LY96

LY96
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2E56, 2E59, 2Z65, 3FXI, 3ULA, 4G8A
Ідентифікатори
Символи	LY96, ESOP-1, MD-2, MD2, ly-96, lymphocyte antigen 96
Зовнішні ІД	OMIM: 605243 MGI: 1341909 HomoloGene: 9109 GeneCards: LY96
Онтологія гена Молекулярна функція • coreceptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • lipopolysaccharide immune receptor activity • lipopolysaccharide binding • Toll-like receptor 4 binding Клітинна компонента • intrinsic component of plasma membrane • клітинна мембрана • extracellular region • lipopolysaccharide receptor complex • endosome membrane • міжклітинний простір Біологічний процес • toll-like receptor 4 signaling pathway • процес імунної системи • MyD88-dependent toll-like receptor signaling pathway • positive regulation of lipopolysaccharide-mediated signaling pathway • TRIF-dependent toll-like receptor signaling pathway • cellular defense response • cell surface receptor signaling pathway • response to lipopolysaccharide • positive regulation of tumor necrosis factor production • inflammatory response • cellular response to lipopolysaccharide • detection of lipopolysaccharide • I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • MyD88-independent toll-like receptor signaling pathway • lipopolysaccharide-mediated signaling pathway • negative regulation of MyD88-independent toll-like receptor signaling pathway • вроджений імунітет • GO:0060554, GO:0060555 Некроптоз • apoptotic signaling pathway • toll-like receptor signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23643	17087
Ensembl	ENSG00000154589	ENSMUSG00000025779
UniProt	Q9Y6Y9	Q9JHF9
RefSeq (мРНК)	NM_001195797 NM_015364	NM_001159711 NM_016923
RefSeq (білок)	NP_001182726 NP_056179	NP_001153183 NP_058619
Локус (UCSC)	Хр. 8: 73.99 – 74.03 Mb	Хр. 1: 16.76 – 16.78 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

LY96 (англ. Lymphocyte antigen 96) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 160 амінокислот, а молекулярна маса — 18 546.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLPFLFFSTL		FSSIFTEAQK		QYWVCNSSDA		SISYTYCDKM		QYPISINVNP
CIELKRSKGL		LHIFYIPRRD		LKQLYFNLYI		TVNTMNLPKR		KEVICRGSDD
DYSFCRALKG		ETVNTTISFS		FKGIKFSKGK		YKCVVEAISG		SPEEMLFCLE
FVILHQPNSN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь, альтернативний сплайсинг. Секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• da Silva Correia J., Soldau K., Christen U., Tobias P.S., Ulevitch R.J. (2001). Lipopolysaccharide is in close proximity to each of the proteins in its membrane receptor complex. transfer from CD14 to TLR4 and MD-2. J. Biol. Chem. 276: 21129—21135. PMID 11274165 DOI:10.1074/jbc.M009164200
• Dziarski R., Wang Q., Miyake K., Kirschning C.J., Gupta D. (2001). MD-2 enables Toll-like receptor 2 (TLR2)-mediated responses to lipopolysaccharide and enhances TLR2-mediated responses to Gram-positive and Gram-negative bacteria and their cell wall components. J. Immunol. 166: 1938—1944. PMID 11160242 DOI:10.4049/jimmunol.166.3.1938
• Visintin A., Mazzoni A., Spitzer J.A., Segal D.M. (2001). Secreted MD-2 is a large polymeric protein that efficiently confers lipopolysaccharide sensitivity to Toll-like receptor 4. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98: 12156—12161. PMID 11593030 DOI:10.1073/pnas.211445098
• Ohto U., Fukase K., Miyake K., Satow Y. (2007). Crystal structures of human MD-2 and its complex with antiendotoxic lipid IVa. Science. 316: 1632—1634. PMID 17569869 DOI:10.1126/science.1139111
• Kato K., Morrison A.M., Nakano T., Tashiro K., Honjo T. (2000). ESOP-1, a secreted protein expressed in the hematopoietic, nervous, and reproductive systems of embryonic and adult mice. Blood. 96: 362—364. PMID 10891475

Див. також

• Хромосома 8