPT		DRYGRPPYRG
GLDRQSSVTV		TESQFLKRNG		RYEDEHPSYQ		EVKAQAGSFP		VKNLTQRRPL
SARSYSTESY		GASQTRPVSA		RPTMAALLEK		IPSDYNLGNY		GDKPSDNSDL
KTRPTPVKGE		ESCGKMPADW		RQQLLRHIEA		RRLDRNAAYK		HNTVNLGMLP
YGGISAMHAG		RSMTLNLQTK		SKFDHQELPL		QKTPSQQSNI		LDNGQEDVSP
SGQWNPYPLG		RRDVPPDTIT		KKAGSHIQTL		MGSQSLQHRS		REQQPYEGNI
NKVTIQQFQS		PLPIQIPSSQ		ATRGPQPGRC		LIQTKGQRSM		DGYPEQFCVR
IEKNPGLGFS		ISGGISGQGN		PFKPSDKGIF		VTRVQPDGPA		SNLLQPGDKI
LQANGHSFVH		MEHEKAVLLL		KSFQNTVDLV		IQRELTV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних контактах, синапсах.

Література

• Izawa I., Nishizawa M., Ohtakara K., Inagaki M. (2002). Densin-180 interacts with delta-catenin/neural plakophilin-related armadillo repeat protein at synapses. J. Biol. Chem. 277: 5345—5350. PMID 11729199 DOI:10.1074/jbc.M110052200
• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65

Див. також

• Хромосома 1